Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004964.3

Sequence Length

2118 nt

GC Content

0.4948

CCCCUCCCCCCUGGGUCGGACGCUGAGCGGAGCCGCGGGCGGGAGGGCGGACGGACCGACUGACGGUAGGGACGGGAGGCGAGCAAGAUGGCGCAGACGCAGGGCACCCGGAGGAAAGUCUGUUACUACUACGACGGGGAUGUUGGAAAUUACUAUUAUGGACAAGGCCACCCAAUGAAGCCUCACCGAAUCCGCAUGACUCAUAAUUUGCUGCUCAACUAUGGUCUCUACCGAAAAAUGGAAAUCUAUCGCCCUCACAAAGCCAAUGCUGAGGAGAUGACCAAGUACCACAGCGAUGACUACAUUAAAUUCUUGCGCUCCAUCCGUCCAGAUAACAUGUCGGAGUACAGCAAGCAGAUGCAGAGAUUCAACGUUGGUGAGGACUGUCCAGUAUUCGAUGGCCUGUUUGAGUUCUGUCAGUUGUCUACUGGUGGUUCUGUGGCAAGUGCUGUGAAACUUAAUAAGCAGCAGACGGACAUCGCUGUGAAUUGGGCUGGGGGCCUGCACCAUGCAAAGAAGUCCGAGGCAUCUGGCUUCUGUUACGUCAAUGAUAUCGUCUUGGCCAUCCUGGAACUGCUAAAGUAUCACCAGAGGGUGCUGUACAUUGACAUUGAUAUUCACCAUGGUGACGGCGUGGAAGAGGCCUUCUACACCACGGACCGGGUCAUGACUGUGUCCUUUCAUAAGUAUGGAGAGUACUUCCCAGGAACUGGGGACCUACGGGAUAUCGGGGCUGGCAAAGGCAAGUAUUAUGCUGUUAACUACCCGCUCCGAGACGGGAUUGAUGACGAGUCCUAUGAGGCCAUUUUCAAGCCGGUCAUGUCCAAAGUAAUGGAGAUGUUCCAGCCUAGUGCGGUGGUCUUACAGUGUGGCUCAGACUCCCUAUCUGGGGAUCGGUUAGGUUGCUUCAAUCUAACUAUCAAAGGACACGCCAAGUGUGUGGAAUUUGUCAAGAGCUUUAACCUGCCUAUGCUGAUGCUGGGAGGCGGUGGUUACACCAUUCGUAACGUUGCCCGGUGCUGGACAUAUGAGACAGCUGUGGCCCUGGAUACGGAGAUCCCUAAUGAGCUUCCAUACAAUGACUACUUUGAAUACUUUGGACCAGAUUUCAAGCUCCACAUCAGUCCUUCCAAUAUGACUAACCAGAACACGAAUGAGUACCUGGAGAAGAUCAAACAGCGACUGUUUGAGAACCUUAGAAUGCUGCCGCACGCACCUGGGGUCCAAAUGCAGGCGAUUCCUGAGGACGCCAUCCCUGAGGAGAGUGGCGAUGAGGACGAAGACGACCCUGACAAGCGCAUCUCGAUCUGCUCCUCUGACAAACGAAUUGCCUGUGAGGAAGAGUUCUCCGAUUCUGAAGAGGAGGGAGAGGGGGGCCGCAAGAACUCUUCCAACUUCAAAAAAGCCAAGAGAGUCAAAACAGAGGAUGAAAAAGAGAAAGACCCAGAGGAGAAGAAAGAAGUCACCGAAGAGGAGAAAACCAAGGAGGAGAAGCCAGAAGCCAAAGGGGUCAAGGAGGAGGUCAAGUUGGCCUGAAUGGACCUCUCCAGCUCUGGCUUCCUGCUGAGUCCCUCACGUUUCUUCCCCAACCCCUCAGAUUUUAUAUUUUCUAUUUCUCUGUGUAUUUAUAUAAAAAUUUAUUAAAUAUAAAUAUCCCCAGGGACAGAAACCAAGGCCCCGAGCUCAGGGCAGCUGUGCUGGGUGAGCUCUUCCAGGAGCCACCUUGCCACCCAUUCUUCCCGUUCUUAACUUUGAACCAUAAAGGGUGCCAGGUCUGGGUGAAAGGGAUACUUUUAUGCAACCAUAAGACAAACUCCUGAAAUGCCAAGUGCCUGCUUAGUAGCUUUGGAAAGGUGCCCUUAUUGAACAUUCUAGAAGGGGUGGCUGGGUCUUCAAGGAUCUCCUGUUUUUUUCAGGCUCCUAAAGUAACAUCAGCCAUUUUUAGAUUGGUUCUGUUUUCGUACCUUCCCACUGGCCUCAAGUGAGCCAAGAAACACUGCCUGCCCUCUGUCUGUCUUCUCCUAAUUCUGCAGGUGGAGGUUGCUAGUCUAGUUUCCUUUUUGAGAUACUAUUUUCAUUUUUGUGAGCCUCUUUGUAAUAAAAUGGUACAUUUCUAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-687.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -727.31

Frequency: 0.0000

Diversity: 572.65

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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