Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002632.6

Sequence Length

1740 nt

GC Content

0.6305

AGAAGGGAGCUGCUGUCUGCGGAGGAAACUGCAUCGACGGACGGCCGCCCAGCUACGGGAGGACCUGGAGUGGCACUGGGCGCCCGACGGACCAUCCCCGGGACCCGCCUGCCCCUCGGCGCCCCGCCCCGCCGGGCCGCUCCCCGUCGGGUUCCCCAGCCACAGCCUUACCUACGGGCUCCUGACUCCGCAAGGCUUCCAGAAGAUGCUCGAACCACCGGCCGGGGCCUCGGGGCAGCAGUGAGGGAGGCGUCCAGCCCCCCACUCAGCUCUUCUCCUCCUGUGCCAGGGGCUCCCCGGGGGAUGAGCAUGGUGGUUUUCCCUCGGAGCCCCCUGGCUCGGGACGUCUGAGAAGAUGCCGGUCAUGAGGCUGUUCCCUUGCUUCCUGCAGCUCCUGGCCGGGCUGGCGCUGCCUGCUGUGCCCCCCCAGCAGUGGGCCUUGUCUGCUGGGAACGGCUCGUCAGAGGUGGAAGUGGUACCCUUCCAGGAAGUGUGGGGCCGCAGCUACUGCCGGGCGCUGGAGAGGCUGGUGGACGUCGUGUCCGAGUACCCCAGCGAGGUGGAGCACAUGUUCAGCCCAUCCUGUGUCUCCCUGCUGCGCUGCACCGGCUGCUGCGGCGAUGAGAAUCUGCACUGUGUGCCGGUGGAGACGGCCAAUGUCACCAUGCAGCUCCUAAAGAUCCGUUCUGGGGACCGGCCCUCCUACGUGGAGCUGACGUUCUCUCAGCACGUUCGCUGCGAAUGCCGGCCUCUGCGGGAGAAGAUGAAGCCGGAAAGGAGGAGACCCAAGGGCAGGGGGAAGAGGAGGAGAGAGAAGCAGAGACCCACAGACUGCCACCUGUGCGGCGAUGCUGUUCCCCGGAGGUAACCCACCCCUUGGAGGAGAGAGACCCCGCACCCGGCUCGUGUAUUUAUUACCGUCACACUCUUCAGUGACUCCUGCUGGUACCUGCCCUCUAUUUAUUAGCCAACUGUUUCCCUGCUGAAUGCCUCGCUCCCUUCAAGACGAGGGGCAGGGAAGGACAGGACCCUCAGGAAUUCAGUGCCUUCAACAACGUGAGAGAAAGAGAGAAGCCAGCCACAGACCCCUGGGAGCUUCCGCUUUGAAAGAAGCAAGACACGUGGCCUCGUGAGGGGCAAGCUAGGCCCCAGAGGCCCUGGAGGUCUCCAGGGGCCUGCAGAAGGAAAGAAGGGGGCCCUGCUACCUGUUCUUGGGCCUCAGGCUCUGCACAGACAAGCAGCCCUUGCUUUCGGAGCUCCUGUCCAAAGUAGGGAUGCGGAUCCUGCUGGGGCCGCCACGGCCUGGCUGGUGGGAAGGCCGGCAGCGGGCGGAGGGGAUCCAGCCACUUCCCCCUCUUCUUCUGAAGAUCAGAACAUUCAGCUCUGGAGAACAGUGGUUGCCUGGGGGCUUUUGCCACUCCUUGUCCCCCGUGAUCUCCCCUCACACUUUGCCAUUUGCUUGUACUGGGACAUUGUUCUUUCCGGCCAAGGUGCCACCACCCUGCCCCCCCUAAGAGACACAUACAGAGUGGGCCCCGGGCUGGAGAAAGAGCUGCCUGGAUGAGAAACAGCUCAGCCAGUGGGGAUGAGGUCACCAGGGGAGGAGCCUGUGCGUCCCAGCUGAAGGCAGUGGCAGGGGAGCAGGUUCCCCAAGGGCCCUGGCACCCCCACAAGCUGUCCCUGCAGGGCCAUCUGACUGCCAAGCCAGAUUCUCUUGAAUAAAGUAUUCUAGUGUGGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-767.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -799.55

