Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003608.4
Sequence Length
4511 nt
GC Content
0.3722
AGCAGUGUUGGUUUCUCUUCUUGACUUGAUGCAGGCACAGAUUUAUCAAGCUCCUCAGUCAACAAACACAUCACCGGAAGAAAUAUGGAAGGAAAGGAAUUUUAAAAGGAAAUACCAAUCUCUGUGCAAACAAAGCCUUGUAUAUUCAUGUUUGCACCAAUCUACUGUGAGAUUUAUGAAGAAAAACAAAUUGCGGACAACUCUCUAUGUACACUUACAAAUGCCUCAGUUGAUGCUUGUGGGCUGUUUGUCAGCGUUCUGUGAUAAUGAACACAUGGACUUCUGUUUAUUAAAUUCAGUUGACCCCUUUAGCCAAUUGCCAGGAGCCUGGAUUUUUACUUCCAACUGCUGAUAUCUGUGUAAAAAUUGAUCUACAUCCACCCUUUAAAAGCAUUGAUGAAUUAAUUAGAACUUUAGACAACAAAGAAAAAUUGAAAAAGAAUUCUCAGUAAAAGCGAAUUCGAUGUUCAAAACAAACUACAAAGAGACAAGACUUCUCUGUUUACUUUCUAAGAACUAAUAUAAUUGCUACCUUAAAAAGGAAAAAAUGAACAGCACAUGUAUUGAAGAACAGCAUGACCUGGAUCACUAUUUGUUUCCCAUUGUUUACAUCUUUGUGAUUAUAGUCAGCAUUCCAGCCAAUAUUGGAUCUCUGUGUGUGUCUUUCCUGCAAGCAAAGAAGGAAAGUGAACUAGGAAUUUACCUCUUCAGUUUGUCACUAUCAGAUUUACUCUAUGCAUUAACUCUCCCUUUAUGGAUUGAUUAUACCUGGAAUAAAGACAACUGGACUUUCUCUCCUGCCUUGUGCAAAGGGAGUGCUUUUCUCAUGUACAUGAAUUUUUACAGCAGCACAGCAUUCCUCACCUGCAUUGCCGUUGAUCGGUAUUUGGCUGUUGUCUACCCUUUGAAGUUUUUUUUCCUAAGGACAAGAAGAUUUGCACUCAUGGUCAGCCUGUCCAUCUGGAUAUUGGAAACCAUCUUCAAUGCUGUCAUGUUGUGGGAAGAUGAAACAGUUGUUGAAUAUUGCGAUGCCGAAAAGUCUAAUUUUACUUUAUGCUAUGACAAAUACCCUUUAGAGAAAUGGCAAAUCAACCUCAACUUGUUCAGGACGUGUACAGGCUAUGCAAUACCUUUGGUCACCAUCCUGAUCUGCAACCGGAAAGUCUACCAAGCUGUGCGGCACAAUAAAGCCACGGAAAACAAGGAAAAGAAGAGAAUCAUAAAACUACUUGUCAGCAUCACAGUUACUUUUGUCUUAUGCUUUACUCCCUUUCAUGUGAUGUUGCUGAUUCGCUGCAUUUUAGAGCAUGCUGUGAACUUCGAAGACCACAGCAAUUCUGGGAAGCGAACUUACACAAUGUAUAGAAUCACGGUUGCAUUAACAAGUUUAAAUUGUGUUGCUGAUCCAAUUCUGUACUGUUUUGUAACCGAAACAGGAAGAUAUGAUAUGUGGAAUAUAUUAAAAUUCUGCACUGGGAGGUGUAAUACAUCACAAAGACAAAGAAAACGCAUACUUUCUGUGUCUACAAAAGAUACUAUGGAAUUAGAGGUCCUUGAGUAGAACCAAGGAUGUUUUGAAGGGAAGGGAAGUUUAAGUUAUGCAUUAUUAUAUCAUCAAGAUUACAUUUUGAAAAGGAAAUCUAGCAUGUGAGGGGACUAAGUGUUCUCAGAGUGAUGUUUUAAUCCAGUCCAAUAAAAAUAUCUUAAAACUGCAUUGUACAGCUCCCUCCCUGCGUUUUAUUAAAUGAUGUAUAUUAAACAAAGAUCAAUAUUUUCUUAAUGACUCAGGGUCUUUAUUGUUAAUGCCAAUUGUUUUUGUAUCUGUGCUAUAAUCCCUUAGAGUCAGUAAAGUAUGUAGGGGACUGUUUCUUCCUUUGUGUCUGGGUUUAUGAUUUUUCUCACUCUUUCUUUGGACUCCAGGGUGUCAGCCAUCAGGUCUCCUAAUUUUGUGUACCGGUCUCCAACAACCCCAGCUACUGAAUACUGCUUCUAAUCUCCUCAUUCAUUAACAAAUCUUUAUUUUUUUAUCUUGUAUAAAAUAACUGCUUUAUUGACACAAAAUUUACAUAACUUAAAAUUCAACUUUGUAUUGUGUACAAUUCAGUGAUUUUUUGUAUAUUCACAGAGCUGUGCAACCAUCACCACACUCAAAAAAUUUUCAUCACCCACCAAAGAAAUCUUAUACUCUUAGCAGUCGCUCCCUGCUCUCCCGUCCAUGCCAGUUAUUAAUUUACUUUCUGUCUCUAAGGAUUUUCAUUACUCUGAACAUUUCAUAUAAAUAGAAUUAUACAAUAUGUGGCCUACUGUGACGUAUUUCACUUAGUAUAAUGGUUUCAAGUUUUAUCCAUGUGUAGAAUGUAUCAGCACUUCAUUUCUUUUUAUGGCCUGAUAGUAUUCUGUUGCAUGGUUAUACUCCAUUUUGUUUAUCUAAUCACUUGGCUUCAUUAACAAAUAUUUAUUGAAUCCAUUCCAUAAACUAGGUUUUGAGUUAAGUACUGGGGCUAUGAAAGAAAUGGUCUCAUGAAGCCUCACGAAGUUUACAUUAGUUCAAAAGCCUAGUCACCGAGCUUGAAAGAUUUCUAUAUAAAGGAAAAGGAAAUAGGCUCUGAGUUUUAUUUUGAUCUCUUUUUAAUUUAUAACUGGGUAUAACAUAGCUGAAAUUACCAGAAGUUUAAUGCAUAGACAAAUAAAUAGUUCUAUUAUAUCUUUCUUUUUGGACUUAGAAUGUUAGAAUAUUUUGAGAGUUCUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGUCAGAGUCUUGCUCUGUAAUCCAGGCUAGAGUGUAGUGGUGCGAUCUCCACUCACUGCAGCCUCCACCUCCCAGGUUCAAGCGAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCCAAGUAGCUGGGAUUACAGGCACCCACCACCAUGCCCAGCUAAUUUUUGUAUUUUUAGUAGAGACGGGGUUUCACCAUGUUGCACAGGCUGGUCUCAAUCGAACUCCUGACCUCAAGUGAUCAUCCCACCUAGGUCUCCCAAAGUGCUGAGAUGACAGGCGUGAGCCACCAUGCCUGGCAAAGAGAGUCUUGAUACAACAUAUUCUUUUGAAUCCUCAUUGUGUAAAUUGCCUCGUUGUAAAUAGACACUCAGUAAACAUUUUCCUCACCAAAAUAUUUUUAAGGAUUUUUCUACCCUUCUCCUUUUCUCUUUGCUUUCCUUUUCUUGCCUGUUCUUUCCACUCCCCCCAAAAUGAUCAGAUAGCAAAUGUCUUGAUAACAUGAGGUGCCCUCACAUUAAAAAACAAAAUAUUGAGCCGGGCGCGGUGGCUCAUGCCUGUAAUCCCAGCACUUUGGGAGGCUGAGGUGGGCAGAUCGCCUUAGGUCAGGAGUUGGAGACCAGGCUGACCAAUAUGAUGAAACUCUGUCUCUACUAAAAAUUCAAAAAUGUGCCAGACCUGGCCUGGUGGCAUGUGCCUGUAAUCCCAGCUACUUGGGAGGCUGAGUCAUAAGCCUGCAAUGGGAAAAUGGAUCGAAUCUGGGGUGAGGGGGAAGUGAUGUGGGGGUUAUGGUACCUCUUUUCUCUUCCAAAGAUGCUGUUCUUACUGCAUCACUUGUGGCUGGCCAGGAAAAGCCAUGCAGGAGUUUUGUUUGUGGCCACUAGGUGACGAUCGUGUUCUGUACGGGACCUCUUAUUAAUAGUUCACCACUAGCCGCCACUCCAGAAGAGCGGAGGAACCCAGGAUAAUAUUUUGUCAACCAAGAAACAAGAAGUCCCUCCCAGGAACUGGAAAUGAAUGGGGAAAAUGCUGAAAUCUCAUUUGCACUAUUCAUUUCUCUUCUCUCUGGAAAGCUCGGCAAUCAUCAGGUCAUUUCAUUUGGCUUAAAUUCCAUGUGUCUUUCCAAACUUUUAAAAGCUGGUGAAAAUUGUUCCACCCAUAUGUAAAAGAACAUAGGUUAAGUUGUCUAAUUCUUGCAGGAAUGUGGAUAUAGCAUUAAAAAUAUGUCUUUGUAUACUUAUCUUACCCAUGUAAGAAAAGAGUGGCCAACUUUCAUAUAAAUAGAAAGAGAACAUUUAAGCUAUAUGCAGUUUGCAUUUUUGUCUACUAUUAUGAAAUUAUUAUCUAUGAAAUUCAAGCUGUAACUCAACAUAUGUAUAAUUUUAAUUUCUAAUUUAUUGUUAGAUCUCAGCACUUAAAAAAUUACAUCUUGUAUUUGAAUUGUUAAAUCUGUUCCCUGCAAAGAACAGUAAUACAAUCAUGUUCUAAUUUACUAGCAUUUGCAUAUUUUAGAAAUAUAAUGGCCUGUAAUUUACUUUUCUUUUGCCUAUAAUUUUCUGAAGCUCUUUAUGAUGCACCGGUGCAUUUUUAUUUAAAAAAUAGAUUGUGACUCCUCAAAUAAUGUUACAAUUCGAUGUUCAAAAAGCAAUCCAGGUACAUAGCCAUAAAGGGAUGAGCUAGAGAGGUCUCCAUAUUAUCAUUCAAUGUGAGAAUAAAAAUUCUAUAUUUUAUUCUAGAAUAAAAUUAUAAAUUUCUUUAUCUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1233.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1320.20
Frequency: 0.0000
Diversity: 1054.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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