Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004982.4
Sequence Length
2274 nt
GC Content
0.4802
AUUAUUUUAACUCUUCUCCUUAGGACACGCAGCCCCCAAUUUGUCCCUCCGGCCUGGGCGGCCCCUGGUCCCGCGCGCCAGCAUGGGAGAGCGAGGGACCUGCCCGCGGCCCGCCGGCGUGUGCAAGGAGGUCCAGCCGCCGCGCCCGCUACCCGGAGUCUGAGGACGGGUGUCCAGGGACGGAGAGGCAGGUGAGAGGGAGGUGGCUAAGCUGGCUAUGGUGACAGGACGAUGUUGGCCAGAAAGAGUAUCAUCCCGGAGGAGUAUGUGCUGGCGCGCAUCGCCGCAGAGAACCUGCGCAAGCCGCGCAUCCGAGACCGCCUCCCCAAAGCCCGCUUCAUCGCCAAGAGCGGGGCCUGCAACCUGGCGCAUAAGAACAUCCGUGAGCAAGGACGCUUUCUACAGGACAUCUUCACCACCUUGGUGGACCUGAAAUGGCGCCACACGCUGGUCAUCUUUACCAUGUCCUUCCUCUGCAGCUGGCUGCUCUUCGCUAUCAUGUGGUGGCUGGUGGCCUUUGCCCAUGGGGACAUCUAUGCUUACAUGGAGAAAAGUGGAAUGGAGAAAAGUGGUUUGGAGUCCACUGUGUGUGUGACUAAUGUCAGGUCUUUCACUUCUGCUUUUCUCUUCUCCAUUGAAGUUCAAGUUACCAUUGGGUUUGGAGGGAGGAUGAUGACAGAGGAAUGCCCUUUGGCCAUCACGGUUUUGAUUCUCCAGAAUAUUGUGGGUUUGAUCAUCAAUGCAGUCAUGUUAGGCUGCAUUUUCAUGAAAACAGCUCAGGCUCACAGAAGGGCAGAAACUUUGAUUUUCAGCCGCCAUGCUGUGAUUGCCGUCCGAAAUGGCAAGCUGUGCUUCAUGUUCCGAGUGGGUGACCUGAGGAAAAGCAUGAUCAUUAGUGCCUCUGUGCGCAUCCAGGUGGUCAAGAAAACAACUACACCUGAAGGGGAGGUGGUUCCUAUUCACCAACUGGACAUUCCUGUUGAUAACCCAAUCGAGAGCAAUAACAUUUUUCUGGUGGCCCCUUUGAUCAUCUGCCACGUGAUUGACAAGCGCAGUCCCCUGUAUGACAUCUCAGCAACUGACCUGGCCAACCAAGACUUGGAGGUCAUAGUUAUUCUGGAAGGAGUGGUUGAAACUACUGGCAUCACCACACAAGCACGAACCUCCUACAUUGCUGAGGAGAUCCAAUGGGGCCACCGCUUUGUGUCCAUUGUGACUGAGGAAGAAGGAGUGUAUUCUGUGGAUUACUCCAAAUUUGGCAACACUGUUAAAGUAGCUGCUCCACGGUGCAGUGCCCGAGAGCUGGAUGAGAAACCUUCCAUCCUUAUUCAGACCCUCCAAAAGAGUGAACUGUCUCAUCAAAAUUCUCUGAGGAAGCGCAACUCCAUGAGAAGAAACAAUUCCAUGAGGAGGAACAAUUCUAUCCGAAGGAACAAUUCUUCCCUCAUGGUACCAAAGGUGCAAUUUAUGACUCCAGAAGGAAAUCAAAACACAUCGGAAUCAUGACAGCAAGAUAACCCCAAGACAGUCUUUUAUCAAGUUUUGACGGUUUAUGCUGGGCACUGCCAGACUGAACCAGAGCUGGAACACAAUAAUGUGUCCUUCUACAUUUUAUUACACUAAAUGAUAUUCAUAUUCAAGCAACAGCACUUUCUGUAGUAAUAAAAAGUAACACACCAAGUGGAGGAUUCAUGGCUUAUGCUUGUUUCAUACAUGUAGAAUUCGCAGUGAUAUACUUAAGUUAUGUGCAGGGGUGGGUAUGCUCGUUUCUCUCAAUUUGAAACACAAGAAUUACACUAAUAGUAACAGGCCUUGAGCACAAAAUUUGGUCAAGAAAUGAGUCUGUUUGAAAUGCUUAGUUGGUGAAACCCAGAUCGCUGUGUUACUAAUGAUCACUCUGGAAAUGCAAAUAGAAUAGGAGGGGAAAAAACAAAAUCAUGUUAAUGCGUUUUGUACAUCAGCCUUCUCCUGUCUCCAUGAUAACUGCAUUUGGUAGGAAGCCUGAGGCAAAAACUGCUUAAGUGGAUCUGUUUGUAAGUGGAUUCAGUUCAUUCGCUUUGUCUGUCGGUGACUCCUGAAGGUUUCCUGGUCCAUCUCAUUGCGGCCUGUUGGGCAGAGCUGGACAAGGUGUCUUUGAAGGAAAGCUAAGUCUUGUCUCAUUUAGGACUGGGUUCCCCACAGUGACAGUCACUUCCUUCAGCAUCUCACUUCUUCUUCUAGAAUCCCCACAGGGAAAUACUGUAUUGAAUAUUUUAUUAAAACAUUUUCUUUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-740.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -783.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 565.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
................(((((.((((((.(............((((((((((..((((((((..((((.((((((((((.((..(((...(((.((......)))))..))))).))))))))......)).))))..)))..)))))....)))))).....))))).))))))))))).(((((((.(((((((((((((((((((..(((((((((..((((((.....(((((.(((((..(((((..(((((((((((...(((((.((((((((((........))...)))))..)))))))))))...(((((((((((....(((((((.........)))))))((..(((....(((((.(((((.(((((........))..(((((((.((((......(((((..(((((.((((((((..((((((((((((.(((.(.(((..(((((.(((((((.((((((..(((((((..(((((((...)))))))..))))))).))))((((((((.((....))))).))))).....)).)))).))).)....))))..)))).))).)))))).))).)))...)))))))).....((((((((((((.((((((.((.((((((((.......)))))))).)).))))))(((((.((((((.....))))))..)))))..((((((......))))))...((((((((((((((.(((((((((......)))))))))...)))).......))))))))))))))))))))))....(((....((((.(((((..((.(((....)))))..)))))..))))....)))....)))))..))))))))).)).)))))))).)).))))))))....)))))...((((((................))))))..)))))))))))((((..((((.((.(((((((..((.(((((......))))).))