Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_005477.3
Sequence Length
6922 nt
GC Content
0.6173
GCUGGAGCCGCUCCUAUGGCAACCCGCGAGCUGCGGCGGCUUCAUGAAUAUUCCGGGGCGCGGGAGCCCGAGCGCUGCCGGAGGGCGCUUCGGGGGAGGCGGCCGCUGAUGUAAGCCCGGCGGGUCGCUGGGCUCCGCUCGGUUGCGGCGGGAGCCCCGGGACGGGCCGGACGGGCCGGGGCAGAGGAGGCGAGGCGAGCUCGCGGGUGGCCAGCCACAAAGCCCGGGCGGCGAGACAGACGGACAGCCAGCCCUCCCGCGGGACGCACGCCCGGGACCCGCGCGGGCCGUGCGCUCUGCACUCCGGAGCGGUUCCCUGAGCGCCGCGGCCGCAGAGCCUCUCCGGCCGGCGCCCAUUGUUCCCCGCGGGGGCGGGGCGCCUGGAGCCGGGCGGCGCGCCGCGCCCCUGAACGCCAGAGGGAGGGAGGGAGGCAAGAAGGGAGCGCGGGGUCCCCGCGCCCAGCCGGGCCCGGGAGGAGGUGUAGCGCGGCGAGCCCGGGGACUCGGAGCGGGACUAGGAUCCUCCCCGCGGCGCGCAGCCUGCCCAAGCAUGGGCGCCUGAGGCUGCCCCCACGCCGGCGGCAAAGGACGCGUCCCCACGGGCGGACUGACCGGCGGGCGGACCUGGAGCCCGUCCGCGGCGCCGCGCUCCUGCCCCCGGCCCGGUCCGACCCCGGCCCCUGGCGCCAUGGACAAGCUGCCGCCGUCCAUGCGCAAGCGGCUCUACAGCCUCCCGCAGCAGGUGGGGGCCAAGGCGUGGAUCAUGGACGAGGAAGAGGACGCCGAGGAGGAGGGGGCCGGGGGCCGCCAAGACCCCAGCCGCAGGAGCAUCCGGCUGCGGCCACUGCCCUCGCCCUCCCCCUCGGCGGCCGCGGGUGGCACGGAGUCCCGGAGCUCGGCCCUCGGGGCAGCGGACAGCGAAGGGCCGGCCCGCGGCGCGGGCAAGUCCAGCACGAACGGCGACUGCAGGCGCUUCCGCGGGAGCCUGGCCUCGCUGGGCAGCCGGGGCGGCGGCAGCGGCGGCACGGGGAGCGGCAGCAGUCACGGACACCUGCAUGACUCCGCGGAGGAGCGGCGGCUCAUCGCCGAGGGCGACGCGUCCCCCGGCGAGGACAGGACGCCCCCAGGCCUGGCGGCCGAGCCCGAGCGCCCCGGCGCCUCGGCGCAGCCCGCAGCCUCGCCGCCGCCGCCCCAGCAGCCACCGCAGCCGGCCUCCGCCUCCUGCGAGCAGCCCUCGGUGGACACCGCUAUCAAAGUGGAGGGAGGCGCGGCUGCCGGCGACCAGAUCCUCCCGGAGGCCGAGGUGCGCCUGGGCCAGGCCGGCUUCAUGCAGCGCCAGUUCGGGGCCAUGCUCCAACCCGGGGUCAACAAAUUCUCCCUAAGGAUGUUCGGCAGCCAGAAAGCCGUGGAGCGCGAACAGGAGAGGGUCAAGUCGGCCGGAUUUUGGAUUAUCCACCCCUACAGUGACUUCAGAUUUUACUGGGACCUGACCAUGCUGCUGCUGAUGGUGGGAAACCUGAUUAUCAUUCCUGUGGGCAUCACCUUCUUCAAGGAUGAGAACACCACACCCUGGAUUGUCUUCAAUGUGGUGUCAGACACAUUCUUCCUCAUCGACUUGGUCCUCAACUUCCGCACAGGGAUCGUGGUGGAGGACAACACAGAGAUCAUCCUGGACCCGCAGCGGAUUAAAAUGAAGUACCUGAAAAGCUGGUUCAUGGUAGAUUUCAUUUCCUCCAUCCCCGUGGACUACAUCUUCCUCAUUGUGGAGACACGCAUCGACUCGGAGGUCUACAAGACUGCCCGGGCCCUGCGCAUUGUCCGCUUCACGAAGAUCCUCAGCCUCUUACGCCUGUUACGCCUCUCCCGCCUCAUUCGAUAUAUUCACCAGUGGGAAGAGAUCUUCCACAUGACCUACGACCUGGCCAGCGCCGUGGUGCGCAUCGUGAACCUCAUCGGCAUGAUGCUCCUGCUCUGCCACUGGGACGGCUGCCUGCAGUUCCUGGUACCCAUGCUACAGGACUUCCCUGACGACUGCUGGGUGUCCAUCAACAACAUGGUGAACAACUCCUGGGGGAAGCAGUACUCCUACGCGCUCUUCAAGGCCAUGAGCCACAUGCUGUGCAUCGGCUACGGGCGGCAGGCGCCCGUGGGCAUGUCCGACGUCUGGCUCACCAUGCUCAGCAUGAUCGUGGGUGCCACCUGCUACGCCAUGUUCAUUGGCCACGCCACUGCCCUCAUCCAGUCCCUGGACUCCUCCCGGCGCCAGUACCAGGAAAAGUACAAGCAGGUGGAGCAGUACAUGUCCUUUCACAAGCUCCCGCCCGACACCCGGCAGCGCAUCCACGACUACUACGAGCACCGCUACCAGGGCAAGAUGUUCGACGAGGAGAGCAUCCUGGGCGAGCUAAGCGAGCCCCUGCGGGAGGAGAUCAUCAACUUUAACUGUCGGAAGCUGGUGGCCUCCAUGCCACUGUUUGCCAAUGCGGACCCCAACUUCGUGACGUCCAUGCUGACCAAGCUGCGUUUCGAGGUCUUCCAGCCUGGGGACUACAUCAUCCGGGAAGGCACCAUUGGCAAGAAGAUGUACUUCAUCCAGCAUGGCGUGGUCAGCGUGCUCACCAAGGGCAACAAGGAGACCAAGCUGGCCGACGGCUCCUACUUUGGAGAGAUCUGCCUGCUGACCCGGGGCCGGCGCACAGCCAGCGUGAGGGCCGACACCUACUGCCGCCUCUACUCGCUGAGCGUGGACAACUUCAAUGAGGUGCUGGAGGAGUACCCCAUGAUGCGAAGGGCCUUCGAGACCGUGGCGCUGGACCGCCUGGACCGCAUUGGCAAGAAGAACUCCAUCCUCCUCCACAAAGUCCAGCACGACCUCAACUCCGGCGUCUUCAACUACCAGGAGAAUGAGAUCAUCCAGCAGAUUGUGCAGCAUGACCGGGAGAUGGCCCACUGCGCGCACCGCGUCCAGGCUGCUGCCUCUGCCACCCCAACCCCCACGCCCGUCAUCUGGACCCCGCUGAUCCAGGCACCACUGCAGGCUGCCGCUGCCACCACUUCUGUGGCCAUAGCCCUCACCCACCACCCUCGCCUGCCUGCUGCCAUCUUCCGCCCUCCCCCAGGAUCUGGGCUGGGCAACCUCGGUGCCGGGCAGACGCCAAGGCACCUGAAACGGCUGCAGUCCCUGAUCCCUUCUGCGCUGGGCUCCGCCUCGCCCGCCAGCAGCCCGUCCCAGGUGGACACACCGUCUUCAUCCUCCUUCCACAUCCAACAGCUGGCUGGAUUCUCUGCCCCCGCUGGACUGAGCCCACUCCUGCCCUCAUCCAGCUCCUCCCCACCCCCCGGGGCCUGUGGCUCCCCCUCGGCUCCCACACCAUCAGCUGGCGUAGCCGCCACCACCAUAGCCGGGUUUGGCCACUUCCACAAGGCGCUGGGUGGCUCCCUGUCCUCCUCCGACUCUCCCCUGCUCACCCCGCUGCAGCCAGGCGCCCGCUCCCCGCAGGCUGCCCAGCCAUCUCCCGCGCCACCCGGGGCCCGGGGAGGCCUGGGACUCCCGGAGCACUUCCUGCCACCCCCACCCUCAUCCAGAUCCCCGUCAUCUAGCCCCGGGCAGCUGGGCCAGCCUCCCGGGGAGUUGUCCCUAGGUCUGGCCACUGGCCCACUGAGCACGCCAGAGACACCCCCACGGCAGCCUGAGCCGCCGUCCCUUGUGGCAGGGGCCUCUGGGGGGGCUUCCCCUGUAGGCUUUACUCCCCGAGGAGGUCUCAGCCCCCCUGGCCACAGCCCAGGCCCCCCAAGAACCUUCCCGAGUGCCCCGCCCCGGGCCUCUGGCUCCCACGGAUCCUUGCUCCUGCCACCUGCAUCCAGCCCCCCACCACCCCAGGUCCCCCAGCGCCGGGGCACACCCCCGCUCACCCCCGGCCGCCUCACCCAGGACCUCAAGCUCAUCUCCGCGUCUCAGCCAGCCCUGCCUCAGGACGGGGCGCAGACUCUCCGCAGAGCCUCCCCGCACUCCUCAGGGGAGUCCAUGGCUGCCUUCCCGCUCUUCCCCAGGGCUGGGGGUGGCAGCGGGGGCAGUGGGAGCAGCGGGGGCCUCGGUCCCCCUGGGAGGCCCUAUGGUGCCAUCCCCGGCCAGCACGUCACUCUGCCUCGGAAGACAUCCUCAGGUUCUUUGCCACCCCCUCUGUCUUUGUUUGGGGCAAGAGCCACCUCUUCUGGGGGGCCCCCUCUGACUGCUGGACCCCAGAGGGAACCUGGGGCCAGGCCUGAGCCAGUGCGCUCCAAACUGCCAUCCAAUCUAUGAGCUGGGCCCUUCCUUCCCUCUUCUUUCUUCUUUUCUCUCCCUUCCUUCUUCCUUCAGGUUUAACUGUGAUUAGGAGAUAUACCAAUAACAGUAAUAAUUAUUUAAAAAACCACACACACCAGAAAAACAAAAGACAGCAGAAAAUAACCAGGUAUUCUUAGAGCUAUAGAUUUUUGGUCACUUGCUUUUAUAGACUAUUUUAAUACUCAGCACUAGAGGGAGGGAGGGGGAGGGAGGAGGGAGCAGGCAGGUCCCAAAUGCAAAAGCCAGAGAAAGGCAGAUGGGGUCUCCGGGGCUGGGCAGGGGUGGGAGUGGCCAGUGUUGGCGGUUCUUAGAGCAGAUGUGUCAUUGUGUUCAUUUAGAGAAACAGCUGCCAUCAGCCCGUUAGCUGUAACUUGGAGCUCCACUCUGCCCCCAGAAAGGGGCUGCCCUGGGGUGUGCCCUGGGGAGCCUCAGAAGCCUGCGACCUUGGGAGAAAAGGGCCAGGGCCCUGAGGGCCUAGCAUUUUUUCUACUGUAAACGUAGCAAGAUCUGUAUAUGAAUAUGUAUAUGUAUAUGUAUGUAAGAUGUGUAUAUGUAUAGCUAUGUAGCGCUCUGUAGAGCCAUGUAGAUAGCCACUCACAUGUGCGCACACGUGUGCGGUCUAGUUUAAUCCCAUGUUGACAGGAUGCCCAGGUCACCUUACACCCAGCAACCCGCC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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-3037.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -3149.02
Frequency: 0.0000
Diversity: 1372.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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