Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002743.3
Sequence Length
2079 nt
GC Content
0.6065
CAGGAACCGCGGCUGCUGGACAAGAGGGGUGCGGUGGAUACUGACCUUUGCUCCGGCCUCGUCGUGAAGACACAGCGCAUCUCCCCGCUGUAGGCUUCCUCCCACAGAACCCGUUUCGGGCCUCAGAGCGUCUGGUGAGAUGCUGUUGCCGCUGCUGCUGCUGCUACCCAUGUGCUGGGCCGUGGAGGUCAAGAGGCCCCGGGGCGUCUCCCUCACCAAUCAUCACUUCUACGAUGAGUCCAAGCCUUUCACCUGCCUGGACGGUUCGGCCACCAUCCCAUUUGAUCAGGUCAACGAUGACUAUUGCGACUGCAAAGAUGGCUCUGACGAGCCAGGCACGGCUGCCUGUCCUAAUGGCAGCUUCCACUGCACCAACACUGGCUAUAAGCCCCUGUAUAUCCCCUCCAACCGGGUCAACGAUGGUGUUUGUGACUGCUGCGAUGGAACAGACGAGUACAACAGCGGCGUCAUCUGUGAGAACACCUGCAAAGAGAAGGGCCGUAAGGAGAGAGAGUCCCUGCAGCAGAUGGCCGAGGUCACCCGCGAAGGGUUCCGUCUGAAGAAGAUCCUUAUUGAGGACUGGAAGAAGGCACGGGAGGAGAAGCAGAAAAAGCUCAUUGAGCUACAGGCUGGGAAGAAGUCUCUGGAAGACCAGGUGGAGAUGCUGCGGACAGUGAAGGAGGAAGCUGAGAAGCCAGAGAGAGAGGCCAAAGAGCAGCACCAGAAGCUGUGGGAAGAGCAGCUGGCUGCUGCCAAGGCCCAACAGGAGCAGGAGCUGGCGGCUGAUGCCUUCAAGGAGCUGGAUGAUGACAUGGACGGGACGGUCUCGGUGACUGAGCUGCAGACUCACCCGGAGCUGGACACAGAUGGGGAUGGGGCGUUGUCAGAAGCGGAAGCUCAGGCCCUCCUCAGUGGGGACACACAGACAGACGCCACCUCUUUCUACGACCGCGUCUGGGCCGCCAUCAGGGACAAGUACCGGUCCGAGGCACUGCCCACCGACCUUCCAGCACCUUCUGCCCCUGACUUGACGGAGCCCAAGGAGGAGCAGCCGCCAGUGCCCUCGUCGCCCACAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGCUGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAUUCCGAGGAGGCCCCACCGCCACUGUCACCCCCGCAGCCGGCCAGCCCUGCUGAGGAAGACAAAAUGCCGCCCUACGACGAGCAGACGCAGGCCUUCAUCGAUGCUGCCCAGGAGGCCCGCAACAAGUUCGAGGAGGCCGAGCGGUCGCUGAAGGACAUGGAGGAGUCCAUCAGGAACCUGGAGCAAGAGAUUUCUUUUGACUUUGGCCCCAACGGGGAGUUUGCUUACCUGUACAGCCAGUGCUACGAGCUCACCACCAACGAAUACGUCUACCGCCUCUGCCCCUUCAAGCUUGUCUCGCAGAAACCCAAACUCGGGGGCUCUCCCACCAGCCUUGGCACCUGGGGCUCAUGGAUUGGCCCCGACCACGACAAGUUCAGUGCCAUGAAGUAUGAGCAAGGCACGGGCUGCUGGCAGGGCCCCAACCGCUCCACCACCGUGCGCCUCCUGUGCGGGAAAGAGACCAUGGUGACCAGCACCACAGAGCCCAGUCGCUGCGAGUACCUCAUGGAGCUGAUGACGCCAGCCGCCUGCCCGGAGCCACCGCCUGAAGCACCCACCGAAGACGACCAUGACGAGCUCUAGCUGGAUGGGCGCAGAGAACCUCAAGAAGGCAUGAAGCCAGCCCCUGCAGUGCCGUCCACCCGCCCCUCUGGGCCUGCCUGUGGCUCUGUUGCCCUCCUCUGUGGCGGCAGGACCUUUGUGGGGCUUCGUGCCCUGCUCUGGGGCCCAGGCGGGGCUGGUCCACAUUCCCAGGCCCCAACAGCCUUCAAAGAUGGGUAAAGGAGCUUGCCCUCCCUGGGCCCCCCACCUUGGUGACUCGCCCCACCACCCCCAGCCCUGUCCCUGCCACCCCUCCUAGUGGGGACUAGUGAAUGACUUGACCUGUGACCUCAAUACAAUAAAUGUGAUCCCCCACCCAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-804.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -841.09
Frequency: 0.0000
Diversity: 512.23
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((....)).)).......(((((.((.((((..((.(((((..((((((((((((.....)))((((((........))))))(((((((.((..((.((((((.((.(((((((((.(((((((....))))))).).(((((((((((....((..((((.....))))..))((.((((....))))))(((((.((((.(((.....(((((........)))))(((((.((.........)).)))))....(((((....((...((((..(((((..((((((((..((((....))))...((((((....))))))......(((((((((((..((.(((((...(((.(((((((((..((((...))))..))).....(((.......))).......))))))..)))...))))).)))).))))............))))))))))).))......)))))))))))....)))))....))).))))))))).))))))).)))).))))...)))).)).)))))).))..)).))))..)))....)))).))))).))))))).((((((.(..((((....(((((...)))))((((((((((.....((((.....)))).((((((...((((((..((((...((((((..(((....)))(((((..(.((((......((((((((((..(((.(....).)))..)))).))))))..(((((((..(((.(((((.((((((.....((((((((.(((.((.((..((((....((((......)))).((((..((((((((((((((.(((((.(((((..((((.(((((.((((((.((.((.(((((....))).....