Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004510.4
Sequence Length
1952 nt
GC Content
0.4693
ACAGACUUCCUGUUUUGCCUGCUAGCAUCUCCCUGUAACUCUCCCAAUCUUGAGGAGUGAUCCCUGUCCCAGCCCCUGGAAAGGGGCAGGAACGACAAACUCAAAGUCCAGGAUGUUCACCAUGACAAGAGCCAUGGAAGAGGCUCUUUUUCAGCACUUCAUGCACCAGAAGCUGGGGAUCGCCUAUGCCAUACACAAGCCAUUUCCCUUCUUUGAAGGCCUCCUAGACAACUCCAUCAUCACUAAGAGAAUGUACAUGGAAUCUCUGGAAGCCUGUAGAAAUUUGAUCCCUGUAUCCAGAGUGGUGCACAACAUUCUCACCCAACUGGAGAGGACUUUUAACCUGUCUCUUCUGGUGACAUUGUUCAGUCAAAUUAACCUGCGUGAAUAUCCCAAUCUGGUGACGAUUUACAGAAGCUUCAAACGUGUUGGUGCUUCCUAUGAAUGGCAGAGCAGAGACACACCAAUCCUACUUGAAGCCCCAACUGGCCUAGCAGAAGGAAGCUCCCUCCAUACCCCACUGGCGCUGCCCCCACCACAACCCCCUCAACCAAGCUGUUCACCCUGUGCGCCAAGAGUCAGUGAGCCUGGAACAUCCUCCCAGCAAAGCGAUGAGAUCCUGAGUGAGUCGCCCAGCCCAUCUGACCCUGUCCUGCCUCUCCCUGCACUCAUCCAGGAAGGAAGAAGCACUUCAGUGACCAAUGACAAGUUAACAUCCAAAAUGAAUGCGGAAGAAGACUCAGAAGAGAUGCCCAGCCUCCUCACUAGCACUGUGCAAGUGGCCAGUGACAACCUGAUCCCCCAAAUAAGAGAUAAAGAAGACCCUCAAGAGAUGCCCCACUCUCCCUUGGGCUCUAUGCCAGAGAUAAGAGAUAAUUCUCCAGAACCAAAUGACCCAGAAGAGCCCCAGGAGGUGUCCAGCACACCUUCAGACAAGAAAGGAAAGAAAAGAAAAAGAUGUAUCUGGUCAACUCCAAAAAGGAGACAUAAGAAAAAAAGCCUCCCAGGAGGGACAGCCUCAUCUAGACACGGAAUCCAAAAGAAGCUCAAAAGGGUGGAUCAGGUUCCUCAAAAGAAAGAUGACUCAACUUGUAACUCCACGGUAGAGACAAGGGCCCAAAAGGCGAGAACUGAAUGUGCCCGAAAGUCGAGAUCAGAGGAGAUCAUUGAUGGCACUUCAGAAAUGAAUGAAGGAAAGAGGUCCCAGAAGACGCCUAGUACACCACGAAGGGUCACACAAGGGGCAGCCUCACCUGGGCAUGGCAUCCAAGAGAAGCUCCAAGUGGUGGAUAAGGUGACUCAAAGGAAAGACGACUCAACCUGGAACUCAGAGGUCAUGAUGAGGGUCCAAAAGGCAAGAACUAAAUGUGCCCGAAAGUCCAGAUUGAAAGAAAAGAAAAAGGAGAAAGAUAUCUGUUCAAGCUCAAAAAGGAGAUUUCAGAAAAAUAUUCACCGAAGAGGAAAACCCAAAAGUGACACUGUGGAUUUUCACUGUUCUAAGCUCCCCGUGACCUGUGGUGAGGCGAAAGGGAUUUUAUAUAAGAAGAAAAUGAAACACGGAUCCUCAGUGAAGUGCAUUCGGAAUGAGGAUGGAACUUGGUUAACACCAAAUGAAUUUGAAGUCGAAGGAAAAGGAAGGAACGCAAAGAACUGGAAACGGAAUAUACGUUGUGAAGGAAUGACCCUAGGAGAGCUGCUGAAGAGUGGACUUUUGCUCUGUCCUCCAAGAAUAAAUCUCAAGAGAGAGUUAAAUAGCAAGUGAAUUUCUACUACCCUCUCAGUCACCAUGUUGCAGACUUUCCCUGUCUGGAGGCUCACCUUAGAGCUUCUGAGUUUCCAAGCUCUGAGUCACCUCCACAUUUGGGCAUGGCAUCUUCAAAACAAUUAAUUUGCAUAGUUAAUUUGGGAUGGGGAAGCAAAUGACUCUAAAAUAAAAAUUAAAUGAAAAAGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-513.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -551.97
Frequency: 0.0000
Diversity: 519.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.((((((..(((((..(((((.......((((((.(((((((...(((.(((.(......((((((.((((((....)))))).))...)))).......).))).(((((((((((((((((((((((........)))))))....((((....((((((((((((..(((((((((....))...................((((....((((.(((.(((....(((((...((.........))...)))))...)))))).))))..))))....)))))))...(((((...((((...........))))...)))))..((((.........))))))))))))).)))))))..))))........)).)))))))))))))..))).)).)).))))))..(((((((..(((((..(((((((.......))..)))))..)))))...........))))))).....)))))...)))))))))))))....((((.(((...(((.((((((((.................(((.(..((((((.((.(......).))...))))))))))..((((((........)).)))).((((((..(((..((((((((.....))).((((((((((((.((.((((........)))).))((((.....)))).(((.......(((((((..((((.........((.(((......(((....))).............(((((.(((((.....))).)).)))))..((((((((((((......(((............)))..((((........))))