Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003726.4
Sequence Length
1556 nt
GC Content
0.4955
ACAGGUGCCUCGCGGUGCAGCCGGGUCGCCUUCCAGCCCGUCCGCCUCCCGACCAGGGCCCGCGCCCCGUCCCGCCUCUCUCCCGCCCAGCCAAAUGCAGGCCGCCGCCCUCCCUGAGGAGAUCCGUUGGCUCCUGGAAGAUGCUGAAGAGUUUCUGGCAGAAGGUUUGCGGAAUGAGAACCUCAGCGCUGUUGCAAGGGAUCACAGAGACCAUAUUCUACGGGGCUUUCAGCAAAUCAAAGCCAGGUACUAUUGGGAUUUUCAGCCCCAAGGGGGAGACAUUGGACAGGACAGCUCUGAUGAUAAUCACAGCGGGACUCUUGGCCUGUCCCUCACAUCCGAUGCACCCUUUUUGUCAGAUUAUCAGGAUGAGGGAAUGGAAGACAUCGUAAAAGGAGCUCAAGAACUUGAUAACGUAAUCAAGCAAGGAUACUUGGAGAAGAAAAGCAAAGAUCAUAGUUUCUUUGGAUCGGAGUGGCAGAAGCGAUGGUGUGUUGUCAGCAGAGGUCUCUUCUACUACUAUGCUAAUGAGAAGAGCAAGCAGCCCAAAGGGACCUUCCUCAUUAAGGGCUACGGUGUACGGAUGGCCCCCCACCUGCGAAGAGAUUCCAAGAAAGAAUCCUGCUUUGAACUGACCUCCCAGGAUAGGCGCAGCUAUGAGUUUACAGCUACUAGUCCAGCAGAAGCCAGAGACUGGGUGGAUCAAAUAAGUUUCUUGUUAAAGGAUCUGAGCUCCUUAACCAUUCCAUAUGAAGAGGAUGAGGAGGAAGAAGAAAAAGAAGAGACAUAUGAUGAUAUUGAUGGUUUUGACUCCCCAAGUUGUGGUUCCCAGUGCAGACCCACUAUCUUGCCUGGGAGUGUGGGGAUAAAAGAGCCUACAGAGGAGAAAGAAGAAGAAGAUAUUUAUGAAGUCUUGCCAGAUGAAGAGCAUGAUCUAGAAGAGGAUGAGAGUGGCACUCGACGAAAAGGAGUAGACUAUGCCAGUUACUACCAGGGCCUAUGGGAUUGCCAUGGUGACCAGCCAGAUGAACUGUCCUUCCAACGGGGUGACCUCAUCCGUAUUCUGAGCAAGGAGUAUAACAUGUAUGGCUGGUGGGUGGGAGAACUGAACAGCCUCGUUGGGAUUGUUCCAAAGGAGUAUCUCACCACUGCCUUUGAAGUGGAAGAAAGAUGAAACCCAGGAAAUAUAUUCUUCCCUCUCUCCUGCCUUUAUGAGGAAACUGAUCAUCAAAAGUUCCCACUCCCUACUUCUGCCACCCCACCAACGCCUUGGACUCCUCUCUUUGCUGAAGAGACCCAAGUCUCUUGACACCUCAGAGUGACUGUAAGCUACCAGUAAGACAAGUGGGAAGAGGCACGUUCAUCAAACCUGUUACUAAACCAGCCUAGUCAUAGCUCAUCCCCAUCUCUAAAUGUGUCCACACAACCACAUCUGCCUUUUCCACAAGCUUUUCACAAAGAAGGUGAGAGAGAAGGAAACCUUGGGAGGAGGACAUUACUGGUUGUUCUGGCUGGUUUGAAAAGCACAAAUAAACUUGGGAUGUGGUUCCUUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-481.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -512.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.92
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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