Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004764.5
Sequence Length
3897 nt
GC Content
0.4332
GUUACUGGGCGUAUGGCGUACAGACACGAGGCCGGCGCCCGGGAGGCGGUGUUCAUCCGCCCGGGAAAAGAGCGCCUGUUGCUCGCUGCCCGCGUGUCCCUGGCUCUCUCGGGAACCCAGCGCCGAAGGCGAGGUGGGCGCGGGCCGAAGGAGGUCCUGGGAGGUCGGCGGCGCGGAGGGAUCUCCGCGGGAGCCGUUGGGGCUGUUGGCCUCGGGCUGAGGUGCAAGGACCAGGACUAGGGCGAGGGCAGCGGUCCAAGAAAUAGAAAACAAUGACUGGGAGAGCCCGAGCCAGAGCCAGAGGAAGGGCCCGCGGUCAGGAGACAGCGCAGCUGGUGGGCUCCACUGCCAGUCAGCAACCUGGUUAUAUUCAGCCUAGGCCUCAGCCGCCACCAGCAGAGGGGGAAUUAUUUGGCCGUGGACGGCAGAGAGGAACAGCAGGAGGAACAGCCAAGUCACAAGGACUCCAGAUAUCUGCUGGAUUUCAGGAGUUAUCGUUAGCAGAGAGAGGAGGUCGUCGUAGAGAUUUUCAUGAUCUUGGUGUGAAUACAAGGCAGAACCUAGACCAUGUUAAAGAAUCAAAAACAGGUUCUUCAGGCAUUAUAGUAAGGUUAAGCACUAACCAUUUCCGGCUGACAUCCCGUCCCCAGUGGGCCUUAUAUCAGUAUCACAUUGACUAUAACCCACUGAUGGAAGCCAGAAGACUCCGUUCAGCUCUUCUUUUUCAACACGAAGAUCUAAUUGGAAAGUGUCAUGCUUUUGAUGGAACGAUAUUAUUUUUACCUAAAAGACUACAGCAAAAGGUUACUGAAGUUUUUAGUAAGACCCGGAAUGGAGAGGAUGUGAGGAUAACGAUCACUUUAACAAAUGAACUUCCACCUACAUCACCAACUUGUUUGCAGUUCUAUAAUAUUAUUUUCAGGAGGCUUUUGAAAAUCAUGAAUUUGCAACAAAUUGGACGAAAUUAUUAUAACCCAAAUGACCCAAUUGAUAUUCCAAGUCACAGGUUGGUGAUUUGGCCUGGCUUCACUACUUCCAUCCUUCAGUAUGAAAACAGCAUCAUGCUCUGCACUGACGUUAGCCAUAAAGUCCUUCGAAGUGAGACUGUUUUGGAUUUCAUGUUCAACUUUUAUCAUCAGACAGAAGAACAUAAAUUUCAAGAACAAGUUUCCAAAGAACUAAUAGGUUUAGUUGUUCUUACCAAGUAUAACAAUAAGACAUACAGAGUGGAUGAUAUUGACUGGGACCAGAAUCCCAAGAGCACCUUUAAGAAAGCCGACGGCUCUGAAGUCAGCUUCUUAGAAUACUACAGGAAGCAAUACAACCAAGAGAUCACCGACUUGAAGCAGCCUGUCUUGGUCAGCCAGCCCAAGAGAAGGCGGGGCCCUGGGGGGACACUGCCAGGGCCUGCCAUGCUCAUUCCUGAGCUCUGCUAUCUUACAGGUCUAACUGAUAAAAUGCGUAAUGAUUUUAACGUGAUGAAAGACUUAGCCGUUCAUACAAGACUAACUCCAGAGCAAAGGCAGCGUGAAGUGGGACGACUCAUUGAUUACAUUCAUAAAAACGAUAAUGUUCAAAGGGAGCUUCGAGACUGGGGUUUGAGCUUUGAUUCCAACUUACUGUCCUUCUCAGGAAGAAUUUUGCAAACAGAAAAGAUUCACCAAGGUGGAAAAACAUUUGAUUACAAUCCACAAUUUGCAGAUUGGUCCAAAGAAACAAGAGGUGCACCAUUAAUUAGUGUUAAGCCACUAGAUAACUGGCUGUUGAUCUAUACGCGAAGAAAUUAUGAAGCAGCCAAUUCAUUGAUACAAAAUCUAUUUAAAGUUACACCAGCCAUGGGCAUGCAAAUGAGAAAAGCAAUAAUGAUUGAAGUGGAUGACAGAACUGAAGCCUACUUAAGAGUCUUACAGCAAAAGGUCACAGCAGACACCCAGAUAGUUGUCUGUCUGUUGUCAAGUAAUCGGAAGGACAAAUACGAUGCUAUUAAAAAAUACCUGUGUACAGAUUGCCCUACCCCAAGUCAGUGUGUGGUGGCCCGAACCUUAGGCAAACAGCAAACUGUCAUGGCCAUUGCUACAAAGAUUGCCCUACAGAUGAACUGCAAGAUGGGAGGAGAGCUCUGGAGGGUGGACAUCCCCCUGAAGCUCGUGAUGAUCGUUGGCAUCGAUUGUUACCAUGACAUGACAGCUGGGCGGAGGUCAAUCGCAGGAUUUGUUGCCAGCAUCAAUGAAGGGAUGACCCGCUGGUUCUCACGCUGCAUAUUUCAGGAUAGAGGACAGGAGCUGGUAGAUGGGCUCAAAGUCUGCCUGCAAGCGGCUCUGAGGGCUUGGAAUAGCUGCAAUGAGUACAUGCCCAGCCGGAUCAUCGUGUACCGCGAUGGCGUAGGAGACGGCCAGCUGAAAACACUGGUGAACUACGAAGUGCCACAGUUUUUGGAUUGUCUAAAAUCCAUUGGUAGAGGUUACAACCCUAGACUAACGGUAAUUGUGGUGAAGAAAAGAGUGAACACCAGAUUUUUUGCUCAGUCUGGAGGAAGACUUCAGAAUCCACUUCCUGGAACAGUUAUUGAUGUAGAGGUUACCAGACCAGAAUGGUAUGACUUUUUUAUCGUGAGCCAGGCUGUGAGAAGUGGUAGUGUUUCUCCCACACAUUACAAUGUCAUCUAUGACAACAGCGGCCUGAAGCCAGACCACAUACAGCGCUUGACCUACAAGCUGUGCCACAUCUAUUACAACUGGCCAGGUGUCAUUCGUGUUCCUGCUCCUUGCCAGUACGCCCACAAGCUGGCUUUUCUUGUUGGCCAGAGUAUUCACAGAGAGCCAAAUCUGUCACUGUCAAACCGCCUUUACUACCUCUAACCUGCAGAAGACGAUGCAGCCGCUUUUCUUUUUGAAAUGACUUUGGGAUUUUUUUAAGCUUUUAUUUACUUUUUUUUUAACUGUUAUCUUUCUGGAUGAAACUUGGGAAGGGGAUUAGGAGAUCUAGCAUUUUAUUUCUAGCAUUGCUAUUCACCGGCUUCCUUAUUUUAUACGUAAAAAUUAAGAUUUUAUAUUUUAUCUUCUUGUUUCUCAUAGAUAUUUUGUGAGCAUUUUUUUGUUUAUUUUGAAGAAAUGUGGAUAAGAUACUUGGUAGUAUAAAACAGACUCUCUGAGAGUAUUUGAAAUGUGUUUGGAGAUUUACUUAAACGUACUUUCAGGAGUGAGCAAGUCCUACUUAUAAACCUAUAUUAACUUUAUUUUUGAGAUACCUGUUUUGAAUUUAAAGGAGAUAAGAGGCGUAAAGUAGGAUGCUCACUACAACCAUAGGUGGGGUUUCAGCUCAUAUCUUAAAGAUAAAAGGUACUAUUAUAUAACCUAUACACAAGAUACAGGAGAAAAUAUGCUUGAUUUUUAUUUGGCAGGGGGGCUAGGUUGUAUGGGAGUAAAAAAAACAUUGAAAAUUUUUAAAUUGUCCAAAGAAACAUUUUAAGACUCUUUAACAAAAAAGGCCAUGAGUAAAUCUCUAUAUUAACAUUACUAUUUAUUUUGUUUUGGAACUGGGACAUGAUUCUAUUUGUUAUAAAAUAAAAUUGAUGUGAUUGUCACCUUAUUUGAAUAACUGUAAUUCUUGUUUUACUGAAAGUAUGUGCGUUUUCUUUUCAUUUAAUUUUUAAAAGUGCAUACAAUUCCAUUCAUAAAAGCUAAAUUAGCCUGACCAACAUGGUGAAACCCCAUCUCUACUAAAAAUACAAAAUUAGCCAGAUGUGGUGCCAGGAGGCUGAGGCAGGAGAAUCACUUGAACCUGAGAGGCGGAGGUUGCAGUGAGCAGAGAUCACGCCACUGCACUCCAGCCUGGGCAACAGAGUGAGACUCCGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1141.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1214.94
Frequency: 0.0000
Diversity: 984.47
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((.((((.(.(......)).))))))))))))((((((((((((.(((.....)))...))))))).(((((((.(((.(((((.((((((((((((((((((..(((((((((.(........).)))))(((((......)))))........((((..(((((((....)))))))...))))...(((((((((.((((..(((..(((.(........).)))..))))))).)))))))))....................))))....))))))..)))))))).....)))).))))).)))))).))))((.((((((((......))))))))..))...((((((......)))).))(((((((((.((...((.((((((((.....(((.((((((...(((((...((((.((((((((..((((.....(((.((((.((((.....((((((((((..(....)..)))..)))))))....))))......(((((((((((((((.(((((.(((..((((..((.(((((((((((((((((.(((((((.......)))))))..)))))........(((((.....)))))......((((..