Frequency: 0.0000

Diversity: 516.30

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((..(((.((((((((((((((......)))))..))))).))))..)))..)).((((((((.((((..((((((((((.(((((((((.........(((...((((........)))).)))((((....))))......)))))))))..)))))......((((..((.((((((((((.........((.(((.((......)).)))))(((..((((((((((((((((((((((.(((.(((.....))))))))))....(((((((((((((.((((((((((((..((((((.((.((...)).)).)))))))))).)))))))).))))).)...)))))))((((..((((((((((.....(((((((((((((..((((((..(((.((.((((((((.(((.(((..((((((((..........))))))))...)))....)))))))...)))).)))))..))))))..))))))((((((((....(((((((((.(((((.(((((.((((.(((....))))).))))))).((((((.((.........))))).)))...))))).....))))....))))).))))))))(((....))).((((((.((((((((((.((((.....)))).))......((((...(((.....))))))))))))).((((..((((((((((.(((((...((((......)))).))))).))).)))))))))))...((((.(((((...((.((...((((((((..(((..(......((.(.(((.((((..(.(((((((........))))).)))..)))).)))))).....)..)))..))))))).)........))))....)))))))))(((.....))).(((((........)))))(((((..(((.((((.((((((.....))).........((((((((.....(((((((.......)).)))))))))))))))).)))))))..))))))).)))))).((((......))))..((((.(.(((((...((.(((....))))).)))))).)))).....)))))))......))))))))))..)))).)))..))))).)))))))))).)))...)))))))))).)))))).......(((((((..............))))))).(((((((((..((((.((...(((((((((.(((.......)))))))))))).((.((....(((((((((((((((.((((.((((.(((.....))).))))(((.(((((((......)).))))))))(((((....))))).........((((((..(((..((((.((...)).((((((....))).)))(((.(((((.((((((((.((((((.((..((..(((.(((((.(((((.((..(((((((((((((..((.(((..(((.(((....................))).))))))))..)))))))..)))))))))))))))))))))..))..))...))))))..))))))))..))))).))).))))...))).)))))))))).))))).(((((......)))))...))))))))))...)).)).))))))..))))))))).......)))))..)))).)))))))).........(((((...))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

....(((,((,(((((((((((.{....,},).}}),)))})))).}),,..,((((((.((((..(((((((((..((((.((((..{(,,,((({(({{{..((((((((..{,((((..((((((..(((((((((,.{{{{{.{(((.{(({{,{{,....((((..{(.((((((((((...,,,...(({(((.,,..,..|}},|,.,,,((,,((((((((((((((((((((((.(((.(((.....))))))))))...((((((((((((((.((((((((((({.,((((((.((,(,...,},)).))))))))))))))))))).)))))(((((....)))))(((({({.(.((((((,(((,{((((((((((,({{({(({.{{{||||{{{,,,,,,.,|}|||..((((((((..........))))))))...)))})),)))}}.}|((((.{....})))))))))))),.))))..)))))).}}))))).((((((.{.,(((,,{((((,....))))}}}).}})))))}.(((,((((....)))).)))..{{{{.{.((((((((((.,((({(((((((,((,{{{{{(((....))).)),,.))}.)))))|((.((((.....}))).)),,)))))((((..{{{.....))),)))){(({{.((((..((((((((((.(((((...((((......)))).))))).)))}}))))))))))........}))))...{{.{|...|||..,}))))))))}}.}))}((.{.({,.((((..(.(((((((........))))).)))..)))).}))}))((.(({.....}))))..))}))))}).,.{{||.{{{..||||{({((..........(((((........)))))(((((..(((.((((,(({{,,.....|||........{((((((((.....((((({(,......,),)))))))))))))))).)))))))..)))))..{{,,|.,,{{{,......}))}.,.....|.(((((...((.(((....))))).)))))}(((((....)))))...})))).)))),,))).))))}..))}..))))).)))))))))).))).,,)))))))))).}},)))...|..|||||||{{(({..{{{{.,..(((((...))))).|.})))...})))),(((((((((.(((.,....})))))))))))).,||||},||}}.})))},,}}..})))))))).))))))...)))))..)))))))).|||||..,,,,,,{,}}}}},{(({,..{{|||,,.,|||...,,,,}.,}})).),..}))))))},,)))).)))).)))))))))..))))))))))...},}}.{((((((.((((({{{((((.,,(((((((...(((((((((((((..((.((,.,(((.(((....................))).))))))))..))))))),.,)))))..,(({{.{{{{...,,,|||}.||}}{|{,{{,...}}}.}||,,}}..}}}))))),.))))))).,,.)))))))))))((((({....})))))...(((((({,((....,{,....}),...)))))))))(((((.((....)).)))))......(((({...})))).)))))))...