Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002654.6

Sequence Length

2305 nt

GC Content

0.5662

GCACAGCAGCUGCACGCGCCGUGGCUCCGGAUCUCUUCGUCUUUGCAGCGUAGCCCGAGUCGGUCAGCGCCGGAGGACCUCAGCAGCCAUGUCGAAGCCCCAUAGUGAAGCCGGGACUGCCUUCAUUCAGACCCAGCAGCUGCACGCAGCCAUGGCUGACACAUUCCUGGAGCACAUGUGCCGCCUGGACAUUGAUUCACCACCCAUCACAGCCCGGAACACUGGCAUCAUCUGUACCAUUGGCCCAGCUUCCCGAUCAGUGGAGACGUUGAAGGAGAUGAUUAAGUCUGGAAUGAAUGUGGCUCGUCUGAACUUCUCUCAUGGAACUCAUGAGUACCAUGCGGAGACCAUCAAGAAUGUGCGCACAGCCACGGAAAGCUUUGCUUCUGACCCCAUCCUCUACCGGCCCGUUGCUGUGGCUCUAGACACUAAAGGACCUGAGAUCCGAACUGGGCUCAUCAAGGGCAGCGGCACUGCAGAGGUGGAGCUGAAGAAGGGAGCCACUCUCAAAAUCACGCUGGAUAACGCCUACAUGGAAAAGUGUGACGAGAACAUCCUGUGGCUGGACUACAAGAACAUCUGCAAGGUGGUGGAAGUGGGCAGCAAGAUCUACGUGGAUGAUGGGCUUAUUUCUCUCCAGGUGAAGCAGAAAGGUGCCGACUUCCUGGUGACGGAGGUGGAAAAUGGUGGCUCCUUGGGCAGCAAGAAGGGUGUGAACCUUCCUGGGGCUGCUGUGGACUUGCCUGCUGUGUCGGAGAAGGACAUCCAGGAUCUGAAGUUUGGGGUCGAGCAGGAUGUUGAUAUGGUGUUUGCGUCAUUCAUCCGCAAGGCAUCUGAUGUCCAUGAAGUUAGGAAGGUCCUGGGAGAGAAGGGAAAGAACAUCAAGAUUAUCAGCAAAAUCGAGAAUCAUGAGGGGGUUCGGAGGUUUGAUGAAAUCCUGGAGGCCAGUGAUGGGAUCAUGGUGGCUCGUGGUGAUCUAGGCAUUGAGAUUCCUGCAGAGAAGGUCUUCCUUGCUCAGAAGAUGAUGAUUGGACGGUGCAACCGAGCUGGGAAGCCUGUCAUCUGUGCUACUCAGAUGCUGGAGAGCAUGAUCAAGAAGCCCCGCCCCACUCGGGCUGAAGGCAGUGAUGUGGCCAAUGCAGUCCUGGAUGGAGCCGACUGCAUCAUGCUGUCUGGAGAAACAGCCAAAGGGGACUAUCCUCUGGAGGCUGUGCGCAUGCAGCACCUGAUUGCCCGUGAGGCAGAGGCUGCCAUCUACCACUUGCAAUUAUUUGAGGAACUCCGCCGCCUGGCGCCCAUUACCAGCGACCCCACAGAAGCCACCGCCGUGGGUGCCGUGGAGGCCUCCUUCAAGUGCUGCAGUGGGGCCAUAAUCGUCCUCACCAAGUCUGGCAGGUCUGCUCACCAGGUGGCCAGAUACCGCCCACGUGCCCCCAUCAUUGCUGUGACCCGGAAUCCCCAGACAGCUCGUCAGGCCCACCUGUACCGUGGCAUCUUCCCUGUGCUGUGCAAGGACCCAGUCCAGGAGGCCUGGGCUGAGGACGUGGACCUCCGGGUGAACUUUGCCAUGAAUGUUGGCAAGGCCCGAGGCUUCUUCAAGAAGGGAGAUGUGGUCAUUGUGCUGACCGGAUGGCGCCCUGGCUCCGGCUUCACCAACACCAUGCGUGUUGUUCCUGUGCCGUGAUGGACCCCAGAGCCCCUCCUCCAGCCCCUGUCCCACCCCCUUCCCCCAGCCCAUCCAUUAGGCCAGCAACGCUUGUAGAACUCACUCUGGGCUGUAACGUGGCACUGGUAGGUUGGGACACCAGGGAAGAAGAUCAACGCCUCACUGAAACAUGGCUGUGUUUGCAGCCUGCUCUAGUGGGACAGCCCAGAGCCUGGCUGCCCAUCAUGUGGCCCCACCCAAUCAAGGGAAGAAGGAGGAAUGCUGGACUGGAGGCCCCUGGAGCCAGAUGGCAAGAGGGUGACAGCUUCCUUUCCUGUGUGUACUCUGUCCAGUUCCUUUAGAAAAAAUGGAUGCCCAGAGGACUCCCAACCCUGGCUUGGGGUCAAGAAACAGCCAGCAAGAGUUAGGGGCCUUAGGGCACUGGGCUGUUGUUCCAUUGAAGCCGACUCUGGCCCUGGCCCUUACUUGCUUCUCUAGCUCUCUAGGCCUCUCCAGUUUGCACCUGUCCCCACCCUCCACUCAGCUGUCCUGCAGCAAACACUCCACCCUCCACCUUCCAUUUUCCCCCACUACUGCAGCACCUCCAGGCCUGUUGCUAUAGAGCCUACCUGUAUGUCAAUAAACAACAGCUGAAGCACC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-852.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -895.88