((((........((((((..((((((((((.....))))).)))))))))))))))..))))((((((((......)).)))))).(((((...(((((..((...(((..((((((((((...(((((......))))).((((((...(((((((.(((..........))).))))))).)))))).((.....)).(((((((.((((....................((((...(((.(((.((((((((((((((((((((((......((.((((((((((...)))))))))).))))).))))))..((((((.........................))))))(((.......)))))))))))))))).)))..))).))))...))))))))))).(((((((........)))))))..))).)))))))..)))...))..)))))...))))).(((((((((.((.((((((...((((.((....)).)))))))))).)).))).))))))(((((.....)))))....)))))))..)))))..))..)))).))).))))).....((.((((.(((((.(((((((((......)))))..((.((((.(((((.(((.((.((((((.(((((.(((((((((....)))..))))))........(....)......)))))..)).))))(.((((((.(.....).)))))).).((((((.((((((.((....)).))))))))))))..(((((....))))))).))).))))).))))))...((.((((((........)))))).))((.((((..((((.((((.....((((((.....(((.(((.....(((((((((((((((.((.(((.((.(((((((((........))..))))((((((.((((((((....))))))))...))))))...........(((((((((..((..(((((((..........))))))).)).(((((......)))))((((((.((((((....((((..(((...........)))....))))...(((.((((((......)))))).))).((((((((........................))))))))..((((((........(((..((...((....(((....)))....)).))..))).......)))))).....))))))(((....((((((.((.......)).))).)))......)))((((((((((..(((....)))..))))))))))...))))))))))))))).....((((((..(((.((((.(((((.....(((((.(((.(((((.((((.((((((((((((...((.....((.....)).....))...)))))))))...........(((..(((.....)))......)))....(((((....((((.((....))))))..)))))((((((((((.......))))))))))....)))))))...)))).).))).)))))))))))))).)))..))))))))).))))).)).)))))).....)))))))))....))).)))..((((((((((((((((((((((((.((..((((.(((((...(((((....((((.((.....(((......))).)).)))))))))(.((((((((...))))))))))))))))))((((.((((......((((((.(((......((((((((((..((((((......))))))(((((..(((.......)))..)))))....))))))))))........)))...)))))).............(((((((.....))))))).(((((..(((((..((.....(((((.(((((((((((........))))..))))))).)))))))..)))))..))).)).((((.((.....)).)))).........(((((....))))).)))))))).....................(((((.....))))))).))).)))))))))....((((.....)))).....))))))).)))))((((((..........))))))...))))))))))..)))).)))))).(((......))))))).)))))..))))))..............(((((........)))))..........((((((((((.(((((((...(((((((..((((.(((((((((....(((((....((((((((.((((((...((((((((((.(((.((..((((.(......).))))..)).))).)).))..))))))..))))))..((((((((((((....