Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_002961.3

Sequence Length

513 nt

GC Content

0.5146

AUUCUUCCCCUCUCUACAACCCUCUCUCCUCAGCGCUUCUUCUUUCUUGGUUUGAUCCUGACUGCUGUCAUGGCGUGCCCUCUGGAGAAGGCCCUGGAUGUGAUGGUGUCCACCUUCCACAAGUACUCGGGCAAAGAGGGUGACAAGUUCAAGCUCAACAAGUCAGAACUAAAGGAGCUGCUGACCCGGGAGCUGCCCAGCUUCUUGGGGAAAAGGACAGAUGAAGCUGCUUUCCAGAAGCUGAUGAGCAACUUGGACAGCAACAGGGACAACGAGGUGGACUUCCAAGAGUACUGUGUCUUCCUGUCCUGCAUCGCCAUGAUGUGUAACGAAUUCUUUGAAGGCUUCCCAGAUAAGCAGCCCAGGAAGAAAUGAAAACUCCUCUGAUGUGGUUGGGGGGUCUGCCAGCUGGGGCCCUCCCUGUCGCCAGUGGGCACUUUUUUUUUUCCACCCUGGCUCCUUCAGACACGUGCUUGAUGCUGAGCAAGUUCAAUAAAGAUUCUUGGAAGUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-161.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -173.75

Frequency: 0.0000

Diversity: 157.34

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

......((((((.......((((((.(((((((((((((((((..((((((((((.((((((....)))).)).(((((((((.......((((.((.(((((.(((....))).).))))....)).))))..))))))).))....))))))....))))..))).....)))))).)))).((((((((((....))).)))))))....)))).)).......((((.(((((..(((....)))...))))).))))..)))).....)))).))((((((((((((.((...((((((((..(((((((.....((.((.(..((((...)))).).)).))...)))..))))..))))))))............(((((.(.((((((((((..((((.((((((((.......))).))))).))))...........)).)))))))).).))))).((.(((((......))))).)).......))))))))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

......((((((.......((((((.(((((((((((((((((..((((((((((.({((((...,}}}}.}}.,((((((((.......((((,(({((((,.{{{...,))).)}})))....},.))))..))))))),})..,,}))})}},,.})))..))),....)))))).)))),((((((((((....)))}})}})))....}))).)),....,.((((.(((((..(((....)))..}}}))).))))..}))).....)))).)){(((((((((((.((,{,(({{({((,.({(((((,....|{|{{,,..,,,....,|||,{{||.,,...,,...}}||,,}}||}}||,{.,{,...,{,{((({.(,(({{((((((,,({{{.,{{{||||},.,,,.})),)))),,))},..,,.,,.,,,)).}))))))),),)))))}}|}|{{{{|,,,,.)}))).),.......}))))))))))))}...