Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004118.4
Sequence Length
1302 nt
GC Content
0.6413
ACGCCAGCCCUGGAAGCUGAGCCUGACCCAGCAGGUCCCAGCAGCCUGGCAGCCCGGCCAGCAUGCAGCAGCAGCCUCUGCCCGGGCCUGGCGCCCCCACAACUGAGCCAACCAAGCCUCCCUACAGCUACAUCGCCCUUAUUGCUAUGGCCAUCCAGAGCUCACCGGGGCAGCGGGCCACCCUCAGUGGCAUCUACCGCUACAUCAUGGGCCGAUUCGCCUUCUACCGCCACAACCGGCCCGGCUGGCAGAACAGCAUCCGCCACAACCUGUCACUCAACGAGUGCUUUGUCAAGGUGCCCCGCGAUGACCGCAAGCCAGGCAAGGGCAGCUACUGGACGCUGGACCCUGACUGCCACGACAUGUUUGAGCACGGCAGCUUCCUACGCCGCCGCCGCCGCUUCACCCGGCAGACAGGUGCUGAGGGCACCCGGGGCCCCGCCAAGGCACGCCGUGGACCCCUCAGGGCGACCAGCCAGGACCCAGGAGUCCCCAACGCCACGACCGGCAGGCAGUGCUCAUUCCCACCAGAGCUGCCAGAUCCCAAGGGCCUAAGCUUUGGGGGUCUGGUGGGGGCCAUGCCAGCCAGUAUGUGCCCAGCAACCACUGAUGGCAGGCCUCGGCCACCCAUGGAGCCCAAAGAGAUUUCCACGCCCAAGCCUGCAUGCCCAGGGGAGCUCCCCGUGGCCACCUCAUCUUCCUCAUGCCCAGCGUUUGGCUUUCCUGCCGGCUUCUCAGAGGCUGAGAGUUUUAAUAAGGCCCCUACGCCCGUCUUGUCCCCGGAAUCAGGCAUCGGGAGCAGCUACCAGUGUCGGCUGCAGGCACUGAAUUUUUGCAUGGGGGCUGACCCAGGCCUUGAGCACCUCUUGGCCUCAGCAGCCCCCUCCCCUGCACCACCCACCCCUCCAGGCUCACUCCGGGCCCCACUGCCCCUGCCAACUGACCACAAGGAACCCUGGGUUGCAGGUGGCUUCCCUGUCCAGGGAGGCUCCGGCUACCCAUUGGGGCUGACCCCCUGCCUAUACCGGACGCCAGGAAUGUUCUUCUUUGAGUAAAGGCAGCCUCACCUCGGGCAGUCCCUGCAGGUCCCUCACCCUCCGGGCUGAGCCUGGCUCUAGGACCUGAAGAACUCUCGAAGGACCCAGCCCUGGUGAGCCAAGGACAACCACACAGAAAGCCAGGAUUGAAGCGGUGCUCAGCCAGGCCCCUGGGGCCUCCGGACAAACUUGGGGGUGAGGGGAAGCAGGGCCUCUUGGGAUUUACUCUGUGGCUCUCAGGGCCAAUAAAGCCAUGUGAUGAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-537.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -556.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 472.71
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((.(((((((.....(((((.((((((..(((..(((((......)))))..))).((.((((((.((((((..((((((((((((......((((((......(((.......(((...............)))..)))......).)))))..)))))((((((((((.....))))).....))))).......((((((.((.((........))...)).)))))).((((......))))...((((((((...(.(((((...)))))).))))...))))....(((.....)))..)))))))..)))))).((((((..((((..(((.((.((((...........((((.((((.((..........)).))))..))))...((((..((((((.((...((((....((((((..((..((((....((((((...(((.((((..(((....((((......)))).....(((......))).((((..((((..........))))))))(((((((.(((((....))))).)))))))(((.((((((.(((((..((((...(((...)))...)))).))))))))))).))).....))).))))...)))...)))))).....))))))..(((..((((....))))..)))...(((.((..((((.((...(((...((((......)))))))...))))))..))))).........))))))...)))))))))))).)))).....)))))))))..))))..))))))..))))))..))...............((((((((.(..(((((..(((...)))..)))))..)))))))))((((((.((((.((((........(((((.....))))).....((((((((.....((((.((.((...))))))))))))).))).....(((((..(((((((((((.........((((....))))((((((.(((((((.(..((((....))))))))).))).)))))).((((((..((((.((((((.(((((((........((((((...)))))).....))))))).))..........))))...)))).))))))....((....)).........(((.((.((((.((...)))))))).)))..))))))))))))))))....))))))))))))))....)))))).))))).....)))...)))).))))))).........(((......))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,{{,,(((((((..((((,({{{(.,,,,,}|||||,}}||.{|{({{(.{{{,{|||||,.{{(.,..||||,,.|||{||,}||{|||||,,..,,,,..{(,((,.....,((.{{,....{(({.....(({{{....(({.(((|...,,,,.}}|||.,|||||((((((((((.....))))).....)))))......,((((((.{{.((........))...}}.))))))}((((......))))..,,|||{{{{...(.(((((...)))))}.}})}...))))})}}|||.}},.}}}..))))))),,))))))}|,{{||}.|||({.((((((.{((({{{....,..,((((.((((.((.......},.)),)}})..}}}}||,({({..{,|,||}|({{{(((,.,{{((((({,,,,...|||.,,}||{||,.}}|||}|(((..,,.}}}.((((......)))).....(((......))).(((({,{(({.........,)}))))))(((((((,(((((,...|||||,|||||}|(((.((((((.(((((..((((...(((...)))...)))).))))))))))).)))},,,.|||{||||...|}}...}}}},},,...||||||..((({{((({...,}}}}||))},..,{,.,{..((({,({,,.{({|,.{(((,,,..,)}}}|||,{,|||}}}}}))))).........|||},,...)))}|,}}||||.|||}....,||||,,|||.{||||..}|||||{{||}}|},})),,}}......|||,.((((((((.{..(((((..(((...)))..)))))..})))))))),,{{{{|{{{{.{{{{........(((((.....||||}.....||||{{||....,|{||.|.,||...}}))))))))))).|||{{{{{(,,,.}}}}}||||||||||.,}|},,|||||||.}}}}{{((({.{(({|{{.{..((({....}}}||}})}.))).)))))|,{,.,{{,,|||},||||{{.(((((((,,......((((((,,,)))))).....))))))).,}.,,,}}}},})),},||}}||||||}}},,..||....}}.....,...|||,||.{{|,|||.,.)))))))),|||,,.,})))))),}}}},,..,.)))))))))))))),)),))))),})))))}}},.,}},}})))}.))))))),......,,|||,,,...,,,.
Back