Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004864.4

Sequence Length

1200 nt

GC Content

0.6292

AGUCCCAGCUCAGAGCCGCAACCUGCACAGCCAUGCCCGGGCAAGAACUCAGGACGGUGAAUGGCUCUCAGAUGCUCCUGGUGUUGCUGGUGCUCUCGUGGCUGCCGCAUGGGGGCGCCCUGUCUCUGGCCGAGGCGAGCCGCGCAAGUUUCCCGGGACCCUCAGAGUUGCACUCCGAAGACUCCAGAUUCCGAGAGUUGCGGAAACGCUACGAGGACCUGCUAACCAGGCUGCGGGCCAACCAGAGCUGGGAAGAUUCGAACACCGACCUCGUCCCGGCCCCUGCAGUCCGGAUACUCACGCCAGAAGUGCGGCUGGGAUCCGGCGGCCACCUGCACCUGCGUAUCUCUCGGGCCGCCCUUCCCGAGGGGCUCCCCGAGGCCUCCCGCCUUCACCGGGCUCUGUUCCGGCUGUCCCCGACGGCGUCAAGGUCGUGGGACGUGACACGACCGCUGCGGCGUCAGCUCAGCCUUGCAAGACCCCAGGCGCCCGCGCUGCACCUGCGACUGUCGCCGCCGCCGUCGCAGUCGGACCAACUGCUGGCAGAAUCUUCGUCCGCACGGCCCCAGCUGGAGUUGCACUUGCGGCCGCAAGCCGCCAGGGGGCGCCGCAGAGCGCGUGCGCGCAACGGGGACCACUGUCCGCUCGGGCCCGGGCGUUGCUGCCGUCUGCACACGGUCCGCGCGUCGCUGGAAGACCUGGGCUGGGCCGAUUGGGUGCUGUCGCCACGGGAGGUGCAAGUGACCAUGUGCAUCGGCGCGUGCCCGAGCCAGUUCCGGGCGGCAAACAUGCACGCGCAGAUCAAGACGAGCCUGCACCGCCUGAAGCCCGACACGGUGCCAGCGCCCUGCUGCGUGCCCGCCAGCUACAAUCCCAUGGUGCUCAUUCAAAAGACCGACACCGGGGUGUCGCUCCAGACCUAUGAUGACUUGUUAGCCAAAGACUGCCACUGCAUAUGAGCAGUCCUGGUCCUUCCACUGUGCACCUGCGCGGAGGACGCGACCUCAGUUGUCCUGCCCUGUGGAAUGGGCUCAAGGUUCCUGAGACACCCGAUUCCUGCCCAAACAGCUGUAUUUAUAUAAGUCUGUUAUUUAUUAUUAAUUUAUUGGGGUGACCUUCUUGGGGACUCGGGGGCUGGUCUGAUGGAACUGUGUAUUUAUUUAAAACUCUGGUGAUAAAAAUAAAGCUGUCUGAACUGUU

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-497.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -517.76

Frequency: 0.0000

Diversity: 412.05

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.....(((.(((((...(((...))).((((.((((((((((..((.....((((((((...(((........)))((((.((((((..(((((((.(((((.(((.(.(((.(((((((.((....(((.(((((..(((((....(((...((((..((((..(((.....((((..(((((..(....)..))))).))))...)))..)))).))))..)))..(((((((((.......(.(((((((.((.(((.....)))..)).)))))))))))))))))(((((.((((.(((........)))))))))))))))))....(((....))).....((((((..((((((....))))))..)))))))))))..)))...)).))))..((.((((((((....((((((((....(((((((........)))))))...((((((.((((.(((...((((.........(((....))))))).))).).))).)))))))))))))))))))))).))..(((.(((.((....))))).)))(((((.(((.((......)).))).)))))...))).))).).)))))))))))))))..))).))).))))...))))))))..))..)))))))))).))))(((((.(.((.((((((.((.(((.(((((((.....(((.((((((...((((((((.((((.((((.((((((.((.......((.(((.(((((((((((..((......)).))).......)))))))).)))))......)).)))))).))))...........)))).)))))))).....)).))))))).......(((((..((((.((..((....))..)))))))))))((((((((((....((((((((((((........((((((((.......)).))))))..(((((.(((.((((((....)))))).))).).)))).(((((((...((.....((((((((((((.......))))...))).))))).))....))))))).......))))))).)))))..............)))))))))))))).))).))).)).))))))))).)))))..((.(((.((((((............)))))).))).))...))))).)))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.....(((.(((((,(.((....|||,((((.((((((((((..((.,.,.((((((((..,(((({.(((..,,.((((((...((.(((,(((,{((((((((({{.,((({(({,,.,|||||},}}.,,))),,}}}))},..(((({{{(.(((.(((.(((((....((....}|.,,..})))).))).))).)))))))}},.,))),})).))..))))))|||,|||}},....{.(((((((.((.(((.....)))..)).))))))),}}}||||,{(((((.((((.(((........)))))))))))))}||}},,,,||,,}.)}},..,,{(((((..((((({....})))))..)))))}|{.....}}}}.,.}})}}}|,||,,,,||||((((((((((,(({...(((((((........))))))).{{|||{||||.({.,,,,...))....((((.(((((..((((((((..(((((((.(.((.{..(((((.((.(.((((....(((....)))....)))).).)))))))..}.)).).)))))))..)))))}}))..),}))).))))||||}||}},{{|||.||||||,.||}||},}}}}))))|.}|,.))))))))}}.||}|(((((.(.((.{(((((,((,(((.(((((((..{{{(((,((((((...((((((((.((((.{{{{.{|||{{.{{..|,...{{.(((.(((((((({{{.{{{..,,.,})}))||......)))))))).))))},,,,}.)).})))}),))))..,,,,,,..,))}).)))})))),,.,,)),))))))}}},....,,(((.,((((.((..((....))..)))))))))))||{|||{(({,,..,{{{{({{{{{,.,{,....((((((((.......}).)))))).,(((((.(((.((((((....)))))).))).}.)))}.{{|||||,.|({,,...{{{{{||||{{,.{,,,,|||||...|||,|}}}}.}}.,,,||||||},,.....))}))})})))}........,,.....,)))))))}}}})))})),))),)),))))))))).)))))..,,,}||.{(((((,....,......}},,,},})},,)).,))))).)))..