Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004219.4
Sequence Length
715 nt
GC Content
0.4573
ACCGCGGCCUCAGAUGAAUGCGGCUGUUAAGACCUGCAAUAAUCCAGAAUGGCUACUCUGAUCUAUGUUGAUAAGGAAAAUGGAGAACCAGGCACCCGUGUGGUUGCUAAGGAUGGGCUGAAGCUGGGGUCUGGACCUUCAAUCAAAGCCUUAGAUGGGAGAUCUCAAGUUUCAACACCACGUUUUGGCAAAACGUUCGAUGCCCCACCAGCCUUACCUAAAGCUACUAGAAAGGCUUUGGGAACUGUCAACAGAGCUACAGAAAAGUCUGUAAAGACCAAGGGACCCCUCAAACAAAAACAGCCAAGCUUUUCUGCCAAAAAGAUGACUGAGAAGACUGUUAAAGCAAAAAGCUCUGUUCCUGCCUCAGAUGAUGCCUAUCCAGAAAUAGAAAAAUUCUUUCCCUUCAAUCCUCUAGACUUUGAGAGUUUUGACCUGCCUGAAGAGCACCAGAUUGCGCACCUCCCCUUGAGUGGAGUGCCUCUCAUGAUCCUUGACGAGGAGAGAGAGCUUGAAAAGCUGUUUCAGCUGGGCCCCCCUUCACCUGUGAAGAUGCCCUCUCCACCAUGGGAAUCCAAUCUGUUGCAGUCUCCUUCAAGCAUUCUGUCGACCCUGGAUGUUGAAUUGCCACCUGUUUGCUGUGACAUAGAUAUUUAAAUUUCUUAGUGCUUCAGAGUUUGUGUGUAUUUGUAUUAAUAAAGCAUUCUUUAACAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-193.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -209.04
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.74
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((..(......)..)))))((((((((...(((..((((.((((...((.(((((((((((((((....((.(((..(((((((((.((....)).))))).))..((((((((.....(((((((..(((..........(((.((..(.((((..(((....((((.....(((.....)))..))))....)))..)))).))).))).(((((((((........)))))))))........((((((((.(((((((((((((........(((....))).........))))....))))))))).........((((..........))))........))))))))))).))))))).....)))))))).......((((.....))))...((((..((((........))))..))))..(((.(((((.(((.(((((((.(....((((..((.((((((.(((((((....(((((...)))))))))).))......(((((...)))))((((....(((((....)))))..)))).)))))))).))))..)))))))).)))......))))).))).....(((((.......))))).......))..))).))..))))))))....................)))))))..)).....)))).)))).....)))...)))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((..{......)..)))))(((((((({..(((..{{{,.((({.{,((.{{(({{(((((((((,{{.{(,({{..(({{(((((.((....)).))))).}}..((((((((...,.(((((((,.((,,,,,,...,.,,,..,..|,{||{,}|||,...||||,,.....{{{{{{|},.,))))},..|||..||||..(({{{{.,((({,{{{..,,,.,}))))}))))...,},,,((((((((.(((({{{((((||........{((....))).........}}}}....}||||||}}.,,......||.|.},,,}}.,|}},...,,....)))))))))}}.))))))).....)))))))).{{,..{(({...,)))}}}..,((((..{(((.,......})))..)}))..{{{.{{{{{,(((.(((((((.(....((((..((.((((((.(((((((....(((({...)))))))))).))......(((((...)))))((((....(((((....)))))..)))).)))))))).))))..)))))))).)))...,}.}}||}.}|||||,|}}}},..,))))}}})),..,,,,})..})).}}.}}))))))},...........,.,,,...,))))))..}}.,,}.}}}),}))},,...))).}))))))))).
Back