(((.(((((((.((.((.......((((....))))..........))...))..))))))).)))((((((.....))))))............(((............(((((...(((.((..((((.....))))...............((((....)))))))))...)))))..........)))...............))).)))))))))))).)).......))))....))))))).....)))))))).))).)))).......)))))...(((((.(((((.....(((((((((......)))).)))))))))))))))...............((..(((......)))..)).......)))..))))))......)))))))).)))...))).))))......((((..((.(((((((.((((...(((((((((.((....((.((((((..(((.....)))((((((((..(((((.(.....((((...........)))).....).))....................((.(((.....((((......(((......)))....))))......))).))(((.(((((((.(((..(((...))).))).))))).)).)))....)))..))))))))(((((((...((.((((.((((((...........)))))).....(((((((.((((.....))))...))))))).....(((((....))))).....((((....))))(((...(((.(((..((((.........((((.......))))....(((......)))....((((((((....))))).)))))))))).)))))).....(((.((((....)))).))).......((((......)))).)))).))..)))))))....(((((.......)))))(((((((......)))))))))))))))....)).))))))))))))))))))))))...((.((((((...(((((((((.....)))))).)))...)))))).))......)))).........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,{.{{{{{{,,{((((.,(((((.......((((((.(((((((....||.|||,.,.|||,{(((((.((((((....)))))).))..,|||,...,,...})},.(((((((((((((((,(((((((........)))))))..,,|{{{....,(((((((((((..(((((((({...{{,.........},........{(((....((((.(((.(((....(((((,,,(,......,..))...)))))...)))))).))))..)))}...,)))))))}..{{{{{..,||||,,...,,...|||||...,}|||.{((,,......,},,)))))))))))),}},})},..)))}........)).)))))))))).....})).)).)).))))))..(((((((..({(((,,(((((((.......))..}))))..))}}),,,,,,.....))))))).....}}))}...)))),})))}|||{{{.((((.{((...(((.((((((((........,,,..,,..,,..{,,((((((.((.{,.....}.}),,,)))))){{((..,,,,,{.},,}...,|||||}.({{{{{..{{{.|||||,||{,,...}}|.((((((((((((.((.((((........)))).}}((((.....)))).{({.......{((((((..((((,....,,,.||.{{,.,....{{{....|||..{,...}},}}.|{{{{.(((((,.,,.}}},}),))))}.{((((((((((((......(((............})).,((({.,.....,)))}(((.(((((((.((.{{.......((((....))))..........))...))..))))))).))){(((((.....)))))|{{......},,,}}.............(((((...(({{((..((((.....||||...............,|||}..,)))})))))...)))))......{{..,}}........,},....))).)))))))))),,,|,.......))})....})))))).....}}}))))).)))}}))),,.....)))}....(((((.(((((.....(((((((((......)))).)))))))))))))))...........||...|,,{||,,....|||,|}}.,,....,}}..}))))}......)))))))).)))..,))).)))){{{{{..((({.(({(((((({{((({..,(((((((((.{(,...{,.,,{{{{.,,(((,{{{|||((((((({..((((({{,....((((...........)))).,,,,,{||,..,{,..............{{.{{,.....|||{.,,...(((......))}.|},)}}}......}}}.},(((.(((((((.(((..(({...))).))).))))).)).)))...,,||{{}}|}}|||,{{{{{|,}.{|.,|||,,{||,............,,,,.....,,|{{{{|{.|{{(.....}}),...})))))),....(((((....))))).....{{{{...||,,..,,...{{,.{{{.,{{{,....{{{..,{||,......)))).,..(((......))).,{{{((({(((....))))).))))))}}}}.)))))}..,..,,..((((....)))),|}.....,,.((({......)))).))))})},,)})))),,,,.(((((.......)))))(((((((......)))))))))))}}}},..,)).))))))))))))))))))))},..}}).))}},....,((((((((.....))))))))})))))))))),))...................................
Back