Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005727.4

Sequence Length

1619 nt

GC Content

0.5207

AGACACACACACCAGCAGCUACACCUACACGCUGACCAUCACAGGCACACAGAGGCACAUCCACCUCACAUCCACCUCAUACUUGUGUACUCUCAGGGUUCAGUCUUUCAUCCUAUCCCUCUCUGAUCUGUGCCUCCCAAUACCUUCCAAGAUGUUUACAGAGACCCUUCUCCCUGUGCAGUUAGGAGUGUAAGGCAAGAGAGCCCCUACUUCAUGGGGCAGAUCAAGAGCUGAGACCAAAGAUGGUCUAUGUUGCUGACCUUGUCCUGUCCUCCUGCUGUCUUAAACUAUGAUCCCUGCUGCGGUCACUGAAGCCUUUCCCUGUGAGCAGUGGUGUGUGAGAGCCAGGCGUCCCUCUGCCUGCCCACUCAGUGGCAACACCCGGGAGCUGUUUUGUCCUUUGUGGAGCCUCAGCAGUUCCCUCUUUCAGAACUCACUGCCAAGAGCCCUGAACAGGAGCCACCAUGCAGUGCUUCAGCUUCAUUAAGACCAUGAUGAUCCUCUUCAAUUUGCUCAUCUUUCUGUGUGGUGCAGCCCUGUUGGCAGUGGGCAUCUGGGUGUCAAUCGAUGGGGCAUCCUUUCUGAAGAUCUUCGGGCCACUGUCGUCCAGUGCCAUGCAGUUUGUCAACGUGGGCUACUUCCUCAUCGCAGCCGGCGUUGUGGUCUUUGCUCUUGGUUUCCUGGGCUGCUAUGGUGCUAAGACUGAGAGCAAGUGUGCCCUCGUGACGUUCUUCUUCAUCCUCCUCCUCAUCUUCAUUGCUGAGGUUGCAGCUGCUGUGGUCGCCUUGGUGUACACCACAAUGGCUGAGCACUUCCUGACGUUGCUGGUAGUGCCUGCCAUCAAGAAAGAUUAUGGUUCCCAGGAAGACUUCACUCAAGUGUGGAACACCACCAUGAAAGGGCUCAAGUGCUGUGGCUUCACCAACUAUACGGAUUUUGAGGACUCACCCUACUUCAAAGAGAACAGUGCCUUUCCCCCAUUCUGUUGCAAUGACAACGUCACCAACACAGCCAAUGAAACCUGCACCAAGCAAAAGGCUCACGACCAAAAAGUAGAGGGUUGCUUCAAUCAGCUUUUGUAUGACAUCCGAACUAAUGCAGUCACCGUGGGUGGUGUGGCAGCUGGAAUUGGGGGCCUCGAGCUGGCUGCCAUGAUUGUGUCCAUGUAUCUGUACUGCAAUCUACAAUAAGUCCACUUCUGCCUCUGCCACUACUGCUGCCACAUGGGAACUGUGAAGAGGCACCCUGGCAAGCAGCAGUGAUUGGGGGAGGGGACAGGAUCUAACAAUGUCACUUGGGCCAGAAUGGACCUGCCCUUUCUGCUCCAGACUUGGGGCUAGAUAGGGACCACUCCUUUUAGGCGAUGCCUGACUUUCCUUCCAUUGGUGGGUGGAUGGGUGGGGGGCAUUCCAGAGCCUCUAAGGUAGCCAGUUCUGUUGCCCAUUCCCCCAGUCUAUUAAACCCUUGAUAUGCCCCCUAGGCCUAGUGGUGAUCCCAGUGCUCUACUGGGGGAUGAGAGAAAGGCAUUUUAUAGCCUGGGCAUAAGUGAAAUCAGCAGAGCCUCUGGGUGGAUGUGUAGAAGGCACUUCAAAAUGCAUAAACCUGUUACAAUGUUGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-561.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -586.63

Frequency: 0.0000

Diversity: 397.91

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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