Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004131.6

Sequence Length

891 nt

GC Content

0.5309

AGCUCCAACCAGGGCAGCCUUCCUGAGAAGAUGCAACCAAUCCUGCUUCUGCUGGCCUUCCUCCUGCUGCCCAGGGCAGAUGCAGGGGAGAUCAUCGGGGGACAUGAGGCCAAGCCCCACUCCCGCCCCUACAUGGCUUAUCUUAUGAUCUGGGAUCAGAAGUCUCUGAAGAGGUGCGGUGGCUUCCUGAUACGAGACGACUUCGUGCUGACAGCUGCUCACUGUUGGGGAAGCUCCAUAAAUGUCACCUUGGGGGCCCACAAUAUCAAAGAACAGGAGCCGACCCAGCAGUUUAUCCCUGUGAAAAGACCCAUCCCCCAUCCAGCCUAUAAUCCUAAGAACUUCUCCAACGACAUCAUGCUACUGCAGCUGGAGAGAAAGGCCAAGCGGACCAGAGCUGUGCAGCCCCUCAGGCUACCUAGCAACAAGGCCCAGGUGAAGCCAGGGCAGACAUGCAGUGUGGCCGGCUGGGGGCAGACGGCCCCCCUGGGAAAACACUCACACACACUACAAGAGGUGAAGAUGACAGUGCAGGAAGAUCGAAAGUGCGAAUCUGACUUACGCCAUUAUUACGACAGUACCAUUGAGUUGUGCGUGGGGGACCCAGAGAUUAAAAAGACUUCCUUUAAGGGGGACUCUGGAGGCCCUCUUGUGUGUAACAAGGUGGCCCAGGGCAUUGUCUCCUAUGGACGAAACAAUGGCAUGCCUCCACGAGCCUGCACCAAAGUCUCAAGCUUUGUACACUGGAUAAAGAAAACCAUGAAACGCUACUAACUACAGGAAGCAAACUAAGCCCCCGCUGUAAUGAAACACCUUCUCUGGAGCCAAGUCCAGAUUUACACUGGGAGAGGUGCCAGCAACUGAAUAAAUACCUCUUAGCUGAGUGGAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-293.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -310.58

Frequency: 0.0000

Diversity: 215.81

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((((..(((((((..((((....)))).))).......))))..(((((((((((((((((.(((((....((((((((..(.(((((...((((((((((.(((((((..........((((((((.((.(((((((((((.....))))))...)))))..)).)).)).))))))))))).)).((((((.....)))))).(.((((......(((((((((...(((((............(((((...)).)))............)))))...)))))))))......)))).).........))))))...................))...)))))..)..)))).))))...))))).)))).).)))))).)))))).(((.((((.(((...((((.((((((((.(((.....((((.(((...))).)))).....))))).))))))((((((((((.....)))))).((((......)))).......((((.(((.(..((((....(((((((.((((((......)).))))...............(((....)))((((((..((((.((((((((((((((((..........((((((...)))))).)))))).((((.((((((.....)))))).)))).........)))))))))).))))..)))))).....(((...))))))))))....))))..).)))))))((.(((..........)))))....(((.((.......)).)))......))))((((.(((((.(((.....)))((((((......)))))).))))).)))).)))))))))))..))).........(((......)))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

........((((((,.(((,((,{..|.}}.{(({.....,.(((..(((((((((((((((((.(((((....((((((((..(.(((((...,,(((((({{.(((((((.{{{.,..,,{{((({{,.,,.|||{,,{{{|,,|,,.,}})}|{{{|}}}},})),,}.)).))))))))))).)).{(((((.....)))))}.{.((((......(((((((((...(((((.....,,.....{(((,...}}.,,,...,........)))))...)))))))))......)))).}.........))))))...................)}...)))))..)..)))).))))...))))).)))).)})))))),,))))).))).|,||}}}}((((({,.((((((((.(((.....((((.(((...))).)))).....))))).)))))).,..)))))).,}.)))..)))))).....{{{(({......,(,,{(((({({..,((..{{(((({((.,,,(({..{{{{}|{{|||{{{{{.,,,,,,...{{{....}},((((((..((((.((((((((((((((((..........{(((((...,})))),)))))).((((.((((((.....)))))).)))).........)))))))))).))))..)))))),..{,{{{...}}})})))},{{{{||,,...}))))),.,,.(((..........))),,....(((.{{......,)}.)))......,||.{{{|,|{{{{.{{,.....,}}{{|||{...,,,)))))),)),))})}}},||{{|,}}.}}..))).,,...)))))))},}.))}))),....