Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003017.5
Sequence Length
4228 nt
GC Content
0.3938
CCGCCAUUUCGUGGACGCCGGGUGAGUGAGAGAGUUGGUUGGUGUUGGGCCGGAGGAAAGCGGGAAGACUCAUCGGAGCGUGUGGAUUUGAGCCGCCGCAUUUUUUAACCCUAGAUCUCGAAAUGCAUCGUGAUUCCUGUCCAUUGGACUGUAAGGUUUAUGUAGGCAAUCUUGGAAACAAUGGCAACAAGACGGAAUUGGAACGGGCUUUUGGCUACUAUGGACCACUCCGAAGUGUGUGGGUUGCUAGAAACCCACCCGGCUUUGCUUUUGUUGAAUUUGAAGAUCCCCGAGAUGCAGCUGAUGCAGUCCGAGAGCUAGAUGGAAGAACACUAUGUGGCUGCCGUGUAAGAGUGGAACUGUCGAAUGGUGAAAAAAGAAGUAGAAAUCGUGGCCCACCUCCCUCUUGGGGUCGUCGCCCUCGAGAUGAUUAUCGUAGGAGGAGUCCUCCACCUCGUCGCAGAUCUCCAAGAAGGAGAAGCUUCUCUCGCAGCCGGAGCAGGUCCCUUUCUAGAGAUAGGAGAAGAGAGAGAUCGCUGUCUCGGGAGAGAAAUCACAAGCCGUCCCGAUCCUUCUCUAGGUCUCGUAGUCGAUCUAGGUCAAAUGAAAGGAAAUAGAAGACAGUUUGCAAGAGAAGUGGUGUACAGGAAAUUACUUCAUUUGACAGGAGUAUGUACAGAAAAUUCAAGUUUUGUUUGAGACUUCAUAAGCUUGGUGCAUUUUUAAGAUGUUUUAGCUGUUCAAAUCUGUUUGUCUCUUGAAACAGUGACACAAAGGUGUAAUUCUCUAUGGUUUGAAAUGGAUCAUACGAGGCAUGUAAUACCAAGAAUUGUUACUUUACAAUGUUCCCUUAAGCAAAAUUGAAUUUGCUUUGAACUUUUAGUUAUGCACAGACUGAUAAUAAACCUCUAAACCUGCCCAGCGGAAGUGUGUUUUUUUUUAAAUUUAAAUACAGAAACAACUGGCAAAAAUUGAACUAAGAUUUACUUUUUUUUCCAUAGCUGGGAUAUAGGCUGCAGCUAUAGUUGAACAAGCAGUCUUUAAAAACUGCUGUGAAACACAGGCCAUCAGGGAAAACGAAAUGCUGCACUAUUAAAUUAGAGGUUUUUGAAAAAUCCAACUCUCAUCCUGGGCAGAGGUUGCCUAGUUGGUAUAGAAUGUUAAGUUUCAAGAAAGUUUACCUUUGCUUUAGGUCAUAAGUUCCUUAUUUGAUUGCUGUAUAUGGAUACAUGGCUGUUCGUGACAUUCUUUAUGUGCAAAUUUGUGAUUUCAAAAAUGUCCUGCCAGUUUAAGGGUACAUUGUAGAGCCGAACUUUGAGUUACUGUGCAAGAUUUUUUUUUCAUGCUGUCAUUUGUAAUAUGUUUUGUGAGAAUCCUUGGGAUUAAAGUUUUGGUUACAAAUUGUUCUUUAACUUGAAAGCCUGUUUUUCCUUGCAAACUCAAAUCUGUGAGCUUGGUACCAAGUCCAGGUAUAACAUUCCUAUUGGAAGCCAUACUUAUAUUUUCUUGUAAAGUGCUUUUGAAUUAAUAAAAUAUUAGCAUAAUUGUGUAUAGUCAGUUGAACCCACUGUUACCAUUGUUCUUAUCCCAUGGGAAGCAGUUGGUUACACGAUUCUUAUUUUAUAAGAAACAGCUGAGAGGCACUAUGGAUUAGUCUUCUGAAGUGAAGGAAAUAUAGAUGUCACCUAAGUGAUAGUUAACCCAUUUUUUUUUUUUUUAGGCAUAGAAGCCAGUUCAGGGUCCAUAAUAUUUAGUGACCAACAUUUUAAAGUAUAGCAGCAACCUGGUUCUUAAACACAAAGUAAGUUGCCCAUUAACAAAUGGCUUUUAUCUUUAGCAUGAAAACUUUCCACAGGUCUAAAAAUUGCUUCCAUUUUAUAAUUUGAGGUGUUGCAUGGGAAUUCUAAGCUGAUCCAUCAUGAUGUAAAAGUUCACAAUAUGGUUCAAAUGUAACAGUGCAGAAUUGAAUAUGGAGGCAUGCAUAACCUUCCUCUUAGAAAAUGGCAGGUGUUGUAAUUUCAAAUUUUUGUGCAAUUAGAUUAAAUCAUAAUGCAACAGUCUUGUGGCUUAGUUUCCUUAAAUAUGCUCUUAAGAUAGUUUUGGAUUAUGCGGUAUUGACUGUCUUAAAUAUGAAAGAUAAGUCAUUGCAUUAAGAGUUCAAGCUAAAUGGAUACAUUAAGAUACAGUUCCUAAACAAAUUAUUUAUUUCCACCUUUUACACAAAUCUUGGGAGAAUUGGUGUCAGGAAGGUUCAGCCUUAAAGUUAAGCAUGUUCAAGAAAGACACUUUUCAGACAGCCUGUUUAUUUACUGAGAGCUCUGGCAUUGGGCAUUUUGUCUUUAGUAUUCUCACAUAGCCUACAACCUGUUCCUGUUAGGAACAAGCCAAGAUAGCUAAGAAGUUACGGAAGCCAUGCAAUAUGUCAAUUACAUUGCUUUUUAUAAAUGGACAACUUAUGUGGGCAUUUUUGGGCAGUAUAUGACUUCCUUGCAGGCUCUUAAGUUGGAAGGGUUUCUGUAAAAAGGACAGUUACGGGUAUAAUAUGGCUAAGAGAAAUAAUACAGAACCUGAAAUAAAAGUAACUUCACCAGGGAGUUAUCCUGACUUAGGUGACAUACAGUCCCAGUUGGCAGUUACUUUAACCAGGAGCCCUAGCAUAACCUCAAGACUCUUAGAAACUUUAGAACAUGGAAAUUGUUAAAAGCUUUGAAUUGCACAUUUAGAUUGUGGCUAUUAGGAAUUUUUAAAGUUGUAAUUCCUAAAAUAACAGGUCACACUAACCGGUCUUGUCCAUAUUCAGGGUUGAGUGUAAAAAUGAAAGGAAUCACAAAACUGAACUUAGACCUGUGGUUUAAGGAUCAAGGUGUUCACUAGAAGUCACUGUUACUAAUACUUGAUGACAAUGUAAAGAAACAUUAAGGAUUAUAUUUGAUUGUUUUCAAAGACACUGGCUGGAUGUGGUGGCUCACACUUGUAAUUCCUAGCACUUUGGGAGGCUAGGGCGGGUGGGAGGAUCUCUUGAAGCCAGGAGUUGGAGACCAGUCUGCCCAACAUGGCAAGAUUCACAUUUCUAUUAAAAGGAAUAUUUAGUUUGAUCUCUGGUUCACAGUUCAUUGUGGGUUGCUUCUGACCUCCAUGUCUUAAGCAGAAAGUAGGGAAGUUGUAGUUUUACCAAGCACAGGUACCCUGUGUCUACCAUUUGAGUAUCUUAGAGAUCCUUACAAACGUGAUCCCGUCAGCGUCCAUGACACUCCCACCCUGUUAGACUGCUGUCAGUGGCUUUCACACAAACCCAUAUGUGGAUGGAAAAUCCAGGUUAUUACUACAUUCAUUUUAGUACAGUGCUGCCUAAUUAGAAAUUUUGUUGAAGAGGUAUUUCAGAAUAGAUACAGCCAGACUCCAGGCUCAUUGACUUAGUUUUUCAGGGUGACCUAACCCUGUGUAAUUUUGAGGAGUUCUACAUGAUAAAUACCCUUGGUGAUGUGAGAACCACUAGUUUAGUAUUUUGUCCAAGUAUGCUUUUUUUCAGAGUUCUGAAUGAGAUUUAGUUGUCAUACCUAGUUGGUGGUAAUUUCUUAGUUGUAUAUUUUUGUACUACCAGAUUGUUGCCUUCUGGUUUUCCAUCUUUUCGAGAAAGAUUUCUAGUUAAAGUUACUGAAGAAAAACUGGGUUGGAAGUACAUUUUUCUCUAAAUAAUCCAGUAGUGUUGAAUUUGAUUUUAUGUCCACUCUAAUUUUUUUCAUCCUGUUUUAUUAGGGGGAUUCAUCGGGUACCUGAAGAUAAUUCAGCUGUAGACCCCUUAAGGUUCUGAGACAAGGUCAUUGAAAUUUGUUUUGGCUGGGUGUGAUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCGGUGCAUUGGGAGGUUGAGGCAGGUGGAUCACUUGUGGUCAGGAGUUGGAGACCAGCUUGGUCAACAUGGUGAAACCCCGUCUCUACUAACAGUACAAAAAUUAGCUGGGUGUGGUGGCAGGCGCCUAUAAUGCCAGCCACUUGGGAGGCUGAGGCAGGAGAAGUGCUUAAACCUGGUGGGUGGAGGUUGCCAUGAGCCGAGAUGUAGCCACUUCACUCCAGCCUGAGUGAAAGCAAAACUUCGUCUCCAAAAAAAAAAAAAAAGUUUGUUUUGGUAAGCCUAGUAUAAUUGAUUAGUUUUGUCCAUGCAACUUUCCCCUUGUUGGACUCUGUACUUAAUAAUACAGUAUUUAGAUUCUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1147.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1233.55
Frequency: 0.0000
Diversity: 1155.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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