..............((((((((((.((((((.((((((..((.....))..).)))(((........)))..((((((((.((((((..((((.......))))))))))..........(((.((.(((.(((.......(((.....)))..))).)))...)))))....))))))))))))).))).))))))))))....)))))))))))))...)))).............)))).)))))))))....))))))))))))))))..))))).((((..(...((((.(((((((((.(((((.((((((((((.....((((((((((.........((((((((((..((.......(((((...(((........)))..)))))..........((((((((((((...((((.......))))...))))).)))))))(((((...)))))...((((((.(((.((.(............).))))).))))))(((((....((((.((((((.............))))))..))))..)))))..((((..(((((.((.(((((((.(((.((((....)))))))...(((.(((((((((.....((((...)))).........((((......)))).))))))))).)))....((((((((.((...((((((........(((.....)))((((...((((.((((((.......(((.((..((((.(((((((......(((((.........)))))..........((((((((((((((((((((((.((.......)).)))))......))))))......))))..)))))))..)))))..)).)))))).)))....)))))).))))..))))...(((.(((((((((.....((((((((((....))).))))))).......)).))))))))))))))))...)).)))))))).....(((...))).......))))...))).)).)))))..))))))..)))))))))).....)))))..))))).....)))))))).)).))))).))).))).)))))))...)..)))).(((((...))))).....((..((((.(((((((.......))))))).))))..)).))))...)))))))))))......)))))))))))))))..........(((((((((...(((.((((........)))).))).))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..........(((((((((((.((((((.(..,,........((({(((((((((((((((,((((,((((((.((....)).)))),..||.}))).,).))))),}})),||.||||||,{{..{{.,|.}},}}})))))))),)}...,}))))...,.))})),))))))))))).))))}){.((((({(((((((((((((..(((((((((..((((((.....((({,{(((({..{{(((..,((({{{{|||,.|(((((,{((({{||||,,,,,,{.,,..,))))}..))))))))}}}..{(((((((((((....(((((((,........)))))))||,.{{{....{((((,({{((.{,(((,,,,....}},.(((((((.((((......(((((..{{{||,|(((((((..{(((((((((((.(((.(.(((..(((((.(((((((.((((((..(((((((..,{(((((,..,}))))),.))))))).})))((((({{{.(,....||}},.))))),....}).)))}.))),|...|))))..)))}.))).)))))).))).)),...)))))))}.....{(((((((((({,{(({{{.{{.{{|{((({....,,.))))))}),)),)))))){((((.((((((.....))))))..)))))..{{((((......)))))}..{((((((((((((((.(((((((((......)))))))))...)))).......)))))))))))))))))))))|,,..{{{..,.((((.{{{{{.,||.|{(,,,,||}},..))))),.))))....))).}|,}}})).}))))))))).)))}}})),}}.}}.},,)))}}..,,))))}...((((((................))))))..)))))))))))|(({..((({,{{.(((((((..((.(((((......))))).)).,............{(((((((((.((((((.,{{{{,..(,{,,,,,|..,.}))|||...,},..},,.,((((((((.(((({(,,((,,,,,....})))})))))..|,,....,{{.,((,((({({(...,...{|{...,,)))..,,}.},,...))))),...})))))))}.)))},)).)))))))))}....))))))))))))).,,}))},..,||||||,.,}}}}.})}}})))),...}})))}}})}))))))..))))|{(({(,,,...((((.(((((((((.(((((.((((((((((.....((((,(((((....,{{,.((((((((((..((.......(((((.,,(({.......,)))..))))}{{,.....,}((((((((((((...((((.......)))}...)))))))))))))(((((...)))))...((((((.(((.((.(............).))))).))))))(((((....((((.((((((.............))))))..))))..)))))..((((..(((((.((.((({(({.((,{((((....)))))))...(((.(((((((((.....{(((...,}}}......,,.{{{{,.....}})).))))))))).)))....((((((((.((...((((((....,{{.(((.....))},|||...((((.((((((....,{.{((.,,..((((.(((((((......(((((.........)))))..........((((((((((((((((((((((.((.......)).)))))......)))))),.....})))..)))))))..))))}.,)).))))},.))),}.,)))))).))))..}}},...{(,{(((((((((.....((((((((((....))).))))))).......))}})))))))))))))))...)).)))))))).,,..{{(,..|||,.....,))))...))).)).)))))..))))))..))))))))))..}}})))))..})))).....))))))))},).))))).))).))).)))))))}}})},},))}{||||.,,}}})}.,,..((,.{{({.(((((((.......))))))),}|)}.})).))))...)))))))))))}}..,,))))}))}||}}},,.}}},.....(((((((((...(((.((((........)))).))).))))))))).
Back