Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004493.3

Sequence Length

954 nt

GC Content

0.5744

AUCCCGUGGAGUGGCCGGCGACAAGAUGGCAGCAGCGUGUCGGAGCGUGAAGGGCCUGGUGGCGGUAAUAACCGGAGGAGCCUCGGGCCUGGGCCUGGCCACGGCGGAGCGACUUGUGGGGCAGGGAGCCUCUGCUGUGCUUCUGGACCUGCCCAACUCGGGUGGGGAGGCCCAAGCCAAGAAGUUAGGAAACAACUGCGUUUUCGCCCCAGCCGACGUGACCUCUGAGAAGGAUGUGCAAACAGCUCUGGCUCUAGCAAAAGGAAAGUUUGGCCGUGUGGAUGUAGCUGUCAACUGUGCAGGCAUCGCGGUGGCUAGCAAGACGUACAACUUAAAGAAGGGCCAGACCCAUACCUUGGAAGACUUCCAGCGAGUUCUUGAUGUGAAUCUCAUGGGCACCUUCAAUGUGAUCCGCCUGGUGGCUGGUGAGAUGGGCCAGAAUGAACCAGACCAGGGAGGCCAACGUGGGGUCAUCAUCAACACUGCCAGUGUGGCUGCCUUCGAGGGUCAGGUUGGACAAGCUGCAUACUCUGCUUCCAAGGGGGGAAUAGUGGGCAUGACACUGCCCAUUGCUCGGGAUCUGGCUCCCAUAGGUAUCCGGGUGAUGACCAUUGCCCCAGGUCUGUUUGGCACCCCACUGCUGACCAGCCUCCCAGAGAAAGUGUGCAACUUCUUGGCCAGCCAAGUGCCCUUCCCUAGCCGACUGGGUGACCCUGCUGAGUAUGCUCACCUCGUACAGGCCAUCAUCGAGAACCCAUUCCUCAAUGGAGAGGUCAUCCGGCUGGAUGGGGCCAUUCGUAUGCAGCCUUGAAGGGAGAAGGCAGAGAAAACACACGCUCCUCUGCCCUUCCUUUCCCUGGGGUACUACUCUCCAGCUUGGGAGGAAGCCCAGUAGCCAUUUUGUAACUGCCUACCAGUCGCCCUCUGUGCCUAAUAAAGUCUCUUUUUCUCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-363.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -382.13

Frequency: 0.0000

Diversity: 342.02

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((.(((..((((((((((((((((.(((((((....(((((((.(((((.((..((((....))))(((....))).(((.((((((((((.((((((((((..(((((...)))))..).))))))))))))......(((((((.....))))))).))))))).)))....((((.(....)))))(((....))).(((((((..((((((((((((..(((..((....))..)))..)))......((((...((((((((.(..((.(((((((((((.(((((.......))))))))).)))......)))).))......).)))))))).....))))((((...)))).....((((((((((((.(((((((.((((((.................))).))).))))))).((((....((........))....))))...((((((((((...........(((((.((((((.....((((((..((((((.((((.((((((((....(((...((((((..(((((((((......)))))))))...((((......))))...((...))(((((((....)))))))..((((.((.(((....)))..)).))))..))))))...)))))))))))....)))).))))))....))))))...)))))))))))))))))))))((((....))))(((.....))).)).))))))))))(((((....)))))))))))))).))))))))).))))).)))..)))).(((((........))))).........))))))).))(((..(((((((((.((((((.......))))))...)))))))))..)))..))))))))))...))))..))).))......((((......((((...))))....))))

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....({{((,{((..((((((((((((((.,{,,,,,{|{({.{{{,({{(((((((((((((((....}}}{((({.{{}||,(((.(((((((((,{((((((((((..(((((...)))))..),,))))))))))}......(((((((.....))))))).))))))).)))..,..{{,.({,{{|..||{{|||||)||,(((((((..{(((((((((((..(({,{((,...}}.,|||,.}}}.......{((...((((((((.({((.{(((.((((((,{(((((.,....,))))))))).)))...}}}),),.|,......},)))))))),,...}}||((({...})))},.{.(((({((({(,|.|,|||,{{((({{,.,,...,|}...,}}{|||,{{||{||,||,|{(((({{,......{{{{{{.,{{.{{{|...{{{{(((((({{{{.,{{{,.,,|||}|((,(({{{..(,((((({(((({(.{,((,,({{,,{{.,,|{{{,..{{{{||,.{((((((((......)))))))))}},{,||}}}}}})),)..})))}.)),|||||}}}}},}}))))}.||||}||}|||,..,)))..,)),)))}})),}))})}),,}})))))).}}})))}|))}})),.}.)))))),..}}})))))}||||||||||}|{{{{...,})}}|||||,.,.)),},.}}}))))}}}(((({....}))))))))))))).))))||},|{|||||.,,}.,))}},)))|,{{{{{{{{,,{||{{{{.........,,,,)))))}}|||||||||.((((({.....,,|}|}}}...)))))},},}})))..))))))))))..,))))..))),}}})},,.||||,.....,,,|...}},,....))).