Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005080.4

Sequence Length

1817 nt

GC Content

0.4959

GCUGGGCGGCUGCGGCGCGCGGUGCGCGGUGCGUAGUCUGGAGCUAUGGUGGUGGUGGCAGCCGCGCCGAACCCGGCCGACGGGACCCCUAAAGUUCUGCUUCUGUCGGGGCAGCCCGCCUCCGCCGCCGGAGCCCCGGCCGGCCAGGCCCUGCCGCUCAUGGUGCCAGCCCAGAGAGGGGCCAGCCCGGAGGCAGCGAGCGGGGGGCUGCCCCAGGCGCGCAAGCGACAGCGCCUCACGCACCUGAGCCCCGAGGAGAAGGCGCUGAGGAGGAAACUGAAAAACAGAGUAGCAGCUCAGACUGCCAGAGAUCGAAAGAAGGCUCGAAUGAGUGAGCUGGAACAGCAAGUGGUAGAUUUAGAAGAAGAGAACCAAAAACUUUUGCUAGAAAAUCAGCUUUUACGAGAGAAAACUCAUGGCCUUGUAGUUGAGAACCAGGAGUUAAGACAGCGCUUGGGGAUGGAUGCCCUGGUUGCUGAAGAGGAGGCGGAAGCCAAGGGGAAUGAAGUGAGGCCAGUGGCCGGGUCUGCUGAGUCCGCAGCACUCAGACUACGUGCACCUCUGCAGCAGGUGCAGGCCCAGUUGUCACCCCUCCAGAACAUCUCCCCAUGGAUUCUGGCGGUAUUGACUCUUCAGAUUCAGAGUCUGAUAUCCUGUUGGGCAUUCUGGACAACUUGGACCCAGUCAUGUUCUUCAAAUGCCCUUCCCCAGAGCCUGCCAGCCUGGAGGAGCUCCCAGAGGUCUACCCAGAAGGACCCAGUUCCUUACCAGCCUCCCUUUCUCUGUCAGUGGGGACGUCAUCAGCCAAGCUGGAAGCCAUUAAUGAACUAAUUCGUUUUGACCACAUAUAUACCAAGCCCCUAGUCUUAGAGAUACCCUCUGAGACAGAGAGCCAAGCUAAUGUGGUAGUGAAAAUCGAGGAAGCACCUCUCAGCCCCUCAGAGAAUGAUCACCCUGAAUUCAUUGUCUCAGUGAAGGAAGAACCUGUAGAAGAUGACCUCGUUCCGGAGCUGGGUAUCUCAAAUCUGCUUUCAUCCAGCCACUGCCCAAAGCCAUCUUCCUGCCUACUGGAUGCUUACAGUGACUGUGGAUACGGGGGUUCCCUUUCCCCAUUCAGUGACAUGUCCUCUCUGCUUGGUGUAAACCAUUCUUGGGAGGACACUUUUGCCAAUGAACUCUUUCCCCAGCUGAUUAGUGUCUAAGGAAUGAUCCAAUACUGUUGCCCUUUUCCUUGACUAUUACACUGCCUGGAGGAUAGCAGAGAAGCCUGUCUGUACUUCAUUCAAAAAGCCAAAAUAGAGAGUAUACAGUCCUAGAGAAUUCCUCUAUUUGUUCAGAUCUCAUAGAUGACCCCCAGGUAUUGUCUUUUGACAUCCAGCAGUCCAAGGUAUUGAGACAUAUUACUGGAAGUAAGAAAUAUUACUAUAAUUGAGAACUACAGCUUUUAAGAUUGUACUUUUAUCUUAAAAGGGUGGUAGUUUUCCCUAAAAUACUUAUUAUGUAAGGGUCAUUAGACAAAUGUCUUGAAGUAGACAUGGAAUUUAUGAAUGGUUCUUUAUCAUUUCUCUUCCCCCUUUUUGGCAUCCUGGCUUGCCUCCAGUUUUAGGUCCUUUAGUUUGCUUCUGUAAGCAACGGGAACACCUGCUGAGGGGGCUCUUUCCCUCAUGUAUACUUCAAGUAAGAUCAAGAAUCUUUUGUGAAAUUAUAGAAAUUUACUAUGUAAAUGCUUGAUGGAAUUUUUUCCUGCUAGUGUAGCUUCUGAAAGGUGCUUUCUCCAUUUAUUUAAAACUACCCAUGCAAUUAAAAGGUACAAUGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-618.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -650.85

Frequency: 0.0000

Diversity: 434.51

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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