Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003304.5
Sequence Length
4459 nt
GC Content
0.3969
GUCGCUACAGAGGAGCAGAGGAUGACGUGAGGACAGAGUCGCGAACAUCUCCUCGGAGCGCAGCUGGGCCAGCGGUUCCCACAGCCCUGGAGCCCAACGUGCGCAGAAGCGCCUCUUGGAGCUCCUCUCCCACAGAUCUCUCGUCCUCUUCCUGGGCUAGGCCGCCCCAGGCGCGGCCCCUGCGACUCCUGGCACGGCCCCGUGCUCGGCUGCCGCCCUGGCGCGCGCCACACUGUCGUCCCCGGACGGGCGCGGACCGGCUCGGCCGGGGCGCCGGCGGCUGGGGAGGGGUCGCUGGCCCCGGGGCCGCGCAUGCGCCGCCACCAACUUGGGGCUGUCAGUGGAGGGCGAGUGCUGGUUCUCAGGGGAGGCGACGCCCUUCGGGGCCAACGGGCCUCGAGCCGAGGCAGCAGUGGGAACGACUCAUCCUUUUUCCAGCCCUGGGGCGUGGCUGGGGUCGGGGUCGGGGUCGGGGCCGGUGGGGGCCCCGCCCCCGUCUCCUGGCCUGCCCCCUUCAUGGGCCGCGAUGAUGGCGGCCCUGUACCCGAGCACGGACCUCUCGGGCGCCUCCUCCUCCUCCCUGCCUUCCUCUCCAUCCUCUUCCUCGCCGAACGAGGUGAUGGCGCUGAAGGAUGUGCGGGAGGUGAAGGAGGAGAAUACGCUGAAUGAGAAGCUUUUCUUGCUGGCGUGCGACAAGGGUGACUAUUAUAUGGUUAAAAAGAUUUUGGAGGAAAACAGUUCAGGUGACUUGAACAUAAAUUGCGUAGAUGUGCUUGGGAGAAAUGCUGUUACCAUAACUAUUGAAAACGAAAACUUGGAUAUACUGCAGCUUCUUUUGGACUACGGUUGUCAGAAACUAAUGGAACGAAUUCAGAAUCCUGAGUAUUCAACAACUAUGGAUGUUGCACCUGUCAUUUUAGCUGCUCAUCGUAACAACUAUGAAAUUCUUACAAUGCUCUUAAAACAGGAUGUAUCUCUACCCAAGCCCCAUGCAGUUGGCUGUGAAUGCACAUUGUGUUCUGCAAAAAACAAAAAGGAUAGCCUCCGGCAUUCCAGGUUUCGUCUUGAUAUAUAUCGAUGUUUGGCCAGUCCAGCUCUAAUAAUGUUAACAGAGGAGGAUCCAAUUCUGAGAGCAUUUGAACUUAGUGCUGAUUUAAAAGAACUAAGUCUUGUGGAGGUGGAAUUCAGGAAUGAUUAUGAGGAACUAGCCCGGCAAUGUAAAAUGUUUGCUAAGGAUUUACUUGCACAAGCCCGGAAUUCUCGUGAAUUGGAAGUUAUUCUAAACCAUACGUCUAGUGACGAGCCUCUUGACAAACGGGGAUUAUUAGAAGAAAGAAUGAAUUUAAGUCGUCUAAAACUUGCUAUCAAAUAUAACCAGAAAGAGUUUGUCUCCCAGUCUAACUGCCAGCAGUUCCUGAACACUGUUUGGUUUGGACAGAUGUCGGGUUACCGACGCAAGCCCACCUGUAAGAAGAUAAUGACUGUUUUGACAGUAGGCAUCUUUUGGCCAGUUUUGUCACUUUGUUAUUUGAUAGCUCCCAAAUCUCAGUUUGGCAGAAUCAUUCACACACCUUUUAUGAAAUUUAUCAUUCAUGGAGCAUCAUAUUUCACAUUUCUGCUGUUGCUUAAUCUAUACUCUCUUGUCUACAAUGAGGAUAAGAAAAACACAAUGGGGCCAGCCCUUGAAAGAAUAGACUAUCUUCUUAUUCUGUGGAUUAUUGGGAUGAUUUGGUCAGACAUUAAAAGACUCUGGUAUGAAGGGUUGGAAGACUUUUUAGAAGAAUCUCGUAAUCAACUCAGUUUUGUCAUGAAUUCUCUUUAUUUGGCAACCUUUGCCCUCAAAGUGGUUGCUCACAACAAGUUUCAUGAUUUUGCUGAUCGGAAGGAUUGGGAUGCAUUCCAUCCUACACUGGUGGCAGAAGGGCUUUUUGCAUUUGCAAAUGUUCUAAGUUAUCUUCGUCUCUUUUUUAUGUAUACAACCAGCUCUAUCUUGGGUCCAUUACAGAUUUCAAUGGGACAGAUGUUACAAGAUUUUGGAAAAUUUCUUGGGAUGUUUCUUCUUGUUUUGUUUUCUUUCACAAUUGGACUGACACAACUGUAUGAUAAAGGAUAUACUUCAAAGGAGCAGAAGGACUGUGUAGGCAUCUUCUGUGAACAGCAAAGCAAUGAUACCUUCCAUUCGUUCAUUGGCACCUGCUUUGCUUUGUUCUGGUAUAUUUUCUCCUUAGCGCAUGUGGCAAUCUUUGUCACAAGAUUUAGCUAUGGAGAAGAACUGCAGUCCUUUGUGGGAGCUGUCAUUGUUGGUACAUACAAUGUCGUGGUUGUGAUUGUGCUUACCAAACUGCUGGUGGCAAUGCUUCAUAAAAGCUUUCAGUUGAUAGCAAAUCAUGAAGACAAAGAAUGGAAGUUUGCUCGAGCAAAAUUAUGGCUUAGCUACUUUGAUGACAAAUGUACGUUACCUCCACCUUUCAACAUCAUUCCCUCACCAAAGACUAUCUGCUAUAUGAUUAGUAGCCUCAGUAAGUGGAUUUGCUCUCAUACAUCAAAAGGCAAGGUCAAACGGCAAAACAGUUUAAAGGAAUGGAGGAAUUUGAAACAGAAGAGAGAUGAAAACUAUCAAAAAGUGAUGUGCUGCCUAGUGCAUCGUUACUUGACUUCCAUGAGACAGAAGAUGCAAAGUACAGAUCAGGCAACUGUGGAAAAUCUAAACGAACUGCGCCAAGAUCUGUCAAAAUUCCGAAAUGAAAUAAGGGAUUUACUUGGCUUUCGGACUUCUAAAUAUGCUAUGUUUUAUCCAAGAAAUUAACCAUUUUCUAAAUCAUGGAGCGAAUAAUUUUCAAUAACAGAUCCAAAAGACUAUAUUGCAUAACUUGCAAUGAAAUUAAUGAGAUAUAUAUUGAAAUAAAGAAUUAUGUAAAAGCCAUUCUUUAAAAUAUUUAUAGCAUAAAUAUAUGUUAUGUAAAGUGUGUAUAUAGAAUUAGUUUUUUAAACCUUCUGUUAGUGGCUUUUUGCAGAAGCAAAACAGAUUAAGUAGAUAGAUUUUGUUAGCAUGCUGCUUGGUUUUCUUACUUAGUGCUUUAAAAUGUUUUUUUUUAUGUUUAAGAGGGGCAGUUAUAAAUGGACACAUUGCCCAGAAUGUUUUGUAAAAUGAAGACCAGCAAAUGUAGGCUGAUCUCCUUCACAGGAUACACUUGAAAUAUAGAAGUUAUGUUUUAAAUAUCUCUGUUUUAGGAGUUCACAUAUAGUUCAGCAUUUAUUGUUUAGGAGUAUAAUUUUAUUUUAUCUAAAAUAAUAGUCUAUUUUUUCUUUUGUAUUUUGUUAUAAUCUUAAGCAACAAAGAAAAAACCCUAAUAUUUGAAUCUAUUUAUGUCUUUCAAUUUAAAUUCACUUCAGUUUUUGUUAUUGUAAUAUAUUUACUUUUACAUGGUUAUAAUCACUUUAUAUUUUUAAUGUUUUUUUCACUUAAUAUUUUAUAUAUACAUUUCCAUGUAUUGAUGUAGUUAGUCCACAUUUAAAUUUUUAUAGAAUUAUAUAGUUUUUGAAAAAUACAGUCAGUAGAUGUUUUAUUUUUUAGCUAUUCAGUUAUGUUUAUAAGUUUGCAUAGCUACUUCUCGACAUUUGGUUUGUUUUAAUUUUUUUGUAUCAUAAUAGUCCUAUUUUUUUUUCAAGUUGGAGUGAAUGUUUUUAGUUUUAAGAUAGAUAGGAGACACUUUUUUAUCACAUGUAGUCACAACCUGUUUUGUUUUUGUAAAACAUAGGAAGUCUCUUUAAUGCAAUGAUUUGUUUUAUAUUUGGACUAAGGUUCUUGAGCUUAUCUCCCAAGGUACUUUCCAUAAUUUAACACAGCUUCUAUAAAAGUGACUUCAUGCUUACUUGUGGAUCAUUCUUGCUGCUUAAGAUGAAAAGCAUUGGUUUUUUAAAAUUAGAGAAUAAAAUAUGUAUUUAAAUUUUUGGUGUGUUCACAUAAAGGGAUGUAGCUAAAAUGUUUUCAUAGGCUAUUAUAUAUUCUCGCAGCAUUUCCAGUUAAGAGGAUAUUAGGUAUAUAAUUCUCUUCUUAACCGAAUGUCAGAUGGUCUUACGCCACAGGGUGCAGGUAACCCUUGGUCUGUAAGCACCACCGAUCCAGGGAUCAUUGUCUAAAUAGGUUACUAUUGUUUGUUUCAUCUUGCUUUUGCAUUUUUAUUUUUUAAUUUCCAAAUUUUAAGUGUUCCCUCUUUGGGGCAAAUUCUUAUAAAAAUGUUUAUUGUAAAGUUAUAUAUUUUGUCUACGAUGGGAUUAUGCACUUCCCAAUUGGGAUUUUACAUCUGGAUUUUUAGUCAUUCUAAAAAACACCUAAUUAUUAAAACAUUUAUAGAGUGCCUACUGUAUGCAUGAGUUGAGUUGCUUCUGAGGUACAUUUUGAAUGACAGCAUAUUGUAAGAAAAAAAAAGGUGAAUAAAAUUUGACAUUAGAUUAUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1273.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1359.28
Frequency: 0.0000
Diversity: 1337.82
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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