((((((((...(((((((.(((((.((.((((((((..(((((((((((.......)))))))))))..))))))))))))(((((.........((((.((((((((((.........((((((........))))))))))))))))))))(((((..((((((((.((..(((.((((..(((((..((((((((....))))))))..)))))..))))..)))..)))))))))))))))))))).(((...))).((((....)))).(((((...)))))..((((...........)))).......))).)))))))))))))))))))))))))))....))))))))...)))))...))))))))).))))..)))))))...........)))))))...)))))))))).(((((......))))).)))))..))))))))))....(((((((.(((.(((((((((((.(((..(((......)))....))).))))))))))).))))))).)))..))))...)))....))))..)))))))).........((((((((..........................))))))))..))))..........((((...))))))).))..)))))).)))))))..)))).))...............((((....))))....)).))))))))).((((..((((((...(((...((((((((..(((((((.((.........))))))))))))).))))))).....))))))..)))))))))........................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
....((((((((.{(((.(.{......}).)))}))))))))((((((((((((.(((.....)))...))))))).(((((((.(((.(((((.((((((((((((((((((..(((((((((.,........}.))))}(((((......)))))........((((,,(((((((....))))))}...))))}},(((((((((.((((,.{((..(((.(........).)))..)}))))).)))))))))...................,))))....))))))..)))))))).....)))).))))).)))))).))))|{.((((({{(,,....}})))}})},))...({((((......)))).})(((((((((.((..,((,((((((((.....(((.((((({...(((((.,,({,,{((((({.(,..,.,}}.{{({....,}}})||.....}|}}))),.,..{{{(((((({.((((.{{((..((((.{{,.,.,(((((((((((((((.{(((,,((((((({{.,(({,{((({{,,,,,,((({.{{{{{{{......,))))))}..|||||....{{.,(((((,{{.,|,,||,,{{(,((((,.({(,..,,,..{((((((..((((((((((.....))))).))))))))))))}})|,||}},|||,,{({{{|{,||.|||||,..,,,....,})))),||...||||,{{({|{,,|||,,|||||}...,.,,,,..((((({,{{(((((((.(((.,,....,,.))).)))))))})))))).,||}}}})),|{{({{(({(((.....,.||,.,,.......|||.,.,||||||,.{(((((((((((((((((((((......,,.((((((((({...}))))))))).}})))}})))))..|,{(((......,,.,,........,,|||,,,}}||{,,....,,,}}}))))))))))))).|||.{|||{{||{...{{||,{{{{{..{((((({........})})))}.{{{.,{(|,{{(({,,.,,.,|||,{{{...{.((((((((((((((.((.((((((..{((((.((....)).))}})))))).)).))))))))),})))))}...|||{|....,||||,|{{{||||{,{...}}}.,}}}}}.}}}},,.,.|}||||}||,||,||,,(((((......))))).,{(.((((.(((((.(((.({.(((({(.(((((.((((((({(....)),.,))))))...........,.,......))))).,}).))))(.((((((.{.....).)))))).}.(((((((((((((.((....)).))))))))))))..(((({....}))))}).))).))))).))))}}..,,|.{{{{{{,,,,....}}}))}.}}||,{{{{.||||,.