Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003243.5
Sequence Length
6339 nt
GC Content
0.4307
AAUCGAGGGUUUCGGGGACGCCGAGCGGCACUUUCCUCUUCCCAGCGAGUGAAGGAGGGCAGUCGGCGGCUCUCGCGCCCCGGCCACUUUCCCUGCGCGAUUCCCGGAGCUCCCUGCAGGAGGUGAGAGUCCCCAGCGGGUCCGGAUGGCGUAGUUUUGCCGCGGCGCAGCAGCUGCCGGAGCUCGCCGCCGCCGAGCGCUGGGCGGGGAAACUUGCCGCCGCUUUCCUCCAACUUGCUGCGGGUGGAUCUCCGCUGGACACACCGCCUCCGAGGCAGUUUGAAAAUUGCAAGGAGGGACUUUAAGACUACUUCUGAUUUGCAAAGAUUGUCUGUGCUCUGAGCAGGCUGAAGUGACUGGACGAGACGCACUGUUGGAGAAAUAAAAAUGACUUCCCAUUAUGUGAUUGCCAUCUUUGCCCUGAUGAGCUCCUGUUUAGCCACUGCAGGUCCAGAGCCUGGUGCACUGUGUGAACUGUCACCUGUCAGUGCCUCCCAUCCUGUCCAGGCCUUGAUGGAGAGCUUCACUGUUUUGUCAGGCUGUGCCAGCAGAGGCACAACUGGGCUGCCACAGGAGGUGCAUGUCCUGAAUCUCCGCACUGCAGGCCAGGGGCCUGGCCAGCUACAGAGAGAGGUCACACUUCACCUGAAUCCCAUCUCCUCAGUCCACAUCCACCACAAGUCUGUUGUGUUCCUGCUCAACUCCCCACACCCCCUGGUGUGGCAUCUGAAGACAGAGAGACUUGCCACUGGGGUCUCCAGACUGUUUUUGGUGUCUGAGGGUUCUGUGGUCCAGUUUUCAUCAGCAAACUUCUCCUUGACAGCAGAAACAGAAGAAAGGAACUUCCCCCAUGGAAAUGAACAUCUGUUAAAUUGGGCCCGAAAAGAGUAUGGAGCAGUUACUUCAUUCACCGAACUCAAGAUAGCAAGAAACAUUUAUAUUAAAGUGGGGGAAGAUCAAGUGUUCCCUCCAAAGUGCAACAUAGGGAAGAAUUUUCUCUCACUCAAUUACCUUGCUGAGUACCUUCAACCCAAAGCAGCAGAAGGGUGUGUGAUGUCCAGCCAGCCCCAGAAUGAGGAAGUACACAUCAUCGAGCUAAUCACCCCCAACUCUAACCCCUACAGUGCUUUCCAGGUGGAUAUAACAAUUGAUAUAAGACCUUCUCAAGAGGAUCUUGAAGUGGUCAAAAAUCUCAUCCUGAUCUUGAAGUGCAAAAAGUCUGUCAACUGGGUGAUCAAAUCUUUUGAUGUUAAGGGAAGCCUGAAAAUUAUUGCUCCUAACAGUAUUGGCUUUGGAAAAGAGAGUGAAAGAUCUAUGACAAUGACCAAAUCAAUAAGAGAUGACAUUCCUUCAACCCAAGGGAAUCUGGUGAAGUGGGCUUUGGACAAUGGCUAUAGUCCAAUAACUUCAUACACAAUGGCUCCUGUGGCUAAUAGAUUUCAUCUUCGGCUUGAAAAUAAUGCAGAGGAGAUGGGAGAUGAGGAAGUCCACACUAUUCCUCCUGAGCUACGGAUCCUGCUGGACCCUGGUGCCCUGCCUGCCCUGCAGAACCCGCCCAUCCGGGGAGGGGAAGGCCAAAAUGGAGGCCUUCCGUUUCCUUUCCCAGAUAUUUCCAGGAGAGUCUGGAAUGAAGAGGGAGAAGAUGGGCUCCCUCGGCCAAAGGACCCUGUCAUUCCCAGCAUACAACUGUUUCCUGGUCUCAGAGAGCCAGAAGAGGUGCAAGGGAGCGUGGAUAUUGCCCUGUCUGUCAAAUGUGACAAUGAGAAGAUGAUCGUGGCUGUAGAAAAAGAUUCUUUUCAGGCCAGUGGCUACUCGGGGAUGGACGUCACCCUGUUGGAUCCUACCUGCAAGGCCAAGAUGAAUGGCACACACUUUGUUUUGGAGUCUCCUCUGAAUGGCUGCGGUACUCGGCCCCGGUGGUCAGCCCUUGAUGGUGUGGUCUACUAUAACUCCAUUGUGAUACAGGUUCCAGCCCUUGGGGACAGUAGUGGUUGGCCAGAUGGUUAUGAAGAUCUGGAGUCAGGUGAUAAUGGAUUUCCGGGAGAUAUGGAUGAAGGAGAUGCUUCCCUGUUCACCCGACCUGAAAUCGUGGUGUUUAAUUGCAGCCUUCAGCAGGUGAGGAACCCCAGCAGCUUCCAGGAACAGCCCCACGGAAACAUCACCUUCAACAUGGAGCUAUACAACACUGACCUCUUUUUGGUGCCCUCCCAGGGCGUCUUCUCUGUGCCAGAGAAUGGACACGUUUAUGUUGAGGUAUCUGUUACUAAGGCUGAACAAGAACUGGGAUUUGCCAUCCAAACGUGCUUUAUCUCUCCAUAUUCGAACCCUGAUAGGAUGUCUCAUUACACCAUUAUUGAGAAUAUUUGUCCUAAAGAUGAAUCUGUGAAAUUCUACAGUCCCAAGAGAGUGCACUUUCCUAUCCCGCAAGCUGACAUGGAUAAGAAGCGAUUCAGCUUUGUCUUCAAGCCUGUCUUCAACACCUCACUGCUCUUUCUACAGUGUGAGCUGACGCUGUGUACGAAGAUGGAGAAGCACCCCCAGAAGUUGCCUAAGUGUGUGCCUCCUGACGAAGCCUGCACCUCGCUGGACGCCUCGAUAAUCUGGGCCAUGAUGCAGAAUAAGAAGACGUUCACUAAGCCCCUUGCUGUGAUCCACCAUGAAGCAGAAUCUAAAGAAAAAGGUCCAAGCAUGAAGGAACCAAAUCCAAUUUCUCCACCAAUUUUCCAUGGUCUGGACACCCUAACCGUGAUGGGCAUUGCGUUUGCAGCCUUUGUGAUCGGAGCACUCCUGACGGGGGCCUUGUGGUACAUCUAUUCUCACACAGGGGAGACAGCAGGAAGGCAGCAAGUCCCCACCUCCCCGCCAGCCUCGGAAAACAGCAGUGCUGCCCACAGCAUCGGCAGCACGCAGAGCACGCCUUGCUCCAGCAGCAGCACGGCCUAGCCCAACCCAGCCCAACCCGGCCCAACCCAGCCCAGCCCAGCUCAGCUCAGCUACUGCCAAGGGCAGGACCAAUGGCUGAGCCUCGUGUCCAGACUCAGAGGGCUGGAUUUUGGUUCCCUUGUAAAGACAGAGUGAAUUUCAGUAUAAAGAUCACCCGUUGUAUUCACCCCACACCCAGGGCUAGUAUAAACAUGACCCUGGGCUUCUGUACCACACUAGAAUUCAUGUGAGAAAGCUAAAAUGGUGGUCUUCUCCACCAGCCCCUCACAGGCUUGGGGGUUUUCAAUGUGAAACACAUGCCAGUUUUUAAAAUGCUGCUUUGUCCAGGUGAGAACAUCCAUAAUUUGGGGCCCUGAGUUUUACCCAGACUCAAGGAGUUGGUAAAGGGUUAAUAGCCAGAUAGUAGAACCAGUGAGGAGAUGCGGCCAAAGAUUCUUUAUAUCUGAACCAAGAUGUAAAACAAGAAAUGCUUUGAGGCUUUCUAAGCGAUCCUCCUGUCUAAUUUGCACCUUUGUCUGGAUGCACACUUCUGACCUUGCUGCCACAACCUGUGGGGUCUGAUGUGUCCCUUGAUGGGUGCUGCCCUCAGGGACUGCACCCUGACAAGUGUUAAGGCAACAUUCCUUUCUUGUGCCCUGGGCCAAAACCAAUGCUGAUGACCUUAUCAGCUUCCUGUUUCUUCCCAUACUUGCAUACACCACUGCAAAAUGUCUUAAUGCAAAUUUUGUAUUUCUUACAGGCCUACAGAAAUUGAAAAUGACCAAAAUCAGGAACCACAGAUUUGUGCCCAUUCCUAAUAUUUUGUUCUGCAAAUUAAUGUAUAAUUUGAGGUGAAAUUCAGUUAUAAAGUCAAGGACGAAUUUGCACAGUGAUAUAUUUCUAUGUGUAUGCAAGUACAAGUAUAUAAUAUGUCACCUGGCACAUUCAUUUUCUCAGUUGAAGAAGAGAAAAUUUGAAAAUGUCCUUAUGCUUUUAGAGUUGCAACUUAAGUAUAUUUGGUAGGGUGAGUGUUUCCACUCAAAAUAUGUCAACUUAAAAAAAAAUAGGCCCUUUCAUAAAAACCAAACUGUAGCAAGAUGCAAAUGCAUGGCAAAUCCUGUCGGUCUCCAGUUGGUUAUCUGAAUAGUGUCACCAAUUCCACCAAGACAGUGCUGAGAUUGGAAAAGGGCACUCAUUUGGAUUGCCUUACUUCUCUUGCCUUAAAUAUAUCCCAUAUAUUUAAUAUGUCAAAAAGGGCUUGAGGUGAAUUUCAUUAAAUGGAAUAAUAUGAUGCCACUUUGCAGCUAAAAUAAGCUCAGUGAUACCUCCUUGUUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAUGCCAGGGGGGAAUUAUCAUGCUAAAUUAUUUUACUGCUGAAGAUAGCUUCAUUGCAAAUUAUUCUUUUUCCAGAAUUUCCCCCAAACAACUUAGAAUUCCAUAAGUAGAACAAGAUAGAUUCUACCCCCAAAAUAUUCAUAAGCAAAUCCCACUGCCCUUAAAAUAAGGAAGUUAUGCCUGGUUGUCUGUGAAUGGAACCUCAGUAGGUAAUCCUGAUGAAGCUUAAAACCUUAGGGCAGUGUCUACAUGGGAAACAAGUAUGUGGAAAUUGACAAUCAUUUUUACCAAAUCGUUGAGUAAUAAUAUGACUUACCUGAUAGAUAUACACAUUCAAUAAGGAACAUUUUUUUUUUUCAAUAAGGAACAUUUUAACUAAAACAUUACUUUAGGGCUGAGAUUUCCAGGCUAUCUACAUUGAUCUACUGAAAAAUUUCUAGAUUUCCAUAUACAAACGAAGAAGACAUGAGUUUAGAGAAUUUUUUUCCUUUAAUUUUUUUUUAACAGAAGGGUAUCAGAGUGGAGGACCUAGAUUACGCUACCUGUGUUUGAAAAUAUUGCGCUUUGCCUAACCUUCGGUGGAAUGUAUUGUUUCAGCAUAUUCUAUGUAUAAAAAAGUUUAAAGAUGUCUUCAAAGAAGACUAGAGUCUUUAAGUCACUUAUAGCUAUAUUUUACUACAAAAUUUGUGUAUAAAGAUAUAUUUAAGUGUUUUAGAUAAAU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1866.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1981.35
Frequency: 0.0000
Diversity: 1587.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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