Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004489.5
Sequence Length
1176 nt
GC Content
0.5723
GGAGCCGCUGAGAAAGCGCAGAGAAGGCGGGCCCCGUCUGAGGUCUGGCAGUCAGAGACAGCCGGGCGCCCACGGCCCGAGCGCCCACGGCAGCACCAUGCCCGCACUCCUGGAGCGCCCCAAGCUUUCCAACGCCAUGGCCAGGGCGCUGCACCGGCACAUUAUGAUGGAGCGGGAGCGCAAGCGGCAGGAGGAAGAAGAGGUGGAUAAGAUGAUGGAACAGAAGAUGAAGGAAGAACAGGAGAGAAGGAAGAAAAAGGAGAUGGAAGAGAGAAUGUCAUUAGAGGAGACCAAGGAACAAAUUCUGAAGUUGGAGGAGAAGCUUUUGGCUCUACAGGAAGAGAAGCACCAGCUUUUCCUGCAGCUCAAGAAAGUUUUACAUGAGGAAGAAAAACGGAGGCGAAAGGAACAGAGUGACCUGACCACCCUAACAUCAGCUGCAUACCAGCAGAGCCUGACUGUUCACACAGGAACUCAUCUCCUCAGCAUGCAGGGGAGCCCUGGAGGACACAAUCGCCCAGGCACCCUCAUGGCAGCUGACAGAGCCAAACAAAUGUUUGGACCCCAAGUGCUUACGACCCGGCACUACGUGGGCUCAGCAGCUGCUUUUGCAGGGACACCAGAGCAUGGACAAUUCCAAGGCAGUCCUGGUGGUGCCUAUGGGACUGCUCAGCCCCCACCUCACUAUGGGCCCACACAGCCAGCUUAUAGUCCUAGUCAGCAGCUCAGAGCUCCUUCGGCAUUCCCUGCAGUGCAGUACCUAUCUCAGCCACAGCCACAGCCCUAUGCUGUGCAUGGCCACUUUCAGCCCACUCAGACAGGUUUCCUCCAGCCUGGUGGUGCCCUGUCCUUGCAAAAGCAGAUGGAACAUGCUAACCAGCAGACUGGCUUCUCCGACUCAUCCUCUCUGCGCCCCAUGCACCCCCAGGCUCUGCAUCCAGCCCCUGGACUCCUUGCUUCCCCCCAGCUCCCUGUGCAGAUGCAGCCAGCAGGAAAGUCGGGCUUUGCAGCUACCAGCCAACCUGGCCCUCGGCUCCCCUUCAUCCAACACAGCCAGAACCCGCGAUUCUACCACAAGUGACCAUCAGAUUAUAUCUUCAACACCACACCCCCCACCCCAUCGUGGGUGAGGGUAUCCCCUGUGUGUCCCAGGCCAAUAAAAUCUACCUGCCACUG

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-406.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -428.34
Frequency: 0.0000
Diversity: 257.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((.....))))(((.((..((((((...(((((..((..(((.(((...))).)))((((((.(.......).))))))))..))).))...))))))..)))))..(((((((..((..((((.((..((((((.((((...)).))))).)))..)).))))))))).)))).((.((((((.(((......((((...((((((((((.((....((((((((....(((((.(((..(((((...((((((.....((((((.(((......((((((.(((.(((((...((((..(((((.((((((((((..((.((((......))))...))..)))))))))).)))))..)))).)))))................((....))..((((...((((..((((........((((((((((((......))))...)))).))))....)))).))))...))))((((.(((((((..(((.(((..((.....))..)))))).))))....)))))))......((((((....))))))...(((..(((((..(((..(((((((((((((((.((..(((((..(((((((((((((((.((.((((....))))..))....))))))(((((...((((..(((((((......((.(((((((((...........)))))))))...))......)))..))))))))..)))))))))))))).)))))..))......((((..((.(((((.....))))))).)))).......))))))).....((((((......))))))))))))))..))).......)))))..)))....((((....))))...))))))))).....))).))))))(((.....)))....(((((..(((....)))..))))).)))))).)))))......))))))))((....))((((.(.(((...((((((.((.((........)).))))))))))))))))..)))))))).......((........)).............))..)))))).......))))...))))....(((.(((((......))))).))).....((((.......)))).........))).)))))).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,.((((.....))))(((.{{.,((((((.,,({{{(..{({{(((.(((...))).)})|||{{{|,..,},.,}.}}}}},.,||)|}.,,...)))))).,)))}}..(((((((..((,.{(((.({..((((((.(({{...}).))))).)))..}).))))))))).)))).((.((((((.(({....,,((((,{(((..((((((.,,....((((((((....(((((.(((..(((((...((((((..,,.((((((.(((....,.((((((.(({.(((((...((((..(((((.((((((((((..,{,((((.......})),.}),..)))))))))).)))))..)))).))))}....{{{{,,{.....,{{,(({{,.{({....((((..{(((........{(((((((((((......))))...)))).)))}....)))).)))).,|}}}|((((.((((((({.({({(((..((.....))..)))))).)))),..,)))))))}..|,,((((((....))))))..|({{,{((((,..,,,..||||||,,{{(((({.{{..(((((..(((((((((((((((.((.((((....))))..))..,.))))))(((((...((((..(((((((......{{.(((((((((...........)))))))))...})...,..)))..))))))))..)))))))))))))).)))))..},......((((..(,{(((((.....))))))).))))..,,.,.}))))}).....{{{{||,,,,,.|}}|||}||||||}.,|||{,{{{...,))),.,)),.,,,||,.,,,)}))}.,))))))))).,,..))).)))))){{{.....}))....(((((..(((....)))..))))).)))))).)))))......))))))))((....))((((.{.(((...((((((.{{,({.,,.....)),}}))))))))),))))..)))))))).......{,.,,,,...}}..,}}}.......)),.))))))..}}}}.})}},..,,}}..,,{((,(((((......))))).))).....((((.{....,)))).........))).)))))).)).
Back