Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_005146.5
Sequence Length
3557 nt
GC Content
0.5963
CGUUGUCUGGGCUCGGCGGCAGCCGGGCUCGGAGUGGACGUGCCACUAUGGGGUCGUCCAAGAAGCAUCGCGGAGAGAAGGAGGCGGCCGGGACGACGGCGGCGGCCGGCACCGGGGGUGCCACCGAGCAGCCGCCGCGGCACCGGGAACACAAAAAACACAAGCACCGGAGUGGCGGCAGUGGCGGUAGCGGUGGCGAACGACGGAAGCGGAGCCGGGAACGUGGGGGCGAGCGCGGGAGCGGGCGGCGCGGGGCCGAAGCUGAGGCCCGGAGCAGCACGCACGGGCGGGAGCGCAGCCAGGCAGAGCCCUCCGAGCGGCGCGUGAAGCGGGAGAAGCGCGAUGACGGCUACGAGGCCGCUGCCAGCUCCAAAACUAGCUCAGGCGAUGCCUCCUCACUCAGCAUCGAGGAGACUAACAAACUCCGGGCAAAGUUGGGGCUGAAACCCUUGGAGGUUAAUGCCAUCAAGAAGGAGGCGGGCACCAAGGAGGAGCCCGUGACAGCUGAUGUCAUCAACCCUAUGGCCUUGCGACAGCGAGAGGAGCUGCGGGAGAAGCUGGCGGCUGCCAAGGAGAAGCGCCUGCUGAACCAAAAGCUGGGGAAGAUAAAGACCCUAGGAGAGGAUGACCCCUGGCUGGACGACACUGCAGCCUGGAUCGAGAGGAGCCGGCAGCUGCAGAAGGAGAAGGACCUGGCAGAGAAGAGGGCCAAGUUACUGGAGGAGAUGGACCAAGAGUUUGGUGUCAGCACUCUGGUGGAGGAGGAGUUCGGGCAGAGGCGGCAGGACCUGUACAGUGCCCGGGACCUGCAGGGCCUCACCGUGGAGCAUGCCAUUGAUUCCUUCCGAGAAGGGGAGACAAUGAUUCUUACCCUCAAGGACAAAGGCGUGCUGCAGGAGGAGGAGGACGUGCUGGUGAACGUGAACCUGGUGGAUAAGGAGCGGGCAGAGAAAAAUGUGGAGCUGCGGAAGAAGAAGCCUGACUACCUGCCCUAUGCCGAGGACGAGAGCGUGGACGACCUGGCGCAGCAAAAACCUCGCUCUAUCCUGUCCAAGUAUGACGAAGAGCUUGAAGGGGAGCGGCCACAUUCCUUCCGCUUGGAGCAGGGCGGCACGGCUGAUGGCCUGCGGGAGCGGGAGCUGGAGGAGAUCCGGGCCAAGCUGCGGCUGCAGGCUCAGUCCCUGAGCACAGUGGGGCCCCGGCUGGCCUCCGAAUACCUCACGCCUGAGGAGAUGGUGACCUUUAAAAAGACCAAGCGGAGGGUGAAGAAAAUCCGCAAGAAGGAGAAGGAGGUAGUAGUGCGGGCAGAUGACUUGCUGCCUCUCGGGGACCAGACUCAGGAUGGGGACUUUGGUUCCAGACUGCGGGGACGGGGUCGCCGCCGAGUGUCCGAAGUGGAGGAGGAGAAGGAGCCUGUGCCUCAGCCCCUGCCGUCGGACGACACCCGAGUGGAGAACAUGGACAUCAGUGAUGAGGAGGAAGGUGGAGCUCCACCGCCGGGGUCCCCGCAGGUGCUGGAGGAGGACGAGGCGGAGCUGGAGCUGCAGAAGCAGCUGGAGAAGGGACGCCGGCUGCGACAGUUACAGCAGCUACAGCAGCUGCGAGACAGUGGCGAGAAGGUGGUGGAGAUUGUGAAGAAGCUGGAGUCUCGCCAGCGGGGCUGGGAGGAGGAUGAGGAUCCCGAGCGGAAGGGGGCCAUCGUGUUCAACGCCACGUCCGAGUUCUGCCGCACCUUGGGGGAGAUCCCCACCUACGGGCUGGCUGGCAAUCGCGAGGAGCAGGAGGAGCUCAUGGACUUUGAACGGGAUGAGGAGCGCUCAGCCAACGGUGGCUCCGAAUCUGACGGGGAGGAGAACAUCGGCUGGAGCACGGUGAACCUGGACGAGGAGAAGCAGCAGCAGGAUUUCUCUGCUUCCUCCACCACCAUCCUGGACGAGGAACCGAUCGUGAAUAGGGGGCUGGCAGCUGCCCUGCUCCUGUGUCAGAACAAAGGGCUGCUGGAGACCACAGUGCAGAAGGUGGCCCGGGUGAAGGCCCCCAACAAGUCGCUGCCCUCAGCCGUGUACUGCAUCGAGGAUAAGAUGGCCAUCGAUGACAAGUACAGCCGGAGGGAGGAAUACCGAGGCUUCACACAGGACUUCAAGGAGAAGGACGGCUACAAACCCGACGUUAAGAUCGAAUACGUGGAUGAGACGGGCCGGAAACUCACACCCAAGGAGGCUUUCCGGCAGCUGUCGCACCGCUUCCAUGGCAAGGGCUCAGGCAAGAUGAAGACAGAGCGGCGGAUGAAGAAGCUGGACGAGGAGGCGCUCCUGAAGAAGAUGAGCUCCAGCGACACGCCCCUGGGCACCGUGGCCCUGCUCCAGGAGAAGCAGAAGGCUCAGAAGACCCCCUACAUCGUGCUCAGCGGCAGCGGCAAGAGCAUGAACGCGAACACCAUCACCAAGUGACAGCGCCCUCCCGCCCCGGCCCUGCCUCAACCUUCAUAUUAAAUAAAGCUCCCUCCUUAUUUUUUCCUCCCUGGUCGUGGUACAGAUUCCAGGGUUGGAUCUUUGGUUGGGUGUGGCACAGAGUCUGGCUCCUGCUAGGUGAGACCUGGCCAUCAAAUGACACAAACAACUAAACGAUGGAAGAGAGAGCGAGCCCGGGUCCUCUAAGGCUCCUUCCUUCUCCCCUGGCUGUCGGUCACACCUCUGCAGGGCCGGCUCUCUGAUAGAAAGUGGAAGGCGGUUUUAGAAACUCAUCACCCUGCUCUCUCCUGGCCUCGGGGGCUGCACAGGUCACUGUCCUGUAAUGUCUCCCGGUCAGGGCAGCCCAGGACUGCCCAGCCUGGUGGGCUGGGGAUUGGGCUUUGGGUAGGGCACAGGUGCCACCUUCUGUCCUGGCUGUCCUGUGCCACCCUGGUCUGUGUCUAGAGGAGUGAAACUCCCAGGGUUGGGCUGGGAGUAUUUGGUGCACGCGGUAUGGGGAGGGCUGAGCUCAGUGCCUCCUGGGAGACUUGUCCCGUGUACAGUGACCCAGAAAGAUGAGAUUCCUUGGCCUGAACUCUGUGAUAGAGUGUGACUGAGCUGCUGGGGGACAUGUGAGCCUCAAAUCCAUAGAAAGACAAACGGCCACCUUGGGUGCCCAGGAUACUGGUGCCUGGCCCCACGUACACCCACAUACUUCUCAGAUGGCUCCCACAUUUUAAGAUUUUAAAAAUGAAACCAAAAAAUAAAUUGAAGAAAACUGUAAACUUUAAAGAAUAAUCAGCUGGGCGCAGUGGCUCAUGCUUGUAAUCACAGCACUUUAGGAGGCUGAGGCAGGAGGACUGUUUGAGCCCAGGAGUUUGAGACCAACCUGAGUAAGGUGGCAAAACCCCAUCUCUACCAAAAAUACAAAGAUUAGCCAGGCGUGGUGGUGAGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUUGGGAUGCUGAGGUGGGAGGAUCACUUGAACCUGGGAGACACAGGCUGCAGUGGGCCCUGAUUGAGCCACCACACUGCAGCCUAGGUGACAGUCAGACCCUGUCUCAAAAAAAAUAAAAAAAAUUUAAAAUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1455.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1512.95
Frequency: 0.0000
Diversity: 1140.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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