Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003125.3
Sequence Length
619 nt
GC Content
0.5267
ACCAGUUCUAAGGGACCAUACAGAGUAUUCCUCUCUUCACACCAGGACCAGUCACUGUUGCAGCAUGAGUUCCCAGCAGCAGAAGCAGCCUUGCACCCCACCCCCUCAGCUUCAGCAGCAGCAGGUGAAACAGCCUUGCCAGCCUCCACCUCAGGAACCAUGCAUCCCCAAAACCAAGGAGCCCUGCCACCCCAAGGUGCCUGAGCCCUGCCACCCCAAAGUGCCCGAGCCCUGCCAGCCCAAGGUUCCAGAGCCAUGCCACCCCAAGGUGCCUGAGCCCUGCCCUUCAAUAGUCACUCCAGCACCAGCCCAGCAGAAGACCAAGCAGAAGUAAUGUGGUCCACAGCCAUGCCCUUGAGGAGCCGGCCACCAGAUGCUGAAUCCCCUAUCCCAUUCUGCGUAUGAGUCCCAUUUGCCUUGCAAUUAGCAUUCUGUCUCCCCCAAAAAAGAAUGUGCUAUGAAGCUUUCUUUCCUACACACUCUGAGUCUCUGAAUGAAGCUGAAGGUCUUAGUACCAGAGCUAGUUUUCAGCUGCUCAGAAUUCAUCUGAAGAGAGACUUAAGAUGAAAGCAAAUGAUUCAGCUCCCUUAUACCCCCAUUAAAUUCACUUUCAAUUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -160.96
Frequency: 0.0000
Diversity: 179.90
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((((((..(((...((((....((((((((.((.(((((....)).))).)).((.((((((((..((((((.((((((((((.(.((...(((...(((((((((.(((..((((((......))).))).....(((......))).....((((...........(((.((.(.(.((((....)))).).).)))))...........))))..(((((.((......)).)))))(((((..............(((((..(((..(((........)))...)))..))))).((...(((((.(((((.((((((.....(((((.....)))))........(((..((((........))))..))).........))))))...)).)))...)))))...)).....(((((((..............)))))))(((....)))...............))))).....)))..))))))))).)))....)).).)).))).)))))..))))))..))))))))))))))))))))))...)))..(((..........))))))))).............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,,..(((((({.{{{...((({....((((((((,{{.((({{....}}.))).}}.,(.((((((((..((((((.((((((((,(,(.,,...,.,,,.(((((((((.({(,.((((((......)))}|}}..|,.,,{..,,,,||}..,.,||,,...........{{{.((.{.(.{(((....)))),,.}.))}}}{.,,,......)})|..(((({.((......}}.)))))(((.({{{.(,,{{{....|||||.}|,|}.}||..,,....,}}...)))..)))),.{{...{({{{.(((({.((({{{,...,{||||,....)}})}|,.,..|.||{,.{|||........)))}..}}}.........})))))...}).))}...}}}}}...)}.....{{(({({..............)))}}}}|||,.{{||,....,,,......,,.}}}},},,,)))..))))))))).)),....}}..,)).))).)))))}.))))))..))))))))}))))))))))))}...}}},,,{{......,,,.)}))))))).,,..........................
Back