Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_003641.5

Sequence Length

668 nt

GC Content

0.5539

GAAACGACAGGGGAAAGGAGGUCUCACUGAGCACCGUCCCAGCAUCCGGACACCACAGCGGCCCUUCGCUCCACGCAGAAAACCACACUUCUCAAACCUUCACUCAACACUUCCUUCCCCAAAGCCAGAAGAUGCACAAGGAGGAACAUGAGGUGGCUGUGCUGGGGCCACCCCCCAGCACCAUCCUUCCAAGGUCCACCGUGAUCAACAUCCACAGCGAGACCUCCGUGCCCGACCAUGUCGUCUGGUCCCUGUUCAACACCCUCUUCUUGAACUGGUGCUGUCUGGGCUUCAUAGCAUUCGCCUACUCCGUGAAGUCUAGGGACAGGAAGAUGGUUGGCGACGUGACCGGGGCCCAGGCCUAUGCCUCCACCGCCAAGUGCCUGAACAUCUGGGCCCUGAUUCUGGGCAUCCUCAUGACCAUUGGAUUCAUCCUGUUACUGGUAUUCGGCUCUGUGACAGUCUACCAUAUUAUGUUACAGAUAAUACAGGAAAAACGGGGUUACUAGUAGCCGCCCAUAGCCUGCAACCUUUGCACUCCACUGUGCAAUGCUGGCCCUGCACGCUGGGGCUGUUGCCCCUGCCCCCUUGGUCCUGCCCCUAGAUACAGCAGUUUAUACCCACACACCUGUCUACAGUGUCAUUCAAUAAAGUGCACGUGCUUGUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-224.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -235.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 138.27

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........(((((...(((((((((.(((......((((........))))..(((.(.((.((((.((.....))((((........))))...............((((((.((((((...((........))....)).))))...))))))...(((((((((.....))))))))).........)))).)).).)))...........))).)))))))))(..((((..(((((((((..((((((((((..((((.((.....))...))))....(((((((((((................))))))))))))))))))..)))....)))))))))..))))..).((((....)))).....(((.((((((.(((((...((((((.......))))((((...........))))....)))))).).)))))).)))(((((((((.............))))))))).....(((((..((.(((((.....(((((.((((.((((.((((.((.((((((......))))))....))...)))).)))))))).)))))....))))).))..))))))))))((.(((.(((.(((((......((((.((....))))))......))))).)))..))))).....

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....,..(((((...(((((((((.(((......((((........)))).....(((({....}))))....|.{({{........}}}}....,,,,,.,,,..,,{((({({{,.....{,..,,,,.,)}....)))))},..,)))}}||.,(((((((((.....)))))))))...,,.....,||,|,.,,|}},..........))).)))))))))({(((((..(((((((((,.((((((((((..((((.((.....))...))))....(((((((((((,(,....,,.......))))))))))))))))))..))).,..)))))))))..{{{(({{{((((,,..||,,.....||,.||{|||.,,,,,..,||||||}}....,))))||{{..,..,{,,..|||,...,)),}}}.,,)))}}}.)),(((((((((.............))))))))).....(((((..((.(((((.....(((((.((((.((((.((((.((.((((((......))))))....))...)))).)))))))).)))))....))))).))..)))))))))).,.,,,.(((.(((((......((({,((....))))))......))))).)))..}},,,,,,..