Frequency: 0.0000

Diversity: 438.47

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((.((((((..(((.((.((((((((((((((....((((((((.((((((..(((..(((((..(((((((.((((......((((((((..................((.(((.(((........))).))).)).((((....))))))))))))......))))((.(((.((((((((((.((.(..((((.........))))..))).)).....))))).))).))).))..))))...)))..)))))..).))..))))))..))))))))....))))))).....((((((.(((((((...((((((((((.(((....))).))))).)))))...)).)).))).)).)))))))))))...))..)))..)))...((((..((((((...((((((((((((((((.............(((((((.((......)).)).)).))).((((..((((.....))))..))))......))))))))((((....(((((((........((.....))...))))))).)))).((((.(((((.((..((...))..)).))))).))))..((((((.((((.(....(((((.((((.((.(((.....))))))))).)).....)))..).)))).)))))).)))))))).))))))..)))).(((((....(((((((...(((((....)))))(((((((.((((((((((((.((((((..((.......((((((((((.((((...(((((....))))).)))).)))....((((((((((.........))))).))))).)))))))))..)).)))).))))))((((.(((((.((((......(((.((((.((.........)).)))).)))((((((..(((((((((........(((.(((.((((((..(((....(((((.((((.((..(((.((((..(((...(((.......)))..)))..)))).)))..)).))))..(((((((((((....(((((((.(((((.((((((.......))))))).(((((((..((....(((((...((((.....))))......((((((.(((((((((((((((..((......))))))))))...(((((((((.((.((((((..((((((...))))))...)))))).....((((((((.(((((((..(((.(((((...)))))......)))..)))))))...((((..((((((.....(((((((((.....(((................))).))))))))))))))).))))......))))))))((((((.(......).))))))...(((((((...((((.....))))..))))))).(((..((((.((..........))))))...)))..)).)))))))))..((((((....)))).))..)))).(((((((((.(.(((...(.(.(((((((((((...))))))))).)).).)(((((((.(((....((((((((.......))))))))))))))).))).....((((((.(.((.((.((..(.((((...(((.((.((.(((((((((((.....((((((.....)))))).......)))).)).)....)))).)))).)))..)))))..)).)))).))))))).(((((((...(((....((((...(((((..((((......))))))).))....))))..)))..)))))))))))))))))))).......))).)))))).....(((((((.(((((((((.(((((...(((....))))))))..))))))........(((((((((((......))).....((((..((((.(((..((((((((((...(((....)))...)))).....))))))..))).))))...))))(((((................)))))(((.((.((........))))))).))))))))))).)))))))....((((.(((((((..(((((..(.((((.............)))).).....)))))))))))))))))))))))..))))))))))).)).)))))))))))).))))))))).)))..))).))).))).)))))))).))))))))))....)))).))))).)))).....)))))).)))))))..)))))))...)))))...((((.