Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005626.5

Sequence Length

2300 nt

GC Content

0.5143

GCGUGCUCGCGUACGUCGCCGGGGUUCGGCUGCGUCCGUCCCGCCGCCCGCCCGUUGCCGCCGCCGCCGCUGCCGCCGUGCUCUCGCUUUGCCCGCCGCCGCCUAAGGGGGGCUGGGGCCGGGGCCAGCCAUCACUGCCGUUGCCGGGAUGCCGCGGGUGUACAUCGGCCGCCUGAGCUACCAGGCCCGGGAGCGCGAUGUGGAGCGCUUCUUUAAGGGCUACGGGAAGAUCCUGGAGGUGGAUCUGAAGAACGGAUAUGGUUUUGUGGAGUUUGAUGAUCUGCGUGAUGCAGAUGAUGCUGUUUAUGAACUGAAUGGCAAAGACCUUUGUGGUGAGCGAGUAAUUGUUGAGCAUGCCCGCGGCCCACGGCGAGAUGGCAGUUACGGUUCUGGACGCAGUGGAUAUGGUUAUAGAAGAAGUGGCCGAGAUAAAUAUGGCCCUCCUACUCGCACAGAGUACAGACUUAUUGUGGAGAAUUUGUCAAGUCGGUGCAGCUGGCAAGACCUAAAGGAUUAUAUGCGUCAGGCAGGAGAAGUGACUUAUGCAGAUGCUCACAAGGGACGCAAAAAUGAAGGGGUGAUUGAAUUUGUAUCUUAUUCUGAUAUGAAAAGAGCUUUGGAAAAGUUGGAUGGAACUGAAGUCAAUGGGAGAAAAAUCAGAUUAGUUGAAGACAAGCCAGGUUCCAGACGACGCCGGUCCUACUCCAGAAGCCGGAGUCAUUCAAGGUCUCGCUCUCGAAGCAGACAUUCCCGUAAGAGCAGAAGCCGAAGUGGCAGCAGCAAAAGCAGUCAUUCUAAGAGUAGAUCUCGGUCCAGGUCGGGCUCCCGCUCCCGGAGCAAGAGCCGGAGCCGGAGCCAGAGUCGGAGCCGGAGCAAGAAAGAGAAAAGCAGGAGCCCCAGCAAGGAAAAGAGCCGCAGCCGCAGCCAUAGCGCUGGCAAGAGCCGCAGCAAGAGCAAAGACCAAGCUGAAGAGAAGAUCCAAAACAAUGACAAUGUCGGGAAACCCAAGAGCCGGAGUCCUAGCAGGCAUAAAAGUAAGAGCAAAAGUCGGAGCAGGAGUCAGGAGAGGAGAGUGGAGGAGGAGAAGCGAGGGAGUGUGAGCAGGGGCAGGAGCCAGGAGAAGAGCCUCCGCCAGAGUCGGAGCCGGAGCAGGAGCAAAGGGGGCAGCAGGAGCCGGAGCAGGAGCCGCAGCAAGAGCAAGGACAAGAGGAAGGGCAGGAAGAGAAGCAGAGAGGAGAGCCGCAGUCGCAGUCGCAGCCGCAGCAAGAGUGAGAGGAGCAGAAAGCGAGGCAGCAAGCGAGACAGCAAGGCGGGCAGCAGCAAGAAGAAGAAGAAGGAAGACACUGACCGCUCCCAGUCCAGAUCUCCAUCCCGCUCCGUGUCAAAGGAGCGGGAACAUGCCAAGUCUGAAUCCAGCCAGAGGGAAGGUCGAGGAGAGAGUGAGAAUGCUGGCACCAAUCAGGAGACCCGGUCCAGGUCGAGAUCCAAUUCCAAAUCGAAACCAAACCUUCCAUCAGAAUCACGCUCCAGAUCAAAGUCAGCUUCAAAAACCCGAUCUCGGUCCAAGUCUAGAUCCAGGUCUGCUUCCAGAUCGCCCUCCCGAUCUAGAUCUAGGUCCCACUCAAGGUCCUAACUGGCUAUGGCCACAGCUGGAACUACCCGAGAAGUCUUUUGUACAUGUUUGGUAGCCGUAGCACAAGUGAUUGGAGUAGAACAUGUCACUGCUGUACAUUUUUAACUCCCCUAAUGGUGUGUCUAUAAUUGUUAAAUCUAAGUGCUUCCUCUCAGUAAAGCCUCCUGGCACCAGGCCUUCCUGCUCGACUGAAAAAAAUUUUCUCUUUGAAAAUCCCCUUUUACUCAUGGCCCACAGUAGAAUAUCCAAAACGCCUUGGCUUUCAGGCCUGGCCUUUCCUACAGGGAGCUCAGUAACCUGGACGGCUCUAAGGCUGGAAUGACCACAUAGGUAGGUAUGGUGAGUUCAACCAUUUUUGCUCUUGAAUUGAUGCCCUUCGAUGUAUGCCAUUUAGUGAAAGUGCUAAGUCUUAAGUUUCCUACCACUUUGGUUUCAUAUUUUUGGACUUAACAAAGUUGUGAAUAGCACAGUCGAGGAAAAUUGAUACCUGCAGUAACCCAUAGGAAAUAAACUGUAGAGUUCCAUAUUCUGGUAUUGUGAUUAUAUUGUUUUAUAUUAAAAAAGAAAAGAAAAGAAUUUUUUUUAAUUUUAUUUUUCCCCGUCUUGCAAAGUAUAGUGACCCCUGUUUCCAUUAAAUUUGAAUAAAGACUAUUUUUGCUUGACAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-724.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -769.83

Frequency: 0.0000

Diversity: 686.18

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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