Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_005005.3
Sequence Length
691 nt
GC Content
0.5297
AGUCACCCGCAGCAGGCGUGCAGUUUCCCGGCUCUCCGCGCGGCCGGGGAAGGUCAGCGCCGUAAUGGCGUUCUUGGCGUCGGGACCCUACCUGACCCAUCAGCAAAAGGUGUUGCGGCUUUAUAAGCGGGCGCUACGCCACCUCGAGUCGUGGUGCGUCCAGAGAGACAAAUACCGAUACUUUGCUUGUUUGAUGAGAGCCCGGUUUGAAGAACAUAAGAAUGAAAAGGAUAUGGCGAAGGCCACCCAGCUGCUGAAGGAGGCCGAGGAAGAAUUCUGGUACCGUCAGCAUCCACAGCCAUACAUCUUCCCUGACUCUCCUGGGGGCACCUCCUAUGAGAGAUACGAUUGCUACAAGGUCCCAGAAUGGUGCUUAGAUGACUGGCAUCCUUCUGAGAAGGCAAUGUAUCCUGAUUACUUUGCCAAGAGAGAACAGUGGAAGAAACUGCGGAGGGAAAGCUGGGAACGAGAGGUUAAGCAGCUGCAGGAGGAAACGCCACCUGGUGGUCCUUUAACUGAAGCUUUGCCCCCUGCCCGAAAGGAAGGUGAUUUGCCCCCACUGUGGUGGUAUAUUGUGACCAGACCCCGGGAGCGGCCCAUGUAGAAAGAGAGAGACCUCAUCUUUCAUGCUUGCAAGUGAAAUAUGUUACAGAACAUGCACUUGCCCUAAUAAAAAAUCAGUGAAAUGGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-236.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -249.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 188.89
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((..(((((....((((((((((........)))))))))).....)))))(((.(((((((..(((.((((((......)))))))))..)))....(((((.(((.((........)).))).)))))...((((((((.(((.((((....(((.((((.........)))))))....))))...)))))))))))....(((....)))....((...((((....)))).))...((((((.((..(((.((((....))))))).)).))))))......))))))).(((((((((.(((((.....((((......((.((.(((((.((((((......((.(((((.((((((.((....)))))))).))))).)).))))))))))))).)).....))))..)))))..))).))))))..)))))).(((....((((..((((..(((.((((..(.(..((((((..((((....)))).))))))..).)..)))).))).(((..((....)).))).....((((.(((...))).))))..))))..))))..)))(((.....)))..((((((((((((....))).)))))).)))..(((((((...((((((....)))))))))))))...............)))).......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((((({{{,(({((,(,(({,(((((((((,{{{{..{{|||,|||},,((({..(((((({.{.,(((((((((.((((((......))))))))}.,{(({,..,,|||||}||((({,.{|,{((((,({.{(((((........))))))|||||,,.,{{.{{{{...,,.,,.))))})),}}})}}}}}.))))).)})})})..}..,}}})))....,,.}}}|||}..}))).|}}.|||||{{,.||,,|||},|||,...||||}||.||.}||||.(((...|{{.,...(((((((((.(((((.,...((((......((.((.(((((,{(((((......((.(((((.((((({,((....)))))))).))))).)).))))))))))))).)).....))))..)))))..))).))))))...})})).,}}}..)))))).||.}},|||...,,((({.((((((((..((((....)))).)))))...))).})))}}))},|||}}((....))..))}}}}.{(((.({,,,,,||,|||,....,,.}))}..}},}|||.,.},)}}..((((((((((((....))).)))))).)))..(((((((...((((((....)))))))))))))...............}}},..,}},.
Back