Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_003102.4

Sequence Length

1416 nt

GC Content

0.6836

AGGGACAGCCUGCGUUCCUGGGCUGGCUGGGUGCAGCUCUCUUUUCAGGAGAGAAAGCUCUCUUGGAGGAGCUGGAAAGGUGCCCGACUCCAGCCAUGCUGGCGCUACUGUGUUCCUGCCUGCUCCUGGCAGCCGGUGCCUCGGACGCCUGGACGGGCGAGGACUCGGCGGAGCCCAACUCUGACUCGGCGGAGUGGAUCCGAGACAUGUACGCCAAGGUCACGGAGAUCUGGCAGGAGGUCAUGCAGCGGCGGGACGACGACGGCGCGCUCCACGCCGCCUGCCAGGUGCAGCCGUCGGCCACGCUGGACGCCGCGCAGCCCCGGGUGACCGGCGUCGUCCUCUUCCGGCAGCUUGCGCCCCGCGCCAAGCUCGACGCCUUCUUCGCCCUGGAGGGCUUCCCGACCGAGCCGAACAGCUCCAGCCGCGCCAUCCACGUGCACCAGUUCGGGGACCUGAGCCAGGGCUGCGAGUCCACCGGGCCCCACUACAACCCGCUGGCCGUGCCGCACCCGCAGCACCCGGGCGACUUCGGCAACUUCGCGGUCCGCGACGGCAGCCUCUGGAGGUACCGCGCCGGCCUGGCCGCCUCGCUCGCGGGCCCGCACUCCAUCGUGGGCCGGGCCGUGGUCGUCCACGCUGGCGAGGACGACCUGGGCCGCGGCGGCAACCAGGCCAGCGUGGAGAACGGGAACGCGGGCCGGCGGCUGGCCUGCUGCGUGGUGGGCGUGUGCGGGCCCGGGCUCUGGGAGCGCCAGGCGCGGGAGCACUCAGAGCGCAAGAAGCGGCGGCGCGAGAGCGAGUGCAAGGCCGCCUGAGCGCGGCCCCCACCCGGCGGCGGCCAGGGACCCCCGAGGCCCCCCUCUGCCUUUGAGCUUCUCCUCUGCUCCAACAGACACCCUCCACUCUGAGGUCUCACCUUCGCCUUUGCUGAAGUCUCCCCGCAGCCCUCUCCACCCAGAGGUCUCCCUAUACCGAGACCCACCAUCCUUCCAUCCUGAGGACCGCCCCAACCCUCGGAGCCCCCCACUCAGUAGGUCUGAAGGCCUCCAUUUGUACCGAAACACCCCGCUCACGCUGACAGCCUCCUAGGCUCCCUGAGGUACCUUUCCACCCAGACCCUCCUUCCCCACCCCAUAAGCCCUGAGACUCCCGCCUUUGACCUGACGAUCUUCCCCCUUCCCGCCUUCAGGUUCCUCCUAGGCGCUCAGAGGCCGCUCUGGGGGGUUGCCUCGAGUCCCCCCACCCCUCCCCACCCACCACCGCUCCCGCGGGAAGCCAGCCCGUGCAACGGAAGCCAGGCCAACUGCCCCGCGUCUUCAGCUGUUUCGCAUCCACCGCCACCCCACUGAGAGCUGCUCCUUUGGGGGAAUGUUUGGCAACCUUUGUGUUACAGAUUAAAAAUUCAGCAAUUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-635.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -656.93

Frequency: 0.0000

Diversity: 349.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((.(((((((..(((((((((((((((((((.((((((...((((((((((....))))))))))))))))(((((((((((.....(((((...)))))(((....))).(((((((((.(((.(((..((((....))))..))).)))))))).)))).((((.((((((.....(((..((((((((((((...........((((((((.((((.....)))))))).(((((((..((((((((((((((.((....)))).))).))))).))))......((((((((((((.(((..(((((((.(..(((...)))..))))))))(((((((...((((((((((((...))).)))))).............)))..)))))))((((((...((((......)))).....((((.......)))).((......)).((((...((((((((((..(((...((((((...........((((.(..((((.((....)).)))).).))))......((......)))))))).))).)))))).)))))))).((((((.(((((((..(((..((.(((.(((((((........))))))).((((..((((((((.((....)).))))))))..))))))))))))..))))))).))))))....)))))).)))))))))))))))((((((((.((((.((((.(.((.(((...((((((((((.......((((((((((..(((((((.(..((((((((((((((....))).(((...((((((......))))))..)))..((.((.((((.(((...)))..)))))))).))))).....))))))..((((......)))).......).)))))))..)))..((((((....)).)))).....)))).))).......))))))((((((........)))))).....(((((.......)))))..))))...))).)).))))).)))).)))))))).....)))))))....)))).........)))))).))))))))).......)))))))))))))))))))))............................((((((((.....(((((..(((((((((..............))...)))))))......)))))))))).))).....(((((((((......)).)))))))........)))))....((((....))))..))))))))))......))))..)))))....)).)))..........((((..((((......(((((((((..(.(((...))))..))))).......))))......))))..))))....................

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((.(((((((..(((((((((((((((((((,((((({...((((((((((....))))))))))))))))|((((((((({.....(((((...)))))(((....))).(((((((((.(((.(((..((({....})))..))).)))))))).)))){((((.((((((.....(((..((((((((((((....,...,..{,,,((({,((((.....)))))))).(((((((..((((((((((((((.((....)))).))).)))))}}))),,|,.,((((((((((((.(((.{({{{(((,{{.{((,.{|||{,,,||||||(,{{......||,(((((((((...)))}})))))}}}}}}}....,,||||,||||||}{((((((,,((((......))))..,..((((.......))))....},}}))}}||||...||{((((((({.({({{.(((({,.........}}||.|}|,|((((.((....)).)))).}|)|}||,,,|||{....,|||)}}}})}))}|))}})},||}|}}}}.((((((.((((((({{(((.,((,{{(,{{(((((........))))))),((((..((((((((.((....)).))))))))..))))}))))))}..})})))).)))))),}..)))),.})))))))))))))))((((((((.((((.((((.{.((.(((...((((((((((.{.,...(((({(((((.((((({,({({.,{..{{(({(({({,,,.|||.({|...((((((......))))))..},}..((.((.((((.{((...)))..)))))))){|||,,,,.((((.........)))).,.)))}...{{{{,.....)))),}},.}}.}}))},,}))))}))))))))))).))),....,.))))))((((((........)))))).....{((((.......))))}..))))...))).)).})))).)))).))))))))}.,..)))))))...,||,,.....,...)))))).))))))))).......))))))))))))))))))))),....,......................((((((((.....(((((..(((((((,(..............,,.,.))))))}......)))))))))).))).....((((((({{......}}.)))))))........}}}}}....((((....))))..))))))))))......))))..)))))....)),))}{{........((((..((((......(((((((((..(,(((...))))..))))).......))))......))))..))))............,,......