Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005563.4

Sequence Length

1443 nt

GC Content

0.4310

AGAGUGUGGUCAGGCGGCUCGGACUGAGCAGGACUUUCCUUAUCCCAGUUGAUUGUGCAGAAUACACUGCCUGUCGCUUGUCUUCUAUUCACCAUGGCUUCUUCUGAUAUCCAGGUGAAAGAACUGGAGAAGCGUGCCUCAGGCCAGGCUUUUGAGCUGAUUCUCAGCCCUCGGUCAAAAGAAUCUGUUCCAGAAUUCCCCCUUUCCCCUCCAAAGAAGAAGGAUCUUUCCCUGGAGGAAAUUCAGAAGAAAUUAGAAGCUGCAGAAGAAAGACGCAAGUCCCAUGAAGCUGAGGUCUUGAAGCAGCUGGCUGAGAAACGAGAGCACGAGAAAGAAGUGCUUCAGAAGGCAAUAGAAGAGAACAACAACUUCAGUAAAAUGGCAGAAGAGAAACUGACCCACAAAAUGGAAGCUAAUAAAGAGAACCGAGAGGCACAAAUGGCUGCCAAACUGGAACGUUUGCGAGAGAAGGAUAAGCACAUUGAAGAAGUGCGGAAGAACAAAGAAUCCAAAGACCCUGCUGACGAGACUGAAGCUGACUAAUUUGUUCUGAGAACUGACUUUCUCCCCAUCCCCUUCCUAAAUAUCCAAAGACUGUACUGGCCAGUGUCAUUUUAUUUUUUCCCUCCUGACAAAUAUUUUAGAAGCUAAUGUAGGACUGUAUAGGUAGAUCCAGAUCCAGACUGUAAGAUGUUGUUUUAGGGGCUAAAGGGGAGAAACUGAAAGUGUUUUACUCUUUUUCUAAAGUGUUGGUCUUUCUAAUGUAGCUAUUUUUCUUGUUGCAUCUUUUCUACUUCAGUACACUUGGUGUACUGGGUUAAUGGCUAGUACUGUAUUGGCUCUGUGAAAACAUAUUUGUGAAAAGAGUAUGUAGUGGCUUCUUUUGAACUGUUAGAUGCUGAAUAUCUGUUCACUUUUCAAUCCCAAUUCUGUCCCAAUCUUACCAGAUGCUACUGGACUUGAAUGGUUAAUAAAACUGCACAGUGCUGUUGGUGGCAGUGACUUCUUUUGAGUUAGGUUAAUAAAUCAAGCCAUAGAGCCCCUCCUGGUUGAUACUUGUUCCAGAUGGGGCCUUUGGGGCUGGUAGAAAUACCCAACGCACAAAUGACCGCACGUUCUCUGCCCCGUUUCUUGCCCCAGUGUGGUUUGCAUUGUCUCCUUCCACAAUGACUGCUUUGUUUGGAUGCCUCAGCCCAGGUCAGCUGUUACUUUCUUUCAGAUGUUUAUUUGCAAACAACCAUUUUUUGUUCUGUGUCCCUUUUAAAAGGCAGAUUAAAAGCACAAGCGUGUUUCUAGAGAACAGUUGAGAGAGAAUCUCAAGAUUCUACUUGGUGGUUUGCUUGCUCUACGUUACAGGUGGGGCAUGUCCUCAUCCUUUCCUGCCAUAAAAGCUAUGACACGAGAAUCAGAAUAUUAAUAAAACUUUAUGUACUGCUGUAGCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-398.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -428.42

Frequency: 0.0000

Diversity: 280.78

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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