Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002791.3

Sequence Length

1023 nt

GC Content

0.4379

GGAAGCAGUCGCUGCAACUUCCGGGAGGUGCUUGUGUGCCUGGUGCGGGAGCUACGGGGCCCAGGGAUUGUGUUUAAAGUAGUGCUUCUACCAACAUGUCCCGUGGUUCCAGCGCCGGUUUUGACCGCCACAUUACCAUUUUUUCACCCGAGGGUCGGCUCUACCAAGUAGAAUAUGCUUUUAAGGCUAUUAACCAGGGUGGCCUUACAUCAGUAGCUGUCAGAGGGAAAGACUGUGCAGUAAUUGUCACACAGAAGAAAGUACCUGACAAAUUAUUGGAUUCCAGCACAGUGACUCACUUAUUCAAGAUAACUGAAAACAUUGGUUGUGUGAUGACCGGAAUGACAGCUGACAGCAGAUCCCAGGUACAGAGGGCACGCUAUGAGGCAGCUAACUGGAAAUACAAGUAUGGCUAUGAGAUUCCUGUGGACAUGCUGUGUAAAAGAAUUGCCGAUAUUUCUCAGGUCUACACACAGAAUGCUGAAAUGAGGCCUCUUGGUUGUUGUAUGAUUUUAAUUGGUAUAGAUGAAGAGCAAGGCCCUCAGGUAUAUAAGUGUGAUCCUGCAGGUUACUACUGUGGGUUUAAAGCCACUGCAGCGGGAGUUAAACAAACUGAGUCAACCAGCUUCCUUGAAAAAAAAGUGAAGAAGAAAUUUGAUUGGACAUUUGAACAGACAGUGGAAACUGCAAUUACAUGCCUGUCUACUGUUCUAUCAAUUGAUUUCAAACCUUCAGAAAUAGAAGUUGGAGUAGUGACAGUUGAAAAUCCUAAAUUCAGGAUUCUUACAGAAGCAGAGAUUGAUGCUCACCUUGUUGCUCUAGCAGAGAGAGACUAAACAUUGUCGUUAGUUUACCAGAUCCGUGAUGCCACUUACCUGUGUGUUUGGUAACAACAAACCAACAUCAUGGAGGUCCCUGGAUUGAAAAAGGAGCCUCUCCCACUCCUCCUACCACCGAAGUGGUUAGGACUCUAUAUAAAUAAAAACAAGGCUUUUGGAAAAUAAUUGCAUCCUGUUGUUUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-307.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -326.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 231.52

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((.((((((((((((((((..((((((....))))))(((((.(((((((((((((.........(((((....((((.....)))).)))))))))))))))))).)))))(((..(((((((...(((((.((((....(((.(((((((.((((((((((.((((((((((............(((((((((.(((((((..((((((((((.((.((.......)).))))))..((((((.((........))...)))))).....(((...)))((.(((((..(((.(((((...))))).)))...)))))))((((((..((((((((((.(.((..((((((..(((((((............(((....)))(((((((((......).))).)))))........)))).)))..))))))...........)).).))))))...))))..))))))...))))))..))))))))))))))))..)))).)))))).)))))........)))))..))))))).)))....)))))))))...)).)))))..)))((((........)))).....))))))))................(((((((((((.......)))....((((...(((((.....((.((((...(((((((((....(((......)))...)))))))))...)))).))...))))).)))).......)))))))).)))))))).)))...((((((......))))))....(((((((.(((.......)))..((((((..........(((((((((((.(......))))))))(((...(((((((((.(((......)))...(((((........)))))))))))))))))....(((.((.....((((...)))))).)))(((((((((....)))).)))))))))...........)))))))))))))(((((((((........))))))))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(((((.((((((((((((((((..((((((,,.,|}||||(((((.(((((((((((((.........(((((....((((.....)))).)))))))))))))))))).)))))(((..(({{{{{..,{{{{,{((({.,..(((.(((((((.((((((((((.((((((((((............(((((((((.(((((((..(((((((((((((.,({{,...((((((({((((((((((.((........))...)))))}}))))|{{...}}})))))))...||.,||,,{,,..{{{{{|||.....)))))}||,||,,||||,,,,}}}}}||,.((((((..(((((((..,...,,.{..(((....}}|(({{{{|||......},})).)))))........)))).)))..))))))..........,|}.|,...,}},,.)})},.,}},}}}..})))))..))))))))))))))))..)))),}))))).))))),.......}))))..))))))).)))..,.)))))}}}),,,}|,}}}}}..}))||||,.....,,))))..,..))))))))........,..,,,,.{({{(((((((.......}}}.||||,,{...{{|{{,,,|.((.((((...(((((((((....(((......)))...))))))))),..)))).)).,|))}},.||}|.......)))))))).)))))))).|,|{{.((((((......)))))).}}}|,{,((((........})))}.,((((((.{,,,.....||||{(((({{,(......)))))))}.((,,.(((((((((.(((......))).}.(((((........))))}))))))))),||..}}}}..,,....,((((...},,,..,}}}(((((((((....))))},)))),,,,...........)))))))))))},(((((((((........))))))))).