Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004917.5

Sequence Length

1416 nt

GC Content

0.6130

AGGCAGCAGGCUGGAGCUCAGCCCAGCAGUGGAAUCCAGGAGCCCAGAGGUGGCCGGGUGCUGACGUGAUGGCCACAGCAGGAAAUCCCUGGGGCUGGUUCCUGGGGUACCUCAUCCUUGGUGUCGCAGGAUCGCUCGUCUCUGGUAGCUGCAGCCAAAUCAUAAACGGCGAGGACUGCAGCCCGCACUCGCAGCCCUGGCAGGCGGCACUGGUCAUGGAAAACGAAUUGUUCUGCUCGGGCGUCCUGGUGCAUCCGCAGUGGGUGCUGUCAGCCGCACACUGUUUCCAGAACUCCUACACCAUCGGGCUGGGCCUGCACAGUCUUGAGGCCGACCAAGAGCCAGGGAGCCAGAUGGUGGAGGCCAGCCUCUCCGUACGGCACCCAGAGUACAACAGACCCUUGCUCGCUAACGACCUCAUGCUCAUCAAGUUGGACGAAUCCGUGUCCGAGUCUGACACCAUCCGGAGCAUCAGCAUUGCUUCGCAGUGCCCUACCGCGGGGAACUCUUGCCUCGUUUCUGGCUGGGGUCUGCUGGCGAACGGCAGAAUGCCUACCGUGCUGCAGUGCGUGAACGUGUCGGUGGUGUCUGAGGAGGUCUGCAGUAAGCUCUAUGACCCGCUGUACCACCCCAGCAUGUUCUGCGCCGGCGGAGGGCAAGACCAGAAGGACUCCUGCAACGGUGACUCUGGGGGGCCCCUGAUCUGCAACGGGUACUUGCAGGGCCUUGUGUCUUUCGGAAAAGCCCCGUGUGGCCAAGUUGGCGUGCCAGGUGUCUACACCAACCUCUGCAAAUUCACUGAGUGGAUAGAGAAAACCGUCCAGGCCAGUUAACUCUGGGGACUGGGAACCCAUGAAAUUGACCCCCAAAUACAUCCUGCGGAAGGAAUUCAGGAAUAUCUGUUCCCAGCCCCUCCUCCCUCAGGCCCAGGAGUCCAGGCCCCCAGCCCCUCCUCCCUCAAACCAAGGGUACAGAUCCCCAGCCCCUCCUCCCUCAGACCCAGGAGUCCAGACCCCCCAGCCCCUCCUCCCUCAGACCCAGGAGUCCAGCCCCUCCUCCCUCAGACCCAGGAGUCCAGACCCCCCAGCCCCUCCUCCCUCAGACCCAGGAGUCCAGCCCCUCCUCCCUCAGACCCAGGAGUCCAGACCCCCCAGCCCCUCCUCCCUCAGACCCAGGGGUCCAGGCCCCCAACCCCUCCUCCCUCAGACUCAGAGGUCCAGGCCCCCAACCCCUCCUUCCCCAGACCCAGAGGUCCAGGUCCCAGCCCCUCCUCCCUCAGACCCAGCGGUCCAAUGCCACCUAGACUCUCCCUGUACACAGUGCCCCCUUGUGGCACGUUGACCCAACCUUACCAGUUGGUUUUUCAUUUUUUGUCCCUUUCCCCUAGAUCCAGAAAUAAAGUCUAAGAGAAGCGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-493.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -516.50

Frequency: 0.0000

Diversity: 348.99

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((..(((((.((...))))))).(((.....((((((.....(((((((.((((.(((..(((.....)))..))).)...))).((((((((..(((((...(((((.....(((.(((...(((..(((((....(((..(((((((((...((......))...)).))))))))))....)).)))...((.(((.(((...((((.((((.........((((((..((((((..((((.((((((.....))))))..)))).)))...)))....))))))............((((((((.......(((..(((((.((.....((((.((((.(((..((((.(((((....)))))))))..))).................)))).)))).....)).))))).))).......(((((((......)))))))(((((.(((....(((((((.......)))))))..))).......((((((........))))))....(((((((((((((((.....))))))).(((((.((..((((..(((((.((((((((.((.((((....((..((((...((......))..))))..))....)))))).))))))))))))))))))).))))).........(((((((((....(((......(((((((....((((((....((((..((((((((.((((.(((...(((.......)))...))))))).(((....)))((((....))))...)))))))).....(((((.(((..(((....((.....)).(((......)))(((.((((((((((.((((.((...((.((.........)).))...)).)))))).......)))))))))))))).))))))))))))(((((....(((.....))).)))))((((.......))))..))))))....))))).))........)))))))))))).....)))))))).(((((...((.((...(((((........)))))...)).))...)))))..)))))..))))))))(((((...((.((...(((((........)))))...)).))...))))))))))))).....))))))))............((((((...((((....(((.((..((.....))...)).)))...))))....))))))...)))...))))))))))))))))..))))))))..........((((....))))....))))))).....)).))))..))).(((((.......))))))))).))((((.......))))(((((((...((((((..((.((.....))...))..)))))).....)))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,((,((..(((((.((...))))))).(((,....{{((((.....(((((((.(((({(((..{((,.,,.},}..}||{,...,)}.((((((((..((((({..{((({.....(((.(((..,(({..(((((..,.(((..(((((((((...{{......}}...)).)))))))}}}....)).))).,.((.(((.(((...((((.((((.........{||{{(,,,((({(,.((((,(({{{{{,.,||}|}||..}})).})).,.}})....)))}}}............((((((((,{{{...,(({.(((((.((.....((((.{(((.(((..((((.(((((....)))))))))..))).,,,.,.{{........)})).)))).....)).))))},|||,..,,{.(((((({......})))))),|,|||,.,....,{|||||,..(((((((..,)))))))......((((((........))))))....(((((((((((((((.....))))))).(((((.((,,{{{{..(((((.((((((((.(({((((.,..((..((((.,.{{....,,,}..))))..)),,,,)))),}.))))))))))))))))))).))))).........(((((((((....(((({....(((((((....((((((....((((..((((((((.((((.(((...(((.......)))...))))))).(((....))}((((....))))...)})))))}.....(((((.(((.,(((...,({.....})|{,|,,..,,))|(((.((((((((,{.((,,.(({...,.|,......{{{{,.,,.}))}.}))))}.......)))))))))))),,.))))))))))))(((((....(((.....))).)))))((((.......))))..))))))....))))),)}....}),.,))))))))))).....)))))))).{{{{{...{{.||...{((((........))))}...}}.}}...))))).,))))).,))})))}}(((((...((.((...(((((........)))))...)).))...))))))))))))).....))))))))..,....}},..((((((...((((....,,,,{{,.,,.....,.....)})),...))))....))))))...,},...}}}}}}))))))))))..))))))))....,,.,,.{{{{,,,,)}))....))))))).....)))),})..}|}.(((((,....}.))))),,}|,,(((((.......))))).,,.,|......|||...{{((.,.(((((...........))))).),))})}}}.