(((......))))))))))..))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((.,,,((({{({,.{{.((((((((((((((.,..((((((((.((((((..(((..(((((..(((((((,((((......((((((((.....{{....,,{{...((.(((.(((........))).))).)).||||...,),)}))))))))......))))((.(((.(((((((({(,((.(..((((.........))))..),)})).....))))).))).))).))..))))...)))..)))))..).))..))))))..))))))))..,.))))))).....((((((.(((((((...((((((((((.(((....))).))))).)))))...)),})},)).)).)))))))))))...)}..||||{|,|...((((..((((((...((((((((((((((((...,.,.......((((((,{((.....})),)),}}.,)),((({..{{{{.....)))),.))))......)))}))))((((....(((((((........{{.....)}...))))))).)))).({{(,(((((.((..{{...,}..}}.}}))}.))))..((((((.((((.(....{{(((.((((.((.{{{.....})))))))).))}..,.,....).)))).)))))).)))))))).))))))..}})),(((((..,.(((((({.{.(((((....)))))(((((((.((((((((((({.((((((.,{(.{,,...{((((((({{{((((...,,,|{}}}}),,}}.))))|))|....((((((((((.........)))))}})))).}))}))),},.)),}))).})))))((((.(((((.((({.{....(((.((({.((.........)).}))).)))((((((..(((((((((........(((.(((.((((((.{(({....(((((.((((.((..(((.((((..((({..(((.......)))}}}))..)))).)))..)).))))..((((((((((,...,(((((((.((({{.((((((.......))))))},(((((((..(,...,({(((,,.((((.....)))).,..,,((((((.(((((((((((((((..((......))))))))))...(((((((((.({.((((((..((((((...))))))...)))))){.(((.,(((...}}}..}))..((((((((((..((((({.,..,{{{.{(((..{(((((((((.,,{{(({.{,,(((((((((.....(({...........},...})}.))))))))))})),)},.)))}})))))).))))|||((({,......),))}}}}...|..}))))).))))))})){{,((((|,.,....,)}}}}},)),,{,..((((....))))...))..}).)))))))))..((((((....)))).))..)))).(((((((((,(.{{{....,,.(((((((((((...))))))))).)).},.(({((({{(((,...((((((((.......))))))))))))))),},).....((((((.(.((.((.((..(.((((...(((.((.((.((((,((((((..,,.((((((.....)))))).....,.)))).}}.)},..)))).)))).)))..)))))..)).))))}})))))).(((((((.,.(((..,,((((,..(((((,.{(((......))))))).))....)))).,)))}.))))))),))}))))))))).......))).)))))).....{((((((.,,,((((((.(((({..,(((....))))))))..))))))........(((((((({((......|||,.,,.((((..((((.(((..((((((((((...(((....)))...)))).....))))))..))).))))...)))),||,,.,|||,|,.,,.....}))},{{({((.((........))))))}.)))))))).}}.)))))))|,,,({{,{(((((((..(((((..{.((((..,,.........)))).}.....)))))))))))))))))))))))..))))))))))).)).)))))))))))).))))))))).)))..))}}))).))).)))))))).))))))))))}..,)))).))))).)))).....)))))).)))))))..))))))),..)))))...|{{{.{{{......})}}))))))..))...