Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_005764.4
Sequence Length
838 nt
GC Content
0.5871
AGACUGAGCCCAGGUUGAUUUCAGGCGGACACCAAUAGACUCCACAGCAGCUCCAGGAGCCCAGACACCGGCGGCCAGAAGCAAGGCUAGGAGCUGCUGCAGCCAUGUCGGCCCUCAGCCUCCUCAUUCUGGGCCUGCUCACGGCAGUGCCACCUGCCAGCUGUCAGCAAGGCCUGGGGAACCUUCAGCCCUGGAUGCAGGGCCUUAUCGCGGUGGCCGUGUUCCUGGUCCUCGUUGCAAUCGCCUUUGCAGUCAACCACUUCUGGUGCCAGGAGGAGCCGGAGCCUGCACACAUGAUCCUGACCGUCGGAAACAAGGCAGAUGGAGUCCUGGUGGGAACAGAUGGAAGGUACUCUUCGAUGGCGGCCAGUUUCAGGUCCAGUGAGCAUGAGAAUGCCUAUGAGAAUGUGCCCGAGGAGGAAGGCAAGGUCCGCAGCACCCCGAUGUAACCUUCUCUGUGGCUCCAACCCCAAGACUCCCAGGCACAUGGGAUGGAUGUCCAGUGCUACCACCCAAGCCCCCUCCUUCUUUGUGUGGAAUCUGCAAUAGUGGGCUGACUCCCUCCAGCCCCAUGCCGGCCCUACCCGCCCUUGAAGUAUAGCCAGCCAAGGUUGGAGCUCAGACCGUGUCUAGGUUGGGGCUCGGCUGUGGCCCUGGGGUCUCCUGCUCAGCUCAGAAGAGCCUUCUGGAGAGGACAGUCAGCUGAGCACCUCCCAUCCUGCUCACACGUCCUUCCCCAUAACUAUGGAAAUGGCCCUAAUUUCUGUGAAAUAAAGACUUUUUGUAUUUCUGGGGCUGAGGCUCAGCAACAGCCCCUCAGGCUUCCAGUGAGUCCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-311.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -326.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 278.38
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((...(((((((.....(((.((((......(.((...((((((((((....(((........)))((((........)))).)))))))))).)))..)))).))).))))))).)))).)))(((((((((.(((((.(.((.....))).))))).))).))))))(((((..(((((((((((((((((((((....((.((..((((((((((((((.(((.(((((((......)))))).)........(((((((((.((((((.....((((...((..((.((((.((((..(((..((.......))...))))))))))).))..))..)))).))))))..)))).)))))....))).)))).))))))).....)))..)).))....))))(((.((((.(((.(((.(((((((.(((((((.((((....((((.((((((((((.......(((((......)))))(((....))).(((..((((.((((...........)))).)))).....)))...(.((((((........)))))))..((.(((..(((...........)))..))).))...))))))))))))))....)).)).)))))))....))))))).)))...))))))).))).((((....)))).....((.((((((.((..(.((((((..........))))))))))))))).))......(((((((((.......)))))))))..............))))..)))))))))))))((((.....((((.....)))).....))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.((((...(((((((.....(((.((((......{.{{...((((((((((....(((........)))((((........)))).)))))))))).}},..)))).))).))))))).)))).)))(((((((((.(((((.(.((.....))).))))).))),,)))))(((((..,{{({((((((,,.,||||||,..,{{{,{({({({({((((({({{(((,,{(((((......)))))}.,.,{{,...{||||{{{{.|||||,}.}}}|||{}}.||,.||,|{(({,((,..{{,..,..}}},,.|||{,}|||||||||}.||,,||{.||||.||||||..}|||{|||},....|)),)}}}.|}||||}...,})))..}},|.,||,|}},(((,((({.(({.(((.(((((((.(((((((.(({(,...((((.((((((((((...,{,.(((,{.{{{,,,||||,((,.,.,,.{|{{|.{|||.{,||}....}}},,,},)),)))),.}}}||,...{.((((((........))))))}.,{{.(((..(((.,,.....}..)))..))).))...))))))))))))))....)}.)).)))))))....))))))).))),,{|}}}}}|{|||{(((({{{{|,,|}}}}}|{.{{{{,,.,|,,|}||||||,,,.}}.},,)})))})))))})}},,|{{{....||||,,{,}}},,,.}}}}}},,{{{{{{.{{,...,}},))}})),|||||||,,|(,.,))..})))))).,,)))),}}},))))))))).
Back