Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005034.4

Sequence Length

947 nt

GC Content

0.3569

GGAAGUUGGUCUCGACACCUGGACUAGCCGGGUUGUAUUUGGAAACGCGGAGUGAGUUUUUCCGUGCUGUGUAGGGGCUAACAAUGGACACCCAGAAGGACGUUCAACCUCCAAAGCAGCAACCAAUGAUAUAUAUCUGUGGAGAGUGUCACACAGAAAAUGAAAUAAAAUCUAGGGAUCCAAUCAGAUGCAGAGAAUGUGGAUACAGAAUAAUGUACAAGAAAAGGACUAAAAGAUUGGUCGUUUUUGAUGCUCGAUGAAUGCUGGGAAUUCAGAGGAAUGUCUUCACUUAUACUUGGAUUUGCUCUCUUCCCAUUUCUGAUUGUUGUAUAGCUUUCGAUUUUGCUUACAGUAGUUCCCCCUUAUCUUCGGGAGAUACAUUCCAAGGCCCCCAGUGAACUCCUGAAACCUCAAACAGUACCAAACCUUUAUACACUGUUUUUUCCAUAUAUAUAUACCUAUGAUAAAGUAUAAUGUAUAAAUUAAGCAUAGCAAGAGAUUAAUAAUAAUGUAAUAGAACAAUGAUAACAUACUAUAAUAAAAGUUAUGUGAAUGUGGUUGGUCUCUCUUGCUUUCAAAAUAUCUUCUUGUACAGUACUCACCUAUUUUAGAAUGUGGUUGACUACAGGUAACCAAAACCACAGAAAGGGAAACUUUGGAUGAGGGGGGCACUACUGUACUUAGGAAUACAACUAUAUACAUAUGAUUUUAUUUUUAAGACCAUAUUAUAUUUGGGUAUCUACUAAUAUUUUGUAUAAAGCAAUUUUUUGUUCCAUUACGUGACUUUUUGUUUUAUUGUAUAUGUAAUUUAACACACAAUAAAGGGUAAAGUUGCUUCCCCAAACCACACUUUUAAUCAAAACCUAGAAUCAUCUGCAGUCCUUGUUAAAAAUGCAGGUUUCUAGAACCCUCUGAAGUUCUGAUUAAAUAAAUUUAUUGCAAACCAC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-229.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -247.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 170.57

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.......((((((...((((((.....))))))(((..((((....((((((.......))))))(((((...((((.......(((((..((....))..)))))..))))...)))))..))))..)))....((((((((.....)).)))))).................)))))).(((((((..(((((..(((((((((((((((..(((...(((((.((((((....)))))).)))))(((((((((.(((...((((((...((((.((.((((............)))))).)))).)))))).))).....((((((((((..........)))((((((((((((((((((((((((((((.(.((((....((...))))))).)))))))......(((((((...............))))))).................(((.((((.(((((..(((((((...(((...(((((((((.................((.((((.((((((((((........)).)))))...))).)))).)))))))))))..........))).))))))))))))....)))).)))..(((((((................))))))).((((.....)))))))))))))))).))))))))).......))))))).(((((.(((((.(((((....))))).))))))))))))))))))))))...))))))))))..(((((....))))).......((((((((.(.(((((((((...(((......))).))))))))).).)))))))).........)))))..............((((((..(((((((..............)))))))))))))....)))))....)))))))......................

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,..(((((((({,,,{{{{||,,,,,)}}|}|{{{,.,{((,...((((((.......)))))|(((((...((((.,.....(((((..((....))..))))).,))))...))))),.}},..........((((((((.....)).)))))).............,,..}}},})}{((((((..(((((..(((((((((((((((..(({...(((((.((((((....)))))).)))))(((((((((.{{{...((((((...((((.((.((((............)))))).)))).)))))).}}}.....(((((((,{{..........},,((((((((((((((((((((((((((((.{.((((....{{...}})))),.))))))),.....{((((((...............))))))}.,..,.(({{{,{{{{{.|,.,....,||}},,||||||,.....,...(((((((((,..........,,...{({.((((.((((((((((........))}}))))...))).)))).}))))))))))........},,,,,}}}},,,|||,|,..{|||,.,.,..{{(((((,..,...,,,......})))}}}.,{{|},...}}}}}))))))))))).)))))))))...,},.))))))).(((((.(((((.(((((....))))).)))))))))})))))))))}}}...))))))))))..{((((....))))).......((((((((.(.(((((((((...(((......))).))))))))).).)))))))).........)))))..............((((((..(((((((..............)))))))))))))....)))))....))))))}.........,,.,,,...))..