Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_003015.3

Sequence Length

1883 nt

GC Content

0.6320

AGUCGGGGCGCCCGCAGCGCAGGCUGCCACCCACCUGGGCGACCUCCGCGGCGGCGGCGGCGGCGGCUGGGUAGAGUCAGGGCCGGGGGCGCACGCCGGAACACCUGGGCCGCCGGGCACCGAGCGUCGGGGGGCUGCGCGGCGCGCACCUGGAGAGGGCGCAGCCAUGCGGGCGGCGGCGGCGGGGGGGGGCGUGCGGACGGCCGCGCUGGCGCUGCUGCUGGGGGCGCUGCACUGGGCGCCGGCGCGCUGCGAGGAGUACGACUACUAUGGCUGGCAGGCCGAGCCGCUGCACGGCCGCUCCUACUCCAAGCCGCCGCAGUGCCUUGACAUCCCUGCCGACCUGCCGCUCUGCCACACGGUGGGCUACAAGCGCAUGCGGCUGCCCAACCUGCUGGAGCACGAGAGCCUGGCCGAAGUGAAGCAGCAGGCGAGCAGCUGGCUGCCGCUGCUGGCCAAGCGCUGCCACUCGGAUACGCAGGUCUUCCUGUGCUCGCUCUUUGCGCCCGUCUGUCUCGACCGGCCCAUCUACCCGUGCCGCUCGCUGUGCGAGGCCGUGCGCGCCGGCUGCGCGCCGCUCAUGGAGGCCUACGGCUUCCCCUGGCCUGAGAUGCUGCACUGCCACAAGUUCCCCCUGGACAACGACCUCUGCAUCGCCGUGCAGUUCGGGCACCUGCCCGCCACCGCGCCUCCAGUGACCAAGAUCUGCGCCCAGUGUGAGAUGGAGCACAGUGCUGACGGCCUCAUGGAGCAGAUGUGCUCCAGUGACUUUGUGGUCAAAAUGCGCAUCAAGGAGAUCAAGAUAGAGAAUGGGGACCGGAAGCUGAUUGGAGCCCAGAAAAAGAAGAAGCUGCUCAAGCCGGGCCCCCUGAAGCGCAAGGACACCAAGCGGCUGGUGCUGCACAUGAAGAAUGGCGCGGGCUGCCCCUGCCCACAGCUGGACAGCCUGGCGGGCAGCUUCCUGGUCAUGGGCCGCAAAGUGGAUGGACAGCUGCUGCUCAUGGCCGUCUACCGCUGGGACAAGAAGAAUAAGGAGAUGAAGUUUGCAGUCAAAUUCAUGUUCUCCUACCCCUGCUCCCUCUACUACCCUUUCUUCUACGGGGCGGCAGAGCCCCACUGAAGGGCACUCCUCCUUGCCCUGCCAGCUGUGCCUUGCUUGCCCUCUGGCCCCGCCCCAACUUCCAGGCUGACCCGGCCCUACUGGAGGGUGUUUUCACGAAUGUUGUUACUGGCACAAGGCCUAAGGGAUGGGCACGGAGCCCAGGCUGUCCUUUUUGACCCAGGGGUCCUGGGGUCCCUGGGAUGUUGGGCUUCCUCUCUCAGGAGCAGGGCUUCUUCAUCUGGGUGAAGACCUCAGGGUCUCAGAAAGUAGGCAGGGGAGGAGAGGGUAAGGGAAAGGUGGAGGGGCUCAGGGCACCCUGAGGCGGAGGUUUCAGAGUAGAAGGUGGUGUCAGCUCCAGCUCCCCUCUGUCGGUGGUGGGGCCUCACCUUGAAGAGGGAAGUCUCAAUAUUAGGCUAAGCUAUUUGGGAAAGUUCUCCCCACCGCCCCUGUACGCGUCAUCCUAGCCCCCCUUAGGAAAGGAGUUAGGGUCUCAGUGCCUCCAGCCACACCCCCUGCCUUCCCCAGCUUGCCCAUUUCCCUGCCCCAAGGCCCAGAGCUCCCCCCAGACUGGAGAGCAAGCCCAGCCCAGCCUCGGCAUAGACCCCCUUCUGGUCCGCCCGCGGCUCGAUUCCCGGGAUUCAUUCCUCAGCCUCUGCUUCUCCCUUUUAUCCCAAUAAGUUAUUGCUACUGCUGUGAGGCCAUAGGUACUAGACAACCAAUACAUGCAGGGUUGGGUUUUCUAAUUUUUUUAACUUUUUAAUUAAAUCAAAGAAAACAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-844.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -878.12

