Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003517.3
Sequence Length
494 nt
GC Content
0.5830
AAUCUUAUUUUGUUGCGAGGUUCUGAGCGUUGUCUGUGUUUAACCUUGAUUUCAGUCAUGUCUGGUCGUGGCAAACAAGGAGGCAAGGCCCGCGCCAAGGCCAAGUCGCGCUCGUCCCGCGCUGGCCUCCAGUUCCCGGUAGGGCGAGUGCACCGCUUGCUGCGCAAAGGCAACUACGCGGAGCGGGUGGGGGCCGGCGCGCCCGUCUACAUGGCGGCGGUCCUCGAGUACCUGACCGCCGAGAUCCUGGAGCUGGCGGGCAACGCGGCUCGGGACAACAAGAAGACGCGCAUCAUCCCUCGUCACCUCCAGCUGGCCAUCCGCAACGACGAGGAACUGAACAAGCUGCUGGGCAAAGUCACCAUCGCCCAGGGCGGCGUUUUGCCUAACAUCCAGGCCGUUCUGUUACCAAAGAAAACCGAAAGCCACAAAGCCAAAAGCAAAUAAAUGCAGACAAACAAACCAAGACCAAAGGCUCUUUUUAGAGCCACCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-187.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -195.42
Frequency: 0.0000
Diversity: 59.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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