Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_005798.5
Sequence Length
6720 nt
GC Content
0.3747
GAGUCCAUUUUGGGGCUGUGCUUGGCGCGUACCGUGCGGUCCCUGUAGUUGGAGGACGGGCGGUCGCGCGGCCUUUCCCACUAGCCGGAGUAGCCUCUAGUUCGUUAGUCAAAACGUGAAAAAAAAGACCUGCUUUGCCCUGGGAAAUAGUAACCCUGCCAAAUACAUCAGCUUGUAGGAGACAGAGGAUGUGAUGGAGCUGCUUGAAGAAGAUCUCACAUGCCCUAUUUGUUGUAGUCUGUUUGAUGAUCCACGGGUUUUGCCUUGCUCCCACAACUUCUGCAAAAAAUGCUUAGAAGGUAUCUUAGAAGGGAGUGUGCGGAAUUCCUUGUGGAGACCAGCUCCAUUCAAGUGUCCUACAUGCCGUAAGGAAACUUCAGCUACUGGAAUUAAUAGCCUGCAGGUUAAUUACUCCCUGAAGGGUAUUGUGGAAAAGUAUAACAAGAUCAAGAUCUCUCCCAAAAUGCCAGUAUGCAAAGGACACUUGGGGCAGCCUCUCAACAUUUUCUGCCUGACUGAUAUGCAGCUGAUUUGUGGGAUCUGUGCUACUCGUGGGGAGCACACCAAACAUGUCUUCUGUUCUAUUGAAGAUGCCUAUGCUCAGGAAAGGGAUGCCUUUGAGUCCCUCUUCCAGAGCUUUGAGACCUGGCGUCGGGGAGAUGCUCUUUCUCGCUUGGAUACCUUGGAAACUAGUAAGAGGAAAUCCCUACAGUUACUGACUAAAGAUUCAGAUAAAGUGAAGGAAUUUUUUGAGAAGUUACAACACACACUGGAUCAAAAGAAGAAUGAAAUUCUGUCUGACUUUGAGACCAUGAAACUUGCUGUUAUGCAAGCAUAUGACCCAGAGAUCAACAAACUCAACACCAUCUUGCAGGAGCAACGGAUGGCCUUUAACAUUGCUGAGGCUUUCAAAGAUGUGUCAGAACCCAUUGUAUUUCUGCAACAGAUGCAGGAGUUUAGAGAGAAAAUCAAAGUAAUCAAGGAAACUCCUUUACCUCCCUCUAAUUUGCCUGCAAGCCCUUUAAUGAAGAACUUUGAUACCAGUCAGUGGGAAGACAUAAAACUAGUCGAUGUGGAUAAACUUUCUUUGCCUCAAGACACUGGCACAUUCAUUAGCAAGAUUCCCUGGAGCUUUUAUAAGUUAUUUUUGCUAAUCCUUCUGCUUGGCCUUGUCAUUGUCUUUGGUCCUACCAUGUUCCUAGAAUGGUCAUUAUUUGAUGACCUGGCAACUUGGAAAGGCUGUCUUUCAAACUUCAGUUCCUAUCUGACUAAAACAGCCGAUUUCAUAGAACAAUCAGUUUUUUACUGGGAACAGGUGACAGAUGGGUUUUUCAUUUUCAAUGAAAGAUUCAAGAAUUUUACUUUGGUGGUACUGAACAAUGUGGCAGAAUUUGUGUGCAAAUAUAAACUAUUAUAAAAUCUGUUUCAAGUAUGCAGUUUUCUUUUGUUAGAAAUUGUUAGAGAAUAGAGAGUGGUAAUUCAGAUUUGGUCAACGAUUCUAGUCACAUAUUUUCCUCCAAAAGUAUUCCUUCCAAAAAUAAUCUAUACAUGUUCAAAUUAGGUAGCAUAAAGAUAAAAGUGAAAUUUAGUAGUAUAGGCCUGAACCUUUUUUUGUUUAAAAGAGUGCUUUUGAAAUAAGCAUCCACCCCAAAUGUUGGUUGUAUUUAUGCUGUGAUAAAAAUAGGUGAGAGAUCAUAUGAUCUAAUAUUGUAUUGAUGGAAGUAUAGGUAGUAUAGUAGUGAUUGUUCUUCAAGCAUGCAGUAAAGAUCACUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUUGAGAUGGAGUCUUGCUCUGUCGCCCAGGCUGGAGUGCAGUGAUGCAAUCUUGGCUCACUGCAGCCUCUACCUCCCAGGUUCAAGUGAUUAUCCUGCCUUAGCCUCCUGAGUAGCUGGGAUUACAGGCGCGUGCCACCACGCCCAGCUAAUUUUUUGUAUUUUUAGUUGAGACAGGGUUUCACUGUCCCUUAAGACCAUCCUGUUAGCCAAGAUGGUCUUGAUCUCCUGACCUCGUGAUCCGCCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGUGUGAGCCACCGUGCCCAGCCAAAGACUGCUCUUAAAGCACCUUUUUGACAGUGAACAUGGUCUAAAAAAGGGAAGAUAUUGUAGAAGAUUUCACACACACACGCGUGUGUGGGAGACAACUAAAGGUAUUGAAGGUACUAAUUAAUUAGAUUUCCAAAAUUUUCUACAGAGAGUUAAUUAUCACCAAAAUGUGAAUGGUACAUACAAAACCUGGCAUUUUCUUGUGAUAAGUUUACAUUUUUAGGAGAGUGGAGCUUUCAAUCUGCCCUUUUCUCCUUUGUUUUUGUAGUUUUCACCAAAGAUGAUCAACUAGAAAUGUUAAGUGGCUAUGCAAGCAAAAGCAUAGAUAGGUUAAAAAAAAGGAUCAGCUGGCUGGGCAGGGUGGCUCAUGUCUAUAAUCUCAGCAUUCUAGGACAGUGAUGUGGGAGGAUUAUUUGAGGCUAGGAGUUCCAGUUCGAAACCAGCUUCGUAAACAUAGCAAGACCCAGUCUCUACCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUAUAUAUAUAUAUAUACACACACACACACACAUAUGUACACAUACAUAUAUAUACAUAUAUAUGUAUAUAUAGAACACAUGGCAAGAGCAGGAAAUGGGAAGACUACCUUUUUUCUGGCAGCUAUGUGUUGUUUUGUUCGAAAGAUGGCAAGUGUACAACCAAACCAAUCCACUUGCUUACAGAAAGAAUGUUUAGUGUAGUUAAGACUAAUUUGACAACAGAUAAAACAGUCUGUCAGCUAUUACAAAGUAAUCAGCUGAACACUAAUGCUGUUCUGUCUGCUCACAAGAGAUAAAGAUACCCUCUCAUGGAAUAAACACCUUGCUUAGAAUUCAUAUAACAAAGAAGUAACCUUAUAACUGCUCUCUAGUCUGCCUUAUUUGUGUCAUAGAGUAAGAUAUUCCUUGAAAGCCCAUUAAGUGGAAUAGACUUUCUGAAAAUAAGAGUUCUUUACCUCAGUCCUCCUCUAAUUUGGUUGAGAGGAGGUAAUGAAAAUGGGGACAGGAUAAAAGGUGGCAACUAAAUUUAAAGCACAGAAGAAAUGAUUUCCUUCUAGCUAUGAGAAUAGUCAAAUUGAGCUUGCCAGGCUGUCUCAUUCCUAACAUGUAAUUCAUGAUUUAGCCACUAAAUUUCUAAGGAGAUCAUAAGAAAUUAAGAAAAACGUUUAAGUCUAGCCUCUGCGUGGUAGACAGGUAUGGGGAGGGAGAAUGCUUUUCCCCUCCCAGUAAUAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAUAGUUUUACUAGGUUUUCAUGGAUAAGUUUUUAAAUGUAAGACAGGAAAGGGAUCUAUUUGAUGUCUAUCUUCAGAUAUAUUGGCAGUUUUCCUUAAGCUAUUUAGUUCCUCAUCUGUUGCUUUUUCAUUUUGUAUACUGCAAGUUCCCAGGCAACUCGAAUUUGCAAACACAGCCAUGGAUACACUAUUUACCUUACAGUAGUUUCCUGGGAAUCUAAGUCUGGUUUUUGUUAUUCUUCCCUCCCCUCCACUGCAUAAUCAUGUAUAACUAGCAACAUUUAUGGUUAUAGGUUGAUUUCCUAAGUGUGGCUGAUGGUAGCCUCUAGUUUGAAGUGAGGGAAGAAUGAGUAGUCAGGAACUGGUCACUUUGAAUGUGGGAGGGAAGAUAUUCACGACAAGGUUUUCUACGAUAAAGCAGUUUCCUGCUUCUCGUUUGGCACGCAUGUUAGAUGGCAGAGACCAAGAAUUCAAGAUGGUUGGUGGCCAGAUUUUUGUAGACAGAGAUGGUGAUUUGUUUAGUUUCAUCUUAGAUUUUUUGAGAACUCACCAGCUUUUAUUACCCACUGAAUUUUCAGACUAUCUUAGGCUUCAGAGAGAGGCUCUUUUCUAUGAACUUCGUