Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004178.5
Sequence Length
1405 nt
GC Content
0.5851
CUCUCCAGCUGCGACACAGAUGGCGCGCGGGCUCUUGGGUUCUGUAGUUUUCUCGCGAUCCAAAAGGCUCCGUGCCCAAAGCAAAUGCUGGCCGCCAACCCAGGCAAGACCCCGAUCAGCCUUCUGCAGGAGUAUGGGACCAGAAUAGGGAAGACGCCUGUGUACGACCUUCUCAAAGCCGAGGGCCAAGCCCACCAGCCUAAUUUCACCUUCCGGGUCACCGUUGGCGACACCAGCUGCACUGGUCAGGGCCCCAGCAAGAAGGCAGCCAAGCACAAGGCAGCUGAGGUGGCCCUCAAACACCUCAAAGGGGGGAGCAUGCUGGAGCCGGCCCUGGAGGACAGCAGUUCUUUUUCUCCCCUAGACUCUUCACUGCCUGAGGACAUUCCGGUUUUUACUGCUGCAGCAGCUGCUACCCCAGUUCCAUCUGUAGUCCUAACCAGGAGCCCCCCCAUGGAACUGCAGCCCCCUGUCUCCCCUCAGCAGUCUGAGUGCAACCCCGUUGGUGCUCUGCAGGAGCUGGUGGUGCAGAAAGGCUGGCGGUUGCCGGAGUACACAGUGACCCAGGAGUCUGGGCCAGCCCACCGCAAAGAAUUCACCAUGACCUGUCGAGUGGAGCGUUUCAUUGAGAUUGGGAGUGGCACUUCCAAAAAAUUGGCAAAGCGGAAUGCGGCGGCCAAAAUGCUGCUUCGAGUGCACACGGUGCCUCUGGAUGCCCGGGAUGGCAAUGAGGUGGAGCCUGAUGAUGACCACUUCUCCAUUGGUGUGGGCUCCCGCCUGGAUGGUCUUCGAAACCGGGGCCCAGGUUGCACCUGGGAUUCUCUACGAAAUUCAGUAGGAGAGAAGAUCCUGUCCCUCCGCAGUUGCUCCCUGGGCUCCCUGGGUGCCCUGGGCCCUGCCUGCUGCCGUGUCCUCAGUGAGCUCUCUGAGGAGCAGGCCUUUCACGUCAGCUACCUGGAUAUUGAGGAGCUGAGCCUGAGUGGACUCUGCCAGUGCCUGGUGGAACUGUCCACCCAGCCGGCCACUGUGUGUCAUGGCUCUGCAACCACCAGGGAGGCAGCCCGUGGUGAGGCUGCCCGCCGUGCCCUGCAGUACCUCAAGAUCAUGGCAGGCAGCAAGUGAAGCCCCAGCUGGACUCAUGGAUGUGCACCCUUUGCUCCCUGCUCUUUCUGCCUCUGGGCUCAUGUAUCUGCGCAGCUCUGGUACCCUCUGUGGGUGCCAUCUCUACCUCUGACACAGACUGCCUGCCUUGAAGCUGAGAAGGCACAGGGCAAGGAGCCAAGGACCACAGAGCCUCAGCCAGCCCAGGAUCCGUCCUCAUUUUAUUGGUGAUGAUGAAUGGGAAUGAAAUCAGGGGGCUGUCUACUAGAGCCUGGAAUAAAUAUGCUGCUUUGUGGAUUUUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-564.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -589.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 311.07
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((.((.(((((...((((.((.((((((((((((((((((.((.((((.((.........(((.....)))...(((....)))((((((((.((...(((.....((.((((((.((((((((.((((((((((((((..((((.((((((((((((.(..((((((....((.(.(((((..(.(((.((((......((.((...(((....)))..)).)).....))))...))).)..)))))).)).))))))..)....)))).))))...(((((((.........))))))).((((((..((((.((((.(..(((((((((((((.(((((......(((.....)))......)))))....(((...)))(((.....((((....)))).....))).(((......)))..)))))..))))).)))..)))).).)..)))..)))))))))).))))......)))).)).....)))....)))))))))))))))))))))))).....)).)))))))))).)))).)))))).)))))))))))))).))..((.....))..........))))....)))))))))))).(((((...)))))(((((((...)))))))(((((((.(((((((((...(.((((((......)))))).)....((((((((((((((..((((.(((((.((((..(((.((((((((((..((.(((((....((((..((((.((...))))))))))))))).)).....(((((((((((..((((((((((.(((((((........))).)))).......((((......))))..((((...)))))))).)))))))))))))))))............(((((((........))))))).)))))..))))).)))))))))))).)))))))).((((.((.((.((((((((((((((...))))))))...)))))).))))))))))))))))))(..((((((.....((((((((......))).)))))..((((((.((((((..((...........))..)))))).)))))).(((((((((((.(((((.(((.....((((...((((.(((((.((((((...(((((((.((((((.(((...(.((((...((((((((.....))))))))........((((...))))))))))))..)).)))).)).))))).)))))).))))).))))..))))))).).))))((.((((.....((((.(((((.....))))).))))..))))..)).......)))))).)).)))))))))..)..........))))))))).)))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.(((((.((.(((((...((((.((.((((((((((((((((((.((.((((.((({.,.....(((.....)))...{((....))}{((((((,.,,..}||,....,{(.((((({{((((((((,(((((((({{{,{{.,,(((.((((((((((((.{..((((((....((.(.(((((..(.(((.((((......((.((...{((....)))..)).)).....))))...))).}..)))))).)).))))))..)....)))),,)))...(((((((.........))))))).((((((,,(({{,((({.{..({{{{{(((((((,{{{{{......,||,,,..,|,.{({{{{..,..})}}}}..,}}.})|,,..}}}|}}||||,,|{{{|.,|,.{{||{,,..}}||,}}}|}..}}))).}))..})}).),}..)))..)))))))))),))||{{{...,)))})}.,..,}}},,..}))))))))))))))))))))))).,...))})))))))))).)))).)))))).)))))))))))))).))..((.....))..........))))....)))))))))))).|,,,,...,,},|(((((((...))))))){((((((.(((((((((..,(.((((((......)))))).,....((((((((((((((,.((((.(((((.((((..(((.(((((({{{{.,((.(((((....((((..((((.((...))))))))))))))).)),....{((((((((((..((((((((({,(((((((........)))}})))}......((((......))))..((((...))))}))).))))))))))))))))|{{{{(.......(((((((.,....,.)))))))})))))..))))).)))))))))))).))))}))).((((.({,((.((((((((((((((...))))))))...)))))).)))))))))))))))))}(,.((((((,...,(((((,((.,....))).))))).,((((((.((((((..((..,,...,,..))..)))))).)))))).{((({((((((.(((((.((...({.((((...((((.(((((.((((((...(((((((.((((((.({{...(.((((...((((((((.....))))))))........,{{|...))))))))}}))..)),}))).)),,)))).)))))).))))).))))..))))...))..))))))|{{{..,,.((((,(((((....,}}})),)))},,))))..}}.......)))))).}}.)))))))))..,..........))))))))).))))))}..
Back