Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002922.4
Sequence Length
1352 nt
GC Content
0.3757
GCAUAUUUGCUAAGAGCACCAUGCGCGCAGCAGCCAUCUCCACUCCAAAGUUAGACAAAAUGCCAGGAAUGUUCUUCUCUGCUAACCCAAAGGAAUUGAAAGGAACCACUCAUUCACUUCUAGACGACAAAAUGCAAAAAAGGAGGCCAAAGACUUUUGGAAUGGAUAUGAAAGCAUACCUGAGAUCUAUGAUCCCACAUCUGGAAUCUGGAAUGAAAUCUUCCAAGUCCAAGGAUGUACUUUCUGCUGCUGAAGUAAUGCAAUGGUCUCAAUCUCUGGAAAAACUUCUUGCCAACCAAACUGGUCAAAAUGUCUUUGGAAGUUUCCUAAAGUCUGAAUUCAGUGAGGAGAAUAUUGAGUUCUGGCUGGCUUGUGAAGACUAUAAGAAAACAGAGUCUGAUCUUUUGCCCUGUAAAGCAGAAGAGAUAUAUAAAGCAUUUGUGCAUUCAGAUGCUGCUAAACAAAUCAAUAUUGACUUCCGCACUCGAGAAUCUACAGCCAAGAAGAUUAAAGCACCAACCCCCACGUGUUUUGAUGAAGCACAAAAAGUCAUAUAUACUCUUAUGGAAAAGGACUCUUAUCCCAGGUUCCUCAAAUCAGAUAUUUACUUAAAUCUUCUAAAUGACCUGCAGGCUAAUAGCCUAAAGUGACUGGUCCCUGGCUGAAGGGAAUUAACAGAUAGUAUCAAGCGCAGAAGGAAUGUGCCAGUAUGGCUCCCUGGGUGAACAGCUUGGCCUUUUUUGGGUGUCUUGACAGGCCAAGAAGAACAAAUGACUCAGAAUGGAUUAACAUGAAAGUUAUCCAGGCGCAGAGUUGAAGAAGCAUAAGCAAGACAAAAACAGAGAGACCGCAGAAGGAGGAAGAUACUGUGGUACUGUCAUAAAAAACAGUGGAGCUCUGUAUUAGAAAGCCCCUCAGAACUGGGAAGGCCAGGUAACUCUAGUUACACAGAAACUGUGACUAAAGUCUAUGAAACUGAUUACAACAGACUGUAAGAAUCAAAGUCAACUGACAUCUAUGCUACAUAUUAUUAUAUAGUUUGUACUGAGCUAUUGAAGUCCCAUUAACUUAAAGUAUAUGUUUUCAAAUUGCCAUUGCUACUAUUGCUUGUCGGUGUUAUUUUAUUUUAUUGUUUUUGACUUUGGAAGAGAUGAACUGUGUAUUUAACUUAAGCUAUUGCUCUUAAAACCAGGGAGUCAGAAUAUAUUUGUAAGUUAAAUCAUUGGUGCUAAUAAUAAAUGUGGAUUUUGUAUUAAAAUAUAUAGAAGCAAUUUCUGUUUACAUGUCCUUGCUACUUUUAAAAACUUGCAUUUAUUCCUCAGAUUUUAAAAAUAAAUAAAUAAUUCAUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-315.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -344.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 371.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.((..(((((((...((((((....((((((...(((((((((((((((...((((((((((((((((((.(((........(((......(((((..........(((((((((.((((....(((....(((((((((((....)))))...((.((((....)))))).(.((((...)))).)(((((((((...(((((.......)))))..)))..)))))).))))))..))).(((((..(.((..(((....)))..)).)...)))))((((((.......))).)))..))))))))))))))))))....)))......))))))))))))))....)))))))(((((.(((.(((((............)))))..((((((((........)))))))).........((((((((......))))))))..................((.(((((....)).)))))))))))))((((((((.(((.............(((((((...)))))))......(((((........)))))...((((.(((......))).))))...............))).))))))))(((((((((((((((.(((((.....(((..(((((((((((((((.(((........((((((((((.(((((.......)))))((((((..((((((((((......((((((((...(((((...))))).))))))))..........(((((.(..(((((.(((......))))))))..)...)))))......((....)).................))).)))..))))....)))))))))))))))).......((((.......)))).........))).))))..)))))..))))))...))).((((((((.......))))))))..(((..(((...(((((...(((...)))...)))))...)))...)))......((((.(((....))).))))..(((.((.((..((((((...(((..(((...)))..))).))))))...)))).)))..)))))))))).))).))))))).......)))))..)))))))))).))))))..))))))((((((((((...((((((((((.......))))))...))))......))))))))))...)))))))..)).))))))))..((((((((......))))))))..((..((((.....(((....(((...............)))..)))....))))..)).........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((.{{..(((((((,{.((((((....((((((...(((((((((((((({...((((((((((((((((((.(({........((((.((((,({.....,)}.)))).)))},{,{........,,.....(((((((((((((((((((....((.((((....)))))){((((((..,{{....(((((((((.,.(((((.,....,))))).}))),.,))))).,.,|,{{{{,,...}}},..,}}..))))))}..,,,,((,,....,}}},,}}}{(({...})))))))).)))))))}..,))))))...}}|||....,))}))))))))))),...}))))))((((({(({,(((({............}})))..((((((((........)))))))).........((((((((......))))))))..........{{,....,}}.{{{{{....}},}}|,,,}}}))}|((((((((.(((,,,..........((((({|...})))))).....,{((((........)))}|,..((((.,{{...,,.|||,}}}}.......,,......}}}.}))))))),{{{{((((((((((,{{{{|,},..{{{,.{(({((((({,{{{,}|||..,,....{{{,{{{{{..(((((.......))))){{|{{||||{{{(((,|{...,..{{{{((({,||||||,.,,))},),)))))))).....,....(((((.(..(((({,(((......))))))))..)...)))))......((....))............{{.{{{((((((..,........}.))))))),)),)).......,|||,||,||||}}}..,.,...,}})|}}}}..}})))..})))))...|||.((((((((.......)))))))).}||,..{{,...(((((,{,,,,...}))}..,}))}..{||....)))......({{{,{{(....}}},)))).}|||,{|,{|,,{(((({...{{{..{{|...)))..))).))))},.,.)))),))),.))}))))))),))).))))))}.......))))},.)))))))))).))))))..))))))((((((((((...((((((((((.......)))))},,.,,,}......))))))))))}}.)))))))..}}.)))))))),.,(((((((......))))))}|{{({..,{{{....,}.}...,|||,..,,,,,,{{.,,.}}}..,,,....,}),,}}},,,,.....................
Back