Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002899.5
Sequence Length
807 nt
GC Content
0.5713
AAGCGGGGAGGAGCGACCGCUACAAUGGAUCCUCCCGCAGGCUUUGUGCGCGCUGGGAAUCCAGCUGUCGCCGCCCCGCAGAGCCCCCUGUCCCCGGAGGGCGCUCAUUUCCGGGCCGCCCACCACCCGCGUAGCACCGGCAGCCGCUGUCCCGGCAGUCUCCAGCCGUCCCGCCCGCUUGUGGCCAACUGGCUCCAGUCACUCCCCGAAAUGCCAGUCGACUUCACUGGGUACUGGAAGAUGUUGGUCAACGAGAAUUUCGAGGAGUACCUGCGCGCCCUCGACGUCAAUGUGGCCUUGCGCAAAAUCGCCAACUUGCUGAAGCCAGACAAAGAGAUCGUGCAGGACGGUGACCAUAUGAUCAUCCGCACGCUGAGCACUUUUAGGAACUACAUCAUGGACUUCCAGGUUGGGAAGGAGUUUGAGGAGGAUCUGACAGGCAUAGAUGACCGCAAGUGCAUGACAACAGUGAGCUGGGACGGAGACAAGCUCCAGUGUGUGCAGAAGGGUGAGAAGGAGGGGCGUGGCUGGACCCAGUGGAUCGAGGGUGAUGAGCUGCACCUGGAGAUGAGAGUGGAAGGUGUGGUCUGCAAGCAAGUAUUCAAGAAGGUGCAGUGAGGCCCAGGCAGACAACCUUGUCCCAAGGAAUCAGCAGGAUGUGUGGGCCAGGAUCCCCCUCUUUGCACAGCAUGAGGCAAAAAUGUCCAGCCACCCCCAGGCAUCUGUUAGCAGAGUCUGUCUCUUGGCUUUGUCACUUUUCCUUUUCUUAAAACAAAGCCAUGCCAAUAAAGUGAUCUGUGUUCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-291.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -305.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 235.19
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((....(((......))).)))))))((((((((((((((((((((......(((((((.(((.(((...((((((((((....))).))).))))....(((((((((.........)))..)).)))).(((((((((...(((........)))(((..((..((((((((.((((((....)))).(((((.(((((((((((.((.((((.(........))))).)))))))........)))))).))))).((((((((..(((...(((....((((.((..((((..........))))..)))))))))...)))..)))))))).((((((.(....).))).)))....(((.((.((.(((((..((...(((....(((((......))))).....)))..))..))))).)))).))).)).))))))))))..))).)))))).)))))).))).))).)))))))))))))..(((((((.((((((((((((.((((((((((...(((.(..(((((.(((..((((((((((.((((.(.(.(....).).).)))).)................)))))))))..((((((.(((..(..(((((...)))))........)..))).))))))...))).)))))..).))).((.....))......))))))))))))))((((.((((....))))))))(((....)))....)).)))))))))))))....)))))))).)))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{{{((({(({.,..{,{,.....,||.})))))}(({(((((((((((((((((,.....|((((((.(((|({|,,.(((({(((({....}}},))).))))....(((((({((.........)})..)).}))),(((((((((..{(((........)))|((,,(,.,((((((((.(({(({,,{.||||.{((((.(((({{.(((({.{.,{,|,|}}},,,}|}}},|.|}}|}))}..}|},.,}}))).)))||.((((((((..(((...(((....((({,((..((((..........))))..)))))))))...)))..)))))))).|(((((.{....,.))),))}....(((.({.{{.{{{{(..({.,.(({....(((((......)))))...,,))}}}))..})))}.}))).))).)).)))))))))}..}},.}))))).)))))).))).))),,)))))))))))),,,((((((,(({((({.((((.((((((((((...(((.(..(((((.(((..((((((((({.({((.{.(.(....,.}.}.}))).),.........,,....}))))))))..((((((.(((..(..{,{,{{{{,,,))}.......)..))).))))))...))).)))))..).))).((.....))......)))))))))))))){(((.{{{{....}||||||},,,....}})}}}|)}.))))))}}}}}},....)))))))).}))......,,.,,.,,..,,},....
Back