Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003519.4
Sequence Length
451 nt
GC Content
0.5876
GGUUUUGCCACUAUUGUUUCAUUAUGCCCGAGCUGGCCAAGUCUGCUCCCGCCCCGAAGAAGGGCUCCAAGAAGGCGGUGACCAAGGCCCAGAAGAAGGAUGGCAAGAAGCGCAAGCGCAGCCGCAAGGAGAGCUACUCCGUGUACGUGUACAAGGUGCUGAAGCAGGUCCACCCCGACACCGGCAUCUCUUCUAAGGCCAUGGGAAUCAUGAACUCCUUCGUCAACGACAUCUUCGAGCGCAUCGCAAGCGAGGCUUCCCGCCUGGCGCACUACAACAAGCGCUCGACCAUCACCUCCAGGGAGAUCCAGACCGCCGUGCGCCUGCUGCUUCCGGGGGAGCUGGCCAAGCACGCGGUGUCGGAGGGCACCAAGGCCGUCACCAAGUACACCAGCUCCAAGUAAAUUCUCAAGCUCUUGUCCAACCCAAAGGCUCUUUUCAGAGCCACUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-149.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -157.46
Frequency: 0.0000
Diversity: 113.39
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((.....(((.....((((....(((((((....((((((((((((((.......))))........((.((((((((.((((.((((((.((((.((....(((((....(((...(((.((((.....)))).)))...))).....)))))...))..))))...(((....)))....))))))..)))).))).....(((((....)))))...........((((((((...((..((.((((.....)))).))))..........))))))))...))))).)).)))))...)))))(((((((.((..((((((((....))))).)))...)).)))))))...((.(((......))).))..........)))))))...)))).....)))......))..))))....((((((....)))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.{{{{..,{{{{{.....{{{,((((.(((...))).)))).,{{{{.......)))).....},})}}))))..)))))))........((.(((((((,,((,...{{{,...}||..,(((({.{(({..{.((..((((((..((((.{(..{{.(((,{.({((((({{{((.((((({{,..(((..((((.....,{({,....,|}|}....,,.....((((((((...{,..((.((((.....)))).))},..........))))))))})))..))}...)))))))))..,,,({{(((((((.(((.(({...})).))).)))...)))))))))))))).))).)))...)))}.))))..))))))..)).}..))))..}})))..))))))).))).))....((((((....)))))).....
Back