Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003352.8
Sequence Length
1523 nt
GC Content
0.3710
GGAAGUGACGCGAGGCGUAGCGGAAGUUACUGCAGCCGCGGUGUUGUGCUGUGGGGAAGGGAGAAGGAUUUGUAAACCCCGGAGCGAGGUUCUGCUUACCCGAGGCCGCUGCUGUGCGGAGACCCCCGGGUGAAGCCACCGUCAUCAUGUCUGACCAGGAGGCAAAACCUUCAACUGAGGACUUGGGGGAUAAGAAGGAAGGUGAAUAUAUUAAACUCAAAGUCAUUGGACAGGAUAGCAGUGAGAUUCACUUCAAAGUGAAAAUGACAACACAUCUCAAGAAACUCAAAGAAUCAUACUGUCAAAGACAGGGUGUUCCAAUGAAUUCACUCAGGUUUCUCUUUGAGGGUCAGAGAAUUGCUGAUAAUCAUACUCCAAAAGAACUGGGAAUGGAGGAAGAAGAUGUGAUUGAAGUUUAUCAGGAACAAACGGGGGGUCAUUCAACAGUUUAGAUAUUCUUUUUAUUUUUUUUCUUUUCCCUCAAUCCUUUUUUAUUUUUAAAAAUAGUUCUUUUGUAAUGUGGUGUUCAAAACGGAAUUGAAAACUGGCACCCCAUCUCUUUGAAACAUCUGGUAAUUUGAAUUCUAGUGCUCAUUAUUCAUUAUUGUUUGUUUUCAUUGUGCUGAUUUUUGGUGAUCAAGCCUCAGUCCCCUUCAUAUUACCCUCUCCUUUUUAAAAAUUACGUGUGCACAGAGAGGUCACCUUUUUCAGGACAUUGCAUUUUCAGGCUUGUGGUGAUAAAUAAGAUCGACCAAUGCAAGUGUUCAUAAUGACUUUCCAAUUGGCCCUGAUGUUCUAGCAUGUGAUUACUUCACUCCUGGACUGUGACUUUCAGUGGGAGAUGGAAGUUUUUCAGAGAACUGAACUGUGGAAAAAUGACCUUUCCUUAACUUGAAGCUACUUUUAAAAUUUGAGGGUCUGGACCAAAAGAAGAGGAAUAUCAGGUUGAAGUCAAGAUGACAGAUAAGGUGAGAGUAAUGACUAACUCCAAAGAUGGCUUCACUGAAGAAAAGGCAUUUUAAGAUUUUUUAAAAAUCUUGUCAGAAGAUCCCAGAAAAGUUCUAAUUUUCAUUAGCAAUUAAUAAAGCUAUACAUGCAGAAAUGAAUACAACAGAACACUGCUCUUUUUGAUUUUAUUUGUACUUUUUGGCCUGGGAUAUGGGUUUUAAAUGGACAUUGUCUGUACCAGCUUCAUUAAAAUAAACAAUAUUUGUAAAAAUCAUACUAAUGCUUAUUUUAUUUUAAUUGUAUAGAAAGAAAAAAAUGCCUAAAAUAAGGUUUUCUUGCAUAAAUACUGGAAAUUGCACAUGGUACAAAUUUUUUCUUCAUUACUGUACAGUGAUGAUGUUAAUGACUUUGAAGCACUGAAAGUUACUGAAGUGCCUUCUGAAUCAAGGAUUUAAUUAAGGCCACAAUACCUUUUUAAUACUCAGUGUUCUGUUUUUUUAAAAACUUGAUAUUCCUGUAUGGUGCAUAUAUGAUACAGUUACCUAAUCAUGUUGAAUAAAUGGGCAUGCCAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-379.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -409.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 308.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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