Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005625.4

Sequence Length

2073 nt

GC Content

0.3821

AGUGACCGGAGGCGGCGGCGGCGAGCGGUUCCUUGUGGGCUAGAAGAAUCCUGCAAAAAUGUCUCUCUAUCCAUCUCUCGAAGACUUGAAGGUAGACAAAGUAAUUCAGGCUCAAACUGCUUUUUCUGCAAACCCUGCCAAUCCAGCAAUUUUGUCAGAAGCUUCUGCUCCUAUCCCUCACGAUGGAAAUCUCUAUCCCAGACUGUAUCCAGAGCUCUCUCAAUACAUGGGGCUGAGUUUAAAUGAAGAAGAAAUACGUGCAAAUGUGGCCGUGGUUUCUGGUGCACCACUUCAGGGGCAGUUGGUAGCAAGACCUUCCAGUAUAAACUAUAUGGUGGCUCCUGUAACUGGUAAUGAUGUUGGAAUUCGUAGAGCAGAAAUUAAGCAAGGGAUUCGUGAAGUCAUUUUGUGUAAGGAUCAAGAUGGAAAAAUUGGACUCAGGCUUAAAUCAAUAGAUAAUGGUAUAUUUGUUCAGCUAGUCCAGGCUAAUUCUCCAGCCUCAUUGGUUGGUCUGAGAUUUGGGGACCAAGUACUUCAGAUCAAUGGUGAAAACUGUGCAGGAUGGAGCUCUGAUAAAGCGCACAAGGUGCUCAAACAGGCUUUUGGAGAGAAGAUUACCAUGACCAUUCGUGACAGGCCCUUUGAACGGACGAUUACCAUGCAUAAGGAUAGCACUGGACAUGUUGGUUUUAUCUUUAAAAAUGGAAAAAUAACAUCCAUAGUGAAAGAUAGCUCUGCAGCCAGAAAUGGUCUUCUCACGGAACAUAACAUCUGUGAAAUCAAUGGACAGAAUGUCAUUGGAUUGAAGGACUCUCAAAUUGCAGACAUACUGUCAACAUCUGGGACUGUAGUUACUAUUACAAUCAUGCCUGCUUUUAUCUUUGAACAUAUUAUUAAGCGGAUGGCACCAAGCAUUAUGAAAAGCCUAAUGGACCACACCAUUCCUGAGGUUUAAAAUUCACGGCACCAUGGAAAUGUAGCUGAACGUCUCCAGUUUCCUUCUUUGGCAACUUCUGUAUUAUGCACGUGAAGCCUUCCCGGAGCCAGCGAGCAUAUGCUGCAUGAGGACCUUUCUAUCUUACAUUAUGGCUGGGAAUCUUACUCUUUCAUCUGAUACCUUGUUCAGAUUUCAAAAUAGUUGUAGCCUUAUCCUGGUUUUACAGAUGUGAAACUUUCAAGAGAUUUACUGACUUUCCUAGAAUAGUUUCUCUACUGGAAACCUGAUGCUUUUAUAAGCCAUUGUGAUUAGGAUGACUGUUACAGGCUUAGCUUUGUGUGAAAACCAGUCACCUUUCUCCUAGGUAAUGAGUAGUGCUGUUCAUAUUACUUUAGUUCUAUAGCAUACUUGCAUCUUUAACAUGCUAUCAUAGUACAUUUAGAAUGAUUGCCUUUGAUUUUUUUUUUAAAUUCUGUGUGUGUGUGUGUAAAAUGCCAAUUAAGAACACUGGUUUCAUUCCAUGUAAGCAUUAAACAGUGUAUGUAGGUUUCAAGAGAUUGUGAUGAUUCUUAAAUUUUAACUACCUUCACUUAAUAUGCUUGAACUGUCGCCUUAACUAUGUUAAGCAUCUAGACUAAAAGCCAAAAUAUAAUUAUUGCUGCCUUUCUAAAAACCCAAAAUGUAGUUCUCUAUUAACCUGAAAUGUACACUAGCCCAGAACAGUUUAAUGGUACUUACUGAGCUAUAGCAUAGCUGCUUAGUUGUUUUUGAGAUUUUUUAGUCAACACAUAAUGGAAACUUCUUUCUUCUAAAAGUUGCCAGUGCCACUUUUAAGAAGUGAAUCACUAUAUGUGAUGUAAAAGUUAUUACACUAAACAGGAUAAACUUUUGACUCCCCUUUUGUUCAUUUGUGGAUUAAGUGGUAUAAUACUUAAUUUUGGCAUUUGACUCUUAAGAUUAUGUAACCUAGCUACUUUGGGAUGGUCUUAGAAUAUUUUUCUGAUAACUUGUUCCUUUUCCUGACUCCUCCUUGCAAACAAAAUGAUAGUUGACACUUUAUCCUGAUUUUUUUCUUCUUUUUGGUUUAUGUCUAUUCUAAUUAAAUAUGUAUAAAUAAAGUUACAUUUUAGUCUGUC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-518.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -559.26

Frequency: 0.0000

Diversity: 522.85

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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