Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003254.3
Sequence Length
769 nt
GC Content
0.5748
GCCAUCGCCGCAGAUCCAGCGCCCAGAGAGACACCAGAGAACCCACCAUGGCCCCCUUUGAGCCCCUGGCUUCUGGCAUCCUGUUGUUGCUGUGGCUGAUAGCCCCCAGCAGGGCCUGCACCUGUGUCCCACCCCACCCACAGACGGCCUUCUGCAAUUCCGACCUCGUCAUCAGGGCCAAGUUCGUGGGGACACCAGAAGUCAACCAGACCACCUUAUACCAGCGUUAUGAGAUCAAGAUGACCAAGAUGUAUAAAGGGUUCCAAGCCUUAGGGGAUGCCGCUGACAUCCGGUUCGUCUACACCCCCGCCAUGGAGAGUGUCUGCGGAUACUUCCACAGGUCCCACAACCGCAGCGAGGAGUUUCUCAUUGCUGGAAAACUGCAGGAUGGACUCUUGCACAUCACUACCUGCAGUUUUGUGGCUCCCUGGAACAGCCUGAGCUUAGCUCAGCGCCGGGGCUUCACCAAGACCUACACUGUUGGCUGUGAGGAAUGCACAGUGUUUCCCUGUUUAUCCAUCCCCUGCAAACUGCAGAGUGGCACUCAUUGCUUGUGGACGGACCAGCUCCUCCAAGGCUCUGAAAAGGGCUUCCAGUCCCGUCACCUUGCCUGCCUGCCUCGGGAGCCAGGGCUGUGCACCUGGCAGUCCCUGCGGUCCCAGAUAGCCUGAAUCCUGCCCGGAGUGGAAGCUGAAGCCUGCACAGUGUCCACCCUGUUCCCACUCCCAUCUUUCUUCCGGACAAUGAAAUAAAGAGUUACCACCCAGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-252.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -267.12
Frequency: 0.0000
Diversity: 275.70
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((.(.((((.(((((((....(((((((...((((((((...(((((((((((..(.((...((((((((((((((((((((..(((((.....)))))...))))))))..)))....(((((((........(((.(((((((..(((......((....))....)))))))..))).)))))))))))))))))))....((((.(.((((((....(((((.........)))))......)))))).)))))....)))..)))))..)))).))......))))).)))....((.(((..(((...(((((((.(((....))).))))...)))..)))..))).)).)))))))..)))))))...)))).))))))((((((..............((((..((..((((..((((..(.((((((((...)))))).)).)((((((....))).)))..(((((.((((((.(((..(((((((.....(((((........((((..(((..(.((((.(((((..(((..((((.((((.(((.....)))))))))))..)))...(((((...))))).))))).))))..)..)))...))))..))))))))))))))).))))))...))))).))))..))))..))..))))..(((((((..((........))((((........))))..)))))))(((..(((....)))..))).....))))))............
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(,((({({((((.{{(((((...,(((((({.((((((...(((....(((,,.....).)))..))).))))))..|||||{{|||{|||||||{|,,,)),..}}|||((({{{(,,.(((((({,.......{{(((.((((((({,,{(......,{....,)....}))))))..))).))))))}}},,}}..(((.....)))...(((((({....|{|}|}}}....{{{||||{..{{{||.,,..{||{(({.,,{{,,.{||||,.}}..,.})))).|||||||||,,,.,,,,,...(((({{(((((....)))))))))}}}||}}||||,.,.}|||}||}}}}}})))).,))))))},,{||||{||||||,(,,,,,..,,|,....,}}||||}}||}}||{,.,{|{{....((((((((...)))))).)),}|||{{{,,,.,||.||,..,{{{{.|||{||,|((..(((((((.....{{{|{,.....,.{{{{{{(((...,||||.|{(((,.{{{..{{{|,||||,|||,,...)))))}))))),.})}...{((((,,,|}|||.|}||}.,}}}..|..||},..||||.,|||||||||}},}}}.)))),)}},)})}),)))).,)))}.,,,..,))}|,|||{||||||||{......}}||||}}}...}})))),...||||.,..,|{{|,,,,}}....,)},...}}))))............
Back