|,||}}},,||,,|,}}}},,,|}||}},...(((((((((((((((.{{.(((,{({(..,{{{{|........,,..,}}}{(((((.((((((({....})))))))...))))))...,.......(((((((((..((..(((((((..........))))))).}}.{((((......))))}((((((.((((((.{{{((((..,((,{,,.......,,,..,|||,},,.,{{.{(((((......)))))}.}},.((((((((..{{..........,.........))))))))..,,,,,{,,.....,||,..,....,,....||{,,,.}})}}.}))))))........({{{....)})}..))))))(((....((((((,((.....,}}).))).)))......)))((((((((((..(({....,))..))))))))))...))))))))))))))).....((((((..{{,.((((.(((((.....(((((.(({.(((((.((({,((((((((((((.,..,.....((.....}}...,,|}...|}}}}}})).,,...,,},,|{{,,{{{.....}}},....,))}.},.(((((,.,,{(((.{{....)))))},.)))))((((((((((.......)))))))))),}}.})}))))...)))).).})).)))))))))))))).}}}..)))))),}},,,)}).}).)))))).....))))))))).....,}})))}.)}}|,,,|((((({{{,,,|,|||}|...((((.(((((...(((((....((((.((.....,{{......}}}.)).))))))))),.((((((((...)))))))),)))))))))((((.(((({(({,.{(((({.(((....,,|||||{{|||,,((((((......)))))){((((..(((.......)))..))))}..,.||}|||||}|.......{|||,,.}}}}}}..,,}},},},..(((((((.....))))))}.{((((..(((((..((.....(((((.(((((((((((........)))),.})))))).)))))))..)))))..))).)).{|||.|||.|,,)),)}))},}}}}}..(((((....))))).))))))))}}}}}}))}.}},.....||.|||||,,,,.),}}},)}))).,.,,,......{{((((.{|{.||||...,.,.,},})),))).})))}}..|,,.....,|||||{..,,,,},,)))}}),)),})))}|{{||,.....}))}),,,}}}},..}}||||||............(((((........)))))..},,,,,,.{(((((((((.((((((({..(((((((..((((.(((((((((....(((((....((((((({{({{{,,.,,{||||||{((.(((.{{,,((((.(......,.))))..}).))).)).||,,||||||,.,}}}}}..((((((((((((....(((((((,.{((((((((.(((...{(.((((((((..(((((((((((.......)))))))))))..))))))))}}|{((,(({,.......{{{{,((((((((((........{({{{,,,,.....})))))})))))))))))||((((({.,((((((((.({..(((.((((..(((((..((((((((....))))))))..)))))..))))..)))..)))))))))))))))))),}.|||...||||(({{....,}}}.(((((...}}}}}..||}},.,.,,,,,..)))}.......))).))))))))))))))))))))))))))).,,.}))))))),,.)))))...))))))))).))))..)))))))..,........}))))))...)))))))))).,,||,......}))))}))))),.,)))))))))....{((((({.{((.(((((((((((.(((,{(((.....,))),...))}.))))))))))).)))))))},)},.)))).))))..)))).)))))))))),,,,..,,,,.((((((((.,{{..................}},.))))))))..,}},..,.......((((...))))}}}.}}..}})))).)}}}))}.|}}}}.||,...........,,,|{{|,.,,})))....)).))))))))).((((..((((((...(((...((((((((..(((((((.((.........))))))))))))).))))))).....))))))..)))))))))........................................
Back