Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003063.3
Sequence Length
722 nt
GC Content
0.4820
AGACAGCCUGGGAGGGGAGAAGGAGUUGGAGCUCAAGUUGGAGACAGCGAGGAGAAACCUGCCAUAGCCAGGGUGUGUCUUUGAUCCUCUUCAGGAGGUGAGGAGAAGCCAGAGGUCCUUGGUGUGCCCUCAGAAAUCUGCCUGCAGUUCUCACCAAGCCGCUGUGAAAAUGGGGAUAAACACCCGGGAGCUGUUUCUCAACUUCACUAUUGUCUUGAUUACGGUUAUUCUUAUGUGGCUCCUUGUGAGGUCCUAUCAGUACUGAGAGGCCAUGCCAUGGUCCUGGGAUUGACUGAGAUGCUCCGGAGCUGCCUGCUCUAUGCCCUGAGACCCCACUGCUGUCAUUGUCACAGGAUGCCAUUCUCCAUCCGAGGGCACCUGUGACCUGCACUCACAAUAUCUGCUAUGCUGUAGUGCUAGGAUUGAUUAUGUGUUCUCCAAAGAUGCUGCUCCCAAGGGCUGCCAAGUGUUUGCCAGGGAACGGUAGAUUUAUUCCCCAACUCUUAACUGAAAAUGUGUUAGACAAGCCACAAAGUUAAAAUUAAACUGGAUUCAUGAUGAUGUAGGAUUGUUACAAGCCCCUGAUCUGUCUCACCACACAUCCCUUCAACCCACACGGUCUGCAACCAAACUCUAAUUCAACCUGCCAGAAGGAAUGUUAGAGGAAGUCUUUGUCAGCCCUUAUAGCUAUCAUGUGAAUAAAGUUAAGUCAACUUCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-208.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -222.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 194.49
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.((((((((.(...(((((.(((((((....(((((...((((((((..((.....(((((((((((.........)))))..(((((((((((((((((((...((.((((.(((((..(((((....((.((..((.(((.......))).)).))))...)))))....))))).)))).)))))))))...))))))....))))))....))))))......))..))))))))...((((..(((((.((.((.((((((...)))))))).)))))))..).))).)))))))))).)).))))).).)))).....))))..))))))...((((((((.((((.(((.......)))))))))))))))..(((((.(((.(((.....))).))))))))..(((((((((...(((((..((..((((..(((...((((((((.((((((((((..(((((..(((((((....((.........((((.........))))(((((.(((((..((((.((((......))))..))))..))).)).)))))..........))...)))).))).....))))).)))...))))(((.....)))...(((((((....(((......)))...))))))).......))).))))))))..))))))).)).)))))......)))))).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((..((,.((({...(((.(({(((((..{((((((((((((({((((....|||,|....,{{.||{{{{.|||||,...(((((((.....)))))))...,(({,({..(((((((.(..(((((........))).))..}.)))))))}}.))},,....,|||}....,}}))),},.)))))))).)))))).,,....||...,,...,||,,........((((((((..{.(((((((..(((((.((.((.((((((...)))))))).)))))))..).))).))))))))))))..)))))}.}))))....)))).)}))))))...((((((((.((((.,{(,,.....))))))))))))))),,(((((.(((.((,.....))}.)))))))).}|(,((((((,,.(((((..{,..((((,,({{...((((((((.(((({({(((,.,((((..{{||||,...,}},,.....,...,,{|,..,{((({.{((({,.{{{,,.,(({,..,,,.,,,}||||,..,|,|{{|||,||.,||}}....,..,.}}}},})))).}.,}}}}})}},},}}|.,.,,..|||.....}})...(((((((....(((......)))...)))))))......,))).)))))))).,))),))).}).)))))..,,,.)))))).,,,.....
Back