Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002659.4
Sequence Length
1368 nt
GC Content
0.5592
AGGAGAGAAGACGUGCAGGGACCCCGCGCACAGGAGCUGCCCUCGCGACAUGGGUCACCCGCCGCUGCUGCCGCUGCUGCUGCUGCUCCACACCUGCGUCCCAGCCUCUUGGGGCCUGCGGUGCAUGCAGUGUAAGACCAACGGGGAUUGCCGUGUGGAAGAGUGCGCCCUGGGACAGGACCUCUGCAGGACCACGAUCGUGCGCUUGUGGGAAGAAGGAGAAGAGCUGGAGCUGGUGGAGAAAAGCUGUACCCACUCAGAGAAGACCAACAGGACCCUGAGCUAUCGGACUGGCUUGAAGAUCACCAGCCUUACCGAGGUUGUGUGUGGGUUAGACUUGUGCAACCAGGGCAACUCUGGCCGGGCUGUCACCUAUUCCCGAAGCCGUUACCUCGAAUGCAUUUCCUGUGGCUCAUCAGACAUGAGCUGUGAGAGGGGCCGGCACCAGAGCCUGCAGUGCCGCAGCCCUGAAGAACAGUGCCUGGAUGUGGUGACCCACUGGAUCCAGGAAGGUGAAGAAGGGCGUCCAAAGGAUGACCGCCACCUCCGUGGCUGUGGCUACCUUCCCGGCUGCCCGGGCUCCAAUGGUUUCCACAACAACGACACCUUCCACUUCCUGAAAUGCUGCAACACCACCAAAUGCAACGAGGGCCCAAUCCUGGAGCUUGAAAAUCUGCCGCAGAAUGGCCGCCAGUGUUACAGCUGCAAGGGGAACAGCACCCAUGGAUGCUCCUCUGAAGAGACUUUCCUCAUUGACUGCCGAGGCCCCAUGAAUCAAUGUCUGGUAGCCACCGGCACUCACGAACCGAAAAACCAAAGCUAUAUGGUAAGAGGCUGUGCAACCGCCUCAAUGUGCCAACAUGCCCACCUGGGUGACGCCUUCAGCAUGAACCACAUUGAUGUCUCCUGCUGUACUAAAAGUGGCUGUAACCACCCAGACCUGGAUGUCCAGUACCGCAGUGGGGCUGCUCCUCAGCCUGGCCCUGCCCAUCUCAGCCUCACCAUCACCCUGCUAAUGACUGCCAGACUGUGGGGAGGCACUCUCCUCUGGACCUAAACCUGAAAUCCCCCUCUCUGCCCUGGCUGGAUCCGGGGGACCCCUUUGCCCUUCCCUCGGCUCCCAGCCCUACAGACUUGCUGUGUGACCUCAGGCCAGUGUGCCGACCUCUCUGGGCCUCAGUUUUCCCAGCUAUGAAAACAGCUAUCUCACAAAGUUGUGUGAAGCAGAAGAGAAAAGCUGGAGGAAGGCCGUGGGCCAAUGGGAGAGCUCUUGUUAUUAUUAAUAUUGUUGCCGCUGUUGUGUUGUUGUUAUUAAUUAAUAUUCAUAUUAUUUAUUUUAUACUUACAUAAAGAUUUUGUACCAGUGGA

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-474.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -500.78
Frequency: 0.0000
Diversity: 343.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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