Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002933.5

Sequence Length

914 nt

GC Content

0.5306

GCAGAAACUGGCCUUCCAUCUCUCUCAGACACCAAGCUGCAGAUCCAGGCUUUUCUGGGAAAGUGAGGCCACCAUGGCUCUGGAGAAGUCUCUUGUCCGGCUCCUUCUGCUUGUCCUGAUACUGCUGGUGCUGGGCUGGGUCCAGCCUUCCCUGGGCAAGGAAUCCCGGGCCAAGAAAUUCCAGCGGCAGCAUAUGGACUCAGACAGUUCCCCCAGCAGCAGCUCCACCUACUGUAACCAAAUGAUGAGGCGCCGGAAUAUGACACAGGGGCGGUGCAAACCAGUGAACACCUUUGUGCACGAGCCCCUGGUAGAUGUCCAGAAUGUCUGUUUCCAGGAAAAGGUCACCUGCAAGAACGGGCAGGGCAACUGCUACAAGAGCAACUCCAGCAUGCACAUCACAGACUGCCGCCUGACAAACGGCUCCAGGUACCCCAACUGUGCAUACCGGACCAGCCCGAAGGAGAGACACAUCAUUGUGGCCUGUGAAGGGAGCCCAUAUGUGCCAGUCCACUUUGAUGCUUCUGUGGAGGACUCUACCUAAGGUCAGAGCAGCGAGAUACCCCACCUCCCUCAACCUCAUCCUCUCCACAGCUGCCUCUUCCCUCUUCCUUCCCUGCUGUGAAAGAAGUAACUACAGUUAGGGCUCCUAUUCAACACACACAUGCUUCCCUUUCCUGAGUCCCAUCCCUGCGUGAUUUUGGGGGUGAAGAGUGGGUUGUGAGGUGGGCCCCAUGUUAACCCCUCCACUCUUUCUUUCAAUAAAACGCAGUUGCAAACACCUGAUUUCUGAAGCGGUUCUGUCUAGGUACUGUUUCUGGCAUUGCCUUCCAGCAAGGGGUAAGAACUGUAAAUCUGAUUCACUUUGGAGAACGGUGAAUGGAGUAAUUAAAUGCCUUCCCUUCUGACUUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-303.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -318.23

Frequency: 0.0000

Diversity: 154.11

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((((((..((.((.(((((((....(((((.........))))).))))))).))))))))))..(((((.((((((..(.((((((((((((.(((((((...((((..(((.(((((.(((((((((((((((.((((.....))))..)))..)))))..........))))))).)))))))))))).)))(((((......(((....)))......)))))...........)))).))))))........(((((((.(((((.....((....)).....)))))..)))))))((((.(((((....(((((((((.((((.........))))...)))))))))))))).))))..)))))))..))))))...)).)))...........(((((((((((.(((.((((...........((((....(((((((...(((((.(((.((......((((.....((((((((((((....(((......)))...((.((..(((((((((.(((((((...))).)))).((.(((.........))).))...........)))))))))..)).))......((((.(((.(....).))).))))((((....)))))))))))).)))).....))))))))).))))).))).)))).....((((((....(((((((.((((((((((...(((.((((...)))).))).....)))))))))))))))))....)))))).))))...........)))).))).))).)))).))))...)))))))......((...(((.((((((.............(((.(((((((.(.....).))))))))))..............)))))))))....)).

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(((((((((((((,.{{.((.(((((((....(((((,......,.))))).))))))).))})))))))..(((((.((((((..(.((((((((((((.(((((((...((((..((,,(((((.(((((({((((((((.((((.....))))..)))..))))),))..,.....}))))),)))))),.)))).)))(((((......(((....)))......)))))...........)))).)))))}........(((((((.(((((....,(,....,},....)))))..)))))))((((.(((((....(((((((((.((((.........))))...)))))))))))))).)))).,)))))))..))))))...)).))}.......,{,.((({(((((((.(((.((((,....,,..,,(({{....(((((((...(((((.(((.{{......((((...{{((((((((((((...,(((......}}}...((.((..(((((((((.(((((((...))).)))).,{.(((.........))).}}...........,))))))))..)).))......((((.(((.{....).))).)))),,,{,,,,,,),)))))))).)))).}}..))))))})),))))).))).)))).....((((((....(((((((.{(((((((((..,(((.((((...)))).))).,...}))))))))})))))))....)))))).))}}...,..,,...}))).))).))).)))).))))...))))))},}....{{.,,(((,((((((.,,,.....,...(((.(((((((.{.....}.)))))))}))............,,))))))})).,..)).