Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003745.2
Sequence Length
1238 nt
GC Content
0.6616
GAACAGAGCGAGCUGCGGCCGUGGCAGCUGCACGGCUCCUGGCCCCGGAGCAUGCGCGAGAGCCGCCCCGGAGCGCCCCGGAGCCCCCCGCCGUCCCGCCCGCGGCGUCCCGCGCCCCGCCGCCAGCGCACCCCCGGACGCUAUGGCCCACCCCUCCGGCUGGCCCCUUCUGUAGGAUGGUAGCACACAACCAGGUGGCAGCCGACAAUGCAGUCUCCACAGCAGCAGAGCCCCGACGGCGGCCAGAACCUUCCUCCUCUUCCUCCUCCUCGCCCGCGGCCCCCGCGCGCCCGCGGCCGUGCCCCGCGGUCCCGGCCCCGGCCCCCGGCGACACGCACUUCCGCACAUUCCGUUCGCACGCCGAUUACCGGCGCAUCACGCGCGCCAGCGCGCUCCUGGACGCCUGCGGAUUCUACUGGGGGCCCCUGAGCGUGCACGGGGCGCACGAGCGGCUGCGCGCCGAGCCCGUGGGCACCUUCCUGGUGCGCGACAGCCGCCAGCGGAACUGCUUUUUCGCCCUUAGCGUGAAGAUGGCCUCGGGACCCACGAGCAUCCGCGUGCACUUUCAGGCCGGCCGCUUUCACCUGGAUGGCAGCCGCGAGAGCUUCGACUGCCUCUUCGAGCUGCUGGAGCACUACGUGGCGGCGCCGCGCCGCAUGCUGGGGGCCCCGCUGCGCCAGCGCCGCGUGCGGCCGCUGCAGGAGCUGUGCCGCCAGCGCAUCGUGGCCACCGUGGGCCGCGAGAACCUGGCUCGCAUCCCCCUCAACCCCGUCCUCCGCGACUACCUGAGCUCCUUCCCCUUCCAGAUUUGACCGGCAGCGCCCGCCGUGCACGCAGCAUUAACUGGGAUGCCGUGUUAUUUUGUUAUUACUUGCCUGGAACCAUGUGGGUACCCUCCCCGGCCUGGGUUGGAGGGAGCGGAUGGGUGUAGGGGCGAGGCGCCUCCCGCCCUCGGCUGGAGACGAGGCCGCAGACCCCUUCUCACCUCUUGAGGGGGUCCUCCCCCUCCUGGUGCUCCCUCUGGGUCCCCCUGGUUGUUGUAGCAGCUUAACUGUAUCUGGAGCCAGGACCUGAACUCGCACCUCCUACCUCUUCAUGUUUACAUAUACCCAGUAUCUUUGCACAAACCAGGGGUUGGGGGAGGGUCUCUGGCUUUAUUUUUCUGCUGUGCAGAAUCCUAUUUUAUAUUUUUUAAAGUCAGUUUAGGUAAUAAACUUUAUUAUGAAAGUUUUUUUUUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-535.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -556.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 340.31
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.(((((((((((.((......((((((((((((...((((.((..((......)).)).)))).((((..(((.((((((.((.....((..((((((((((((((....((((((((((..(....)..))))..((((..((.....))..))))(((.....))).((((........)))))))))).((.......))((((((((..(((((..((((.((.((((.((((...((.....................((.(((((...))))).))..(((((((.(((..((((((((((.........)))).))).))).............(((((((..(((((.....)))))......((((.((.((((((((..((..((((.(((......))).)))).)).))))))))..)).)))).))))))).(((((((.((((.((((((..(((((((((((.((....)))))))).)))...((((((((((.......))))))).)))...))..)))))).)).)).)))))))......))))))))))........)).)))).)))))).).)))((((........)))))))))))))).))).))))).))))))))).))...)).)))))).)))..))))((((((((....))).))))))))))))))))).(((((....((((((((......))))))))....))))).(((.(((((((..(((((((((...............(((((((((...(((((...(((((((((...((((..((((.....))))....)))).))))).))))..............(((.((((((.....)))....)))..))))))))..)))))))))))))))).))))))).)).))).((((.(((...))).)))).)).)))))))).........((((....(((((((....)))))))..))))))).)))))......(((((((.(.(..((((.....))))..).).)))))))(((((((((.((.(((((.((((((...(((......((((...))))......)))....)))))).)))))((((((...))))))....((((((...)))))).....................)).)))))))))...(((((((......))))))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,.,((({((((((((((((((((..(((...(({.,(((((..(((.(...(((((.(((((((..(((.(((...(((......))).))).)))...))))).)).)))))})))..))))).),.},..)))..)))))))))........((((({,(((((...{{.(,.((....},..).}),))).)))))))).....)}}),||}((((((((.((((((.....)))(((((((((((((((((........(((((.((..((((((.{(((((((,(({(((((((,,,|||||||{|||...,||{{|||||{|.},}|{...{{{||,....{((((((..(((((.....)))))......((((.{{.{||||{{{..||,.{{{|,|||......}}),|||||||.}}||||||.,|},||||.}}}||||,(((((((.((((.((((((..(((((((((((.((....)))))))).)))...((((((((((,....}.))))))).)))...))..)))))).)).)).))))))}......|||||||||||.,,,{,,||,.|||,(((({(((,(({{{,...|||}},,}).))})}))}}}}.}}.})))|||||}}},})}})),})))))))))),|||||}}.},))),,))),),)))))).))))))),{(((({(((((....((((((((......))))))))....))))).{{{.{((((((..{{(((((((.....,.......}.(((((((((...(((((...(((((((((...((((..((((.....))))....)))).))))).))))....,,....,,..{{|,||||((,.,,,||}....,,},,)))})))}..)))))))))))))))),),))))).)),))}.((((.(((...))).))))..,,)),,}}}(((((.....((((....(((((((....)))))))..))))........))))}(((((((({.,(((.((((....{((({,...((((..((((..((......))..))))..))))..,,|.....,.,,,..})))....})))))))))))))))..)))))))))).)))))))....,}},)))))))).}}}.....,{{{{,.......||||||.,{{{|{...,,}|||||||,.,.,,))})))),.,....
Back