Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002652.3
Sequence Length
578 nt
GC Content
0.4481
ACCACUUCUCUGGGACACAUUGCCUUCUGUUUUCUCCAGCAUGCGCUUGCUCCAGCUCCUGUUCAGGGCCAGCCCUGCCACCCUGCUCCUGGUUCUCUGCCUGCAGUUGGGGGCCAACAAAGCUCAGGACAACACUCGGAAGAUCAUAAUAAAGAAUUUUGACAUUCCCAAGUCAGUACGUCCAAAUGACGAAGUCACUGCAGUGCUUGCAGUUCAAACAGAAUUGAAAGAAUGCAUGGUGGUUAAAACUUACCUCAUUAGCAGCAUCCCUCUACAAGGUGCAUUUAACUAUAAGUAUACUGCCUGCCUAUGUGACGACAAUCCAAAAACCUUCUACUGGGACUUUUACACCAACAGAACUGUGCAAAUUGCAGCCGUCGUUGAUGUUAUUCGGGAAUUAGGCAUCUGCCCUGAUGAUGCUGCUGUAAUCCCCAUCAAAAACAACCGGUUUUAUACUAUUGAAAUCCUAAAGGUAGAAUAAUGGAAGCCCUGUCUGUUUGCCACACCCAGGUGAUUUCCUCUAAAGAAACUUGGCUGGAAUUUCUGCUGUGGUCUAUAAAAUAAACUUCUUAACAUGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-136.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -148.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 165.52
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((......)))((((....((.(((((((((..(((.((((((((.((((.(((....)))..)))).)))...(((.(((.(((.(.(((.....))).).))).)))))).......(((((((((...(((.((((..(((.(((.....))).)))..))))..))).....((((.....))))..))).))).))).(((.((((((.....)))))).)))...))))).)))..)))))((((((...((((((((((....(((((((((((....(((...)))....)))..)))).))))...............(((......)))......(((.((((.((....((((...))))....)))))).)))...(((((...(((....))).))))).)))))))))).....................(((((((......)))))))....))))))......))))))..))))(((..((((((..((((....((((.((((......))))..))))..)))).))))))..)))....................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(({......}||({,,...,({{(({{(((((..(((.(((((({{,{{{,,{{{,..{|||,,(((|.,,},,,(((.(((.(((.{.(((.....))).}.))).)))))).......}}}},||||.,,{{{.((((..(((.{((.....))}.)))..))))..}}}..,,.{|||.....|||}..}}}|||{{{|,.{|}}|||(((,....}}}))),,,,..,))))).)))..})))).,{{,,...((((((((((..,,,{{{(((((((....{({...)))....)))..)))).}))}|,{,,..........{{{,,,..,||}......{{{.|{{{.||.,.,((({...})))...,)))))).))}...,,}}}.{{((({{....)})))))})))))))))).....................(((((((......)))))))....}))})},..,,,}||||}..}}},{((..((((((..((((.{{{((({.((((......))))..))))}})))).))))))..}},....................
Back