(((((((.((((.(.............).))))((((((((.(..(.((.(((((((.(((.((..((((........)))))))))...)))).((..((((((..(.((((((.(((((..(((...((.((...(.((((.(((........))))))).).))))...))).))).)))))))).)..))))).)..))....))).)).)..)...)))))))))))))))..)).)).)).)))))))).)))))))..)).((.((((.((.....)).)))).)).........(((((........)).)))...((.(((((((.(((((((.(((.....)))..)))......)))))))))))..))(((..((((.((((........)))).))))..))).((((((((((....)))))).))))))).))...)))))))))))......((((.....))))....)))))).))))........))))..))))(((((((((.((.((((.(.((((((...........(((((((..((..((...((..((((.((..((((...(((.(((((..((....))......(((((.((((((.((((..(((.(((..(((((.(((((.((...(((....(((.....(((((((.....)))))))....)))....)))...)).))....)))))))).)))..)))..)))).)))))).)))))....))))))))...)))))).))))..)).)).))..))).)))).........)).))))..).)))).)).))).))))))..)))...))))))))...)))))).))))).(((.....))).....))).))))))))))).)..)))))....)))))))))).))))))........(((((((.....)))))))...((((((((((.(((((.(.(((.....(((((((.......)))........))))....))).)..))))).))))))))))))))))(((((........)))))..))))).)))))..))))..).))))))..(((((((..((.((....)).))..))..))))).((((.....))))))))))))))).................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,(,.,((((,,{{.|{}......||{||||}||}{{{,.,{{.(((((..((((((((((((.....)))((((((........)))))){((((((.((..((.((((((.{{.((((((((,.(((((((....))))))).}.(((((((((((..,.{{..((((.....}))),,}}{(.((((....))))}}(((((.((((,(({.,...(((((........)))))(((((.((.........)).))))),,,.(((((....((...((((..(((((({,,((((((..((((....))))...((((((....)))))).,,..{(((((({,{,{..{{}||||||..(((.((((({(((..((((...))))..)))....{((,.......))).......})))))..)))...|||||.,||}.||,,....}}.,....))))))))))).,},.,...}))))))))).)}.})))))..,}))),))})))))).))))))).)))).))))...)))).}}.)))))).))..)).))))..)}}....)))).))))).)))))}}.{(((((.{..((((....(((((...))))){(((((((((.....{{{{..,,.}}}),((((((...((((((.,,(((...((((((..((,.,,.|||((,((..{{,((({...{.((((((((((..(((.(....).)))..)))).))))))}.,||||{,..,{{.(((((.((((((...,.((((((((.(((.{,,(,,,,....,,{((,({{{,,{{{,{{((((..((((((((((((((.((((,.{({((..((((.((({(.((((((.((.((.{,{((....))},.,{.(((((((.(((....,.),,.......|.{{.(((((((((.({.{,,{.(((((((.(((.((..((((........)))))))))...)))),{(..{(((((..(.((((((.(((((..(((...((.((...{.((((.(((.,......))))))).|.))))...))).,)).)))))))).),.))))).)..)).}},,),})}}).}))))))),)).))))))))..})})).)).))))))}).)))))))..}}.((.((((.((.....)).)))).)).........{((((.,......}}.))}...((.(((((((.((({{{{.{{{..,,.)))}.))}....,,)))))))))))..))(((..((((.((((........)))).))))..))).{(((((((((....)))))).))))))),}}..))))))))))))......(({{.....))))..,,)))))).))))...},...))))}.}))}(((((((((,((.((((.{.((((((...........(((((((,,{{..,,..{((..((((.{{,,((((...{((.{((((.,{{....|,....|,(((((.((((((.((((..(((.{(({{((((({((((..((({.,,....}|||...{,((((({{.,,,.|}}}})),...)}).,,,)))}).))})),...,,,))))).))},,)))..)))).)))))).)))))....))))))))...)))))).))))..)).)).})..))).)))).........)).))))..,.)))),)).))).))))))..)))...)))))))).,.)))))).))))).{{(.....)}}..||||,,.}))))))}})).)}}))))},,,,)))))))))).))))))........(((((((.....)))))))...((((((((((.(((((.(,(((.....(((((((.......))),.......,)))....))).),.))))).))))))))))))))))(((((........)))))..)))))))})))..))))..).)))))).{(((((,{..((.,...,.||,|,..},....}}}.,,||.....}}}}.}})))))))).................
Back