Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003320.5
Sequence Length
6551 nt
GC Content
0.5037
CUUGAGGAUUCAGUCUGGUCCUGAAGGGUUUGGGGGGAGACUGCGACCAGAAGAUGUUUCCAUGUCCUAAUUAAUGGGUGAUGGUGGUUGUUAGUCUGACUGUUGCCACGGUGAUGAAGGGAGACAUCCAAGUGCUGGUUUCAGUACUGAGGCGAAUACAGGGAAUUUCAACAGGCUCCAGGUCUUACUAUGCAGCCUGAAGUGGGACCAUCCCUUAAACCCACUCCAUCCUGUGGCCACGAUGGGGGCCAGGACACCUUUGCCUUCUUUCUGGGUUUCUUUCUUUGCCGAGACAGGGAUUUUGUUCCCAGGAGGCACUCCCUGGCCCAUGGGAUCUCAGCAUUCAAAGCAGCACAGGAAACCUGGGCCCCUGAAACGGGGCCACCGAAGAGAUCGGAGAACAACCAGGAGGAAGUACUGGAAGGAAGGAAGGGAGAUCGCUCGUGUCUUAGAUGAUGAGGGCAGAAACCUGAGGCAGCAGAAGCUUGAUCGGCAGCGGGCCCUGCUGGAGCAGAAGCAGAAGAAGAAGCGCCAGGAGCCCCUGAUGGUGCAGGCCAAUGCAGAUGGGCGGCCCCGGAGCCGGCGGGCCCGGCAGUCAGAGGAACAAGCCCCCCUGGUGGAGUCCUACCUCAGCAGCAGUGGCAGCACCAGCUACCAAGUUCAAGAGGCCGACUCACUCGCCAGUGUGCAGCUGGGAGCCACGCGCCCAACAGCACCAGCUUCAGCCAAGAGAACCAAGGCGGCAGCUACAGCAGGGGGCCAGGGUGGCGCCGCUAGGAAGGAGAAGAAGGGAAAGCACAAAGGCACCAGCGGGCCAGCAGCACUGGCAGAAGACAAGUCUGAGGCCCAAGGCCCAGUGCAGAUUCUGACUGUGGGCCAGUCAGACCACGCCCAGGACGCAGGGGAGACGGCAGCUGGUGGGGGCGAACGGCCCAGCGGGCAGGAUCUCCGUGCCACGAUGCAGAGGAAGGGCAUCUCCAGCAGCAUGAGCUUUGACGAGGAUGAGGAGGAUGAGGAGGAGAAUAGCUCCAGCUCCUCCCAGCUAAAUAGUAACACCCGCCCCAGCUCUGCUACUAGCAGGAAGUCCGUCAGGGAGGCAGCCUCAGCCCCUAGCCCAACAGCUCCAGAGCAACCAGUGGACGUUGAGGUCCAGGAUCUUGAGGAGUUUGCACUGAGGCCGGCCCCCCAGGGUAUCACCAUCAAAUGCCGCAUCACUCGGGACAAGAAAGGGAUGGACCGGGGCAUGUACCCCACCUACUUUCUGCACCUGGACCGUGAGGAUGGGAAGAAGGUGUUCCUCCUGGCGGGAAGGAAGAGAAAGAAGAGUAAAACUUCCAAUUACCUCAUCUCUGUGGACCCAACAGACUUGUCUCGAGGAGGGGACAGCUAUAUCGGGAAACUGCGGUCCAACUUGAUGGGCACCAAGUUCACUGUUUAUGACAAUGGAGUCAACCCUCAGAAGGCCUCAUCCUCCACUUUGGAAAGUGGAACCUUACGUCAGGAGCUGGCAGCUGUGUGCUACGAGACAAACGUCUUAGGCUUCAAGGGGCCUCGGAAGAUGAGCGUGAUUGUCCCAGGCAUGAACAUGGUUCAUGAGAGAGUCUCUAUCCGCCCCCGCAACGAGCAUGAGACACUGCUAGCACGCUGGCAGAAUAAGAACACGGAGAGUAUCAUCGAGCUGCAAAACAAGACACCUGUCUGGAAUGAUGACACACAGUCCUAUGUACUCAACUUCCAUGGGCGCGUCACACAGGCCUCCGUGAAGAACUUCCAGAUCAUCCAUGGCAAUGACCCGGACUACAUCGUGAUGCAGUUUGGCCGGGUAGCAGAGGAUGUGUUCACCAUGGAUUACAACUACCCGCUGUGUGCACUGCAGGCCUUUGCCAUUGCCCUGUCCAGCUUCGACAGCAAGCUGGCGUGCGAGUAGAGGCCUCUUCGUGCCCUUUGGGGUUGCCCAGCCUGGAGCGGAGCUUGCCUGCCUGCCUGUGGAGACAGCCCUGCCUAUCCUCUGUAUAUAGGCCUUCCGCCAGAUGAAGCUUUGGCCCUCAGUGGGCUCCCUGGCCCAGCCAGCCAGGAACUGGCUCCUUUGCCUCUGCUACUGAGGCAGGGGAGUAGUGGAGAGCGGGUGGGUGGGUGUGAAGGGAUGAGAAUAAUUCUUUCCAUGCCACGAGAUCAACACACACUCCCACCCUUGGGGUAGUAGUGUGUUGUAGUCGUACUUACCAAGCUGAGCAACCUCUUCAGCUGGGAAGGCCGCAAGAGGCAUAGAGGGAGAGGAAGCACACUGCAGGGCUGCUGUGGCCCAGUCGUCCGCUCAGCCAAGGAGUCAGAUGGCAAUGGGUACUCCAGCAGGUAGGGGCACAGUGAAUGUGUGUAUGUAUGAAGGCCACAUCAACUUUAUGUAGCAAAGGGCUUGGUGGCCAAGCCUGGCCCUUAAACAACUGCAGAAAGCCCUUCAACUUCAGAAGGCCUCACUCAAGCCUGAGAGAAGUUGGGAGGGUGGUGGGGACAGGUAAGUGGCAGGACCCUGUCAGGAUUGCAGGUGCCUGGCUUGCUGUGGCUAUGGGAAUCAGCUGGUGGCUAGGUUUCUAGCGCAUUUGAUUUCUCCAGGUUUGCUGUGUCUCACAGAGGCAGUAGGAACCCAGCUCUCAGGGCUGUCUUGGUGGAUGGGCCCUGCAAGACACAGGCUCAGCAUGCAGAAGUGCAUGAACAGGGUCCCUGGAUCAGGGUUGUUCUGGGAGUCCUGUCAGCUUCCCCAGGAGCUCUCUGCUGAGCAGCCCAGCACAACCCCCAGGAAACACAAAUGGGGUCCAGGUCACCAGCCUGACUGCACACAGCUAGGCAUGCCUGGGAAUCCUGCUGCCAGAGAACCAUUCCCAAGCCAUGGCAUGCUCCUUGAAGAAUCUCUCCUCUCUCUCUCUCUCUGGAAAGACCCAACUUUCUCACUGCUGUCAGCCAAGUCAUGGUUGGUAACCAUGUAGGUUCUUGGGAGGGAAUGGGACAGGGUGAAUAAAGCAGGGAAUAUUUUAGAACCACAAGAGAUCAGCAGUGGCAGGACCCUUAGGAAUCUAGUACAACCUUGUUGCUUUAGGUGAGUCACACUCAGAAAAUGGGGCUUGCCCUGGGUCACCUAGCUGGUUAAUGGCAGCAUUCAGAACUUCAAGUUCUCUUGAUUUCUUUGUUCCCACUGUCCCCCAAGAAACUAGUAUCUCUGGCCUCCUGGGGGCCCAUUCUGCAUGCCCUCCCCACUUCCCCCGAUUCAGAGACUUAGAAGCAUCAGAGUUGAUAAAUUAGAUUGAAACCAUUCCAGUAGGAAAUCAGGCAGUUCCCUGUUGAAAGUUGUCUGGCUUUUUGCACGUGAGUAUGAUCCAGGAUUGGCCUGUGUCUGGCCCCUCCGCGAGGGCUACUCAGCAGUAAGCAGGCCUUAGUACGGCUGCUGCACACUUCUCGGUCUAGGUGGGAGAGAGUGCAUAAAGGUUCUGGGGCUGGGCCUGAGCCUAACUCCCUCCACUACCGCUAUUUCUCCUUGGAUGGCACCAUCCACCCUGCAGGCUUGGGAACUGUAAGCUCAAGCUUUUGCUCAUUUGUCAUUUACCCUGGUGGAGGCUUCUUGCCCAGAUAGAGAUCUGAAAUUGGUGGGAAGCAAGCAGGGGUCGUACCUUGCUUUAGAGUAGAUGUUUGGAAAAGCUAAGUAGAAAUUUUUUAAAAUAGAAGUUGUAUUUUAAACGUGUUAGGCUUUAUAGGUGAAGGACUUGUUUUGACUUAAGUAGAAGUAAUAUGCUCUCAUUUCUUUGUAAUCUAGAUUUUCCUAUGUUGAAUGCUUAAAGCAAGGCAUACCUGUCCUAGCAGGAUCUGCCCACACCUCGGCCGUACAUCUCUGUGAGAGACCCCCUCCAACGAUUAGCUUUUGCAACAUGGUCCAGUUUCUAGAGGGCACUAGAACUUUGUGCCAGCGCUGGCGAGAUACCAUGGUGCCAUCCUCCUUUCUAUAGUUCCAGUUUAGCCCUUCCCUGCCUUUAAGGAGAAGAGAUCUUCAUGGUGACAUUUGAGAUGAUGGAAACUAGAUCGUCUCUAAUGUUAGGUCAAGCUAUUUCUCUGGAUCUAUGAUUUUAAGAUAGAACAGGCUGGUUCUGAGUUCUGGUGAGACGGAGACCCCGGUGGCAGUGGAAAAAUCAGAAGCACAAAGGAAAACUCUUGGCCUCUGCUUUCUCCUGUAGCACAAAGAGGGAGUUGGCUGGAUCUUUUGGUGGAGUCAGGAAAGACAGGCUGAGCUUUCUAGCCUAAGUGUGGAGAAGGAUAGCCUCAGCCACAAAACUCUGUCAGGCAUUGAAUGACAAGCAUCAGUAGCUGAGUGCACUCCUGGUGAUCCUGGUUUUCCUUGACCACUGGCCCUGGGGCCAUGGGUGCAUGGACUCGUAAAGCUGCUAGGGCCCCUAGAAACCACCUGGGUUCAGCCUCUCCCACAAUAAGAGUUCUUGCCCUUCAUACCCUCUACCUGGAUGGAUGGUCUUUGGGCAGGGAAUUAAUGACAGAAUGAGCAGUCCCUAAUGGUAUUGGGCAGUUGGGAGUGAGUUUAGGCAGCUUCUCUGUAACCGCUUCUGGGGCCACACCCCAAAACUCUACACCCUCUGCCCCAGAACAAUUCUGCAGAGUGGUGAAGUUCACUUCCCCAACUCUUCUCCAAGUCUAGCUUUCCUUUCCUUCUGGCUCCAAGGUGCUCUGUGUCCGUCUGUGUAUGUGUGUGUCUGUGCGUCUGUGUGUUUAUUUGGGGAAAAGGGCAAUCAGCAAUCAACUGAGGUUUCUUAAUUGUGAUUAUAUUCCUGAGAAUGAAUGAGUAGGAAAGGAAUAAGGAUGUUGUUAUGAUCGCCUGUGGAUUUUGUCCAUUCAUCUCAUGCUCUCUGAACAGAAGGUAUACCUGGGAAGAUACCAGCUUUUUCUCUCAGGGUUCUGAGUCAGAGGACACCAUCCAAGAAUGUUGUUAGCUUUUCAGUUCCCGCUCU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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2345.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2462.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 1511.09
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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