Frequency: 0.0000

Diversity: 411.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....((((((((((((((....))))).........))))).))))(((((.((((.(((.((((((...((((.(((.(((((((((((((.((((((..(((...((((..((.(((.((((((.((.(((...(((.(((((((.(((....))))))).))).)))(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((..(((.(......).)))...))))))))))))......((((((.((......((((((((((((...)))..))).)))))).)).))))))..))))))))).))))))....))))))))).)).)))))))..(((((.(((((((..(..((....)).)..)))).))))).))).(((.((((((....((((.(((..(((((.(((.((((((.((...)))))))).)))....))))))))))))...((((((....))))))...)))))))))(((.(((......))).))).......))).)).)))))).))).)).)))))))....))))).).)))))......(((((((...)))))))))))))))..))).))))...)))....((((.....))))...((...((((((....)))))).))((((....))))))).))))))).)).))).((((..((((((((((........))).))..((((((...(((((((((((((((((((((.....(((((....)))))....)))))))..(((((...((.(((((..((((((((((.(((((..(((.((((((((......((((((((((..(((((((.(((((..(.(((.((.......((((((.(((((.............))))).)))))))).))))..)))..))...))))))))))))))))).(((((((((((.(((...((......))..))).)))))))))))...(((.(((((.(((((((.(((((((((((((.((((....))))))))...))))))...((((((((.....................(((((......))))).(((.((((((........))))))..)))..((((((......((((..((((..(((....(((((((((((...)))))....))))))(((....))).............)))....))))..))))..)))))))))))..))).))).))))))).))))).)))...((((((.(((((..((((((((((((.....))))...(((((((((((((((((.(..((.(((.((((((..(......((((((((((....(((((((((.(((((((.((((.(((((....)))))((((((((...(((((..((.(.(((........))).)))..)))))..((((((((((((((........))))(((.((((((...(((......))).))))))...))).))))))))))......(((...((((((((...((((....)))).))))))))....)))))))).)))...))))))))))).)))...)))))).)))))))))))..)))))).))).)).))))))).))))))...))))))))))))))))))....)))))).))))))...))))))))))......)))).......))))))..))))))))))))....................))))....))))))))))...))))))...............))))).))))(((((((.((((..((((....))))..))))...))))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((((((((({(((((,,..|||}|,...,...,|||||.}}}}(((((.(((((((((((((((((((((((....((((((((((((((((((((....(((((....)))))..))).)))}.(((,((({(({.(((((((.(((....))))))).))).,||(((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((..(((.{......).)))...))))))))))))......((((((.((......,((((((((({(...},,.}))).)))))).)).))))))..))))))))).))))))....))))))))).)).)))))}),||{,,..,|{({(({...}||.}},))}))},)))..}},|,,,(((((((.((((((({(((,,(((..(((((.(((.((((((.(,...)})))))).)))....))))))))))))...}.))))},,}).)))))))}}....,)))))),{{......}}))))))).)))))))).))))).}||}||{{{.((({(,({{{{|,,}},}))))),)).,..(((((((...)))))))...}(({{({...(((((((.((.....({(({....))),..,{,....,|,.,.)}.)))))))))))))....)}))))).)))))...,,,,,,.,,....,{{{||||||},}}}.}.))),)).}{|{{||...(((((((({{(((((((((((.....(((((....)))))....)))))))..(((({...((.(((((..((((((.{(((,{{{{...(((.(((((........((((((((((..(((((((.(((({..(,{{{.((.......((((((.(((((,..,........}))))).)))))),}.))))..}}),.))...))))))))))))))))).{((((((((((.(((..,((......))..))).))))))))))}...(((.(((((.(((((((.,,,(((((((({({((((....))))))))...))))))...{{{(((((.....................||||{,,,,..}}}}}.(((.((((((........))))))..))),,((((({.,...,((((..((((..{{({...(((((((((((...)))))....))))))(((....)))....,,.......))|....))))..))))..))))))))))}.,})),}}}.))))))).))))).))).))))),|||((((({.(((((((((((((((...,))).}}}(({{(((((((((((.(..((.(((.((((((..{......((((((((({....(((((((((,(((((((.((((.(((((....)))))((((((((,..(((((..(,{(.(((........))).)))..)))))..((((((((((((((........)))){{{.((((((...(((......))).))))))...}}}.))))))))))......{{{,..((((((((,,.((,,.,,.,,)).))))))))..}.)))))))).)))...)))))))))))})),..,)))))).))))))))))}..)))))).))).)).,)))))).)))))))}}))))))))|,{(((.((({...((((.......)))).)})}).)))).,..))))))}.,,,..))))))..}))))})))))).,,,,,,....,,,,,....}))}..},))))))))))...)))))).)}}..{{{{,.{..,,.),}))))(((((((.((((..((({....})))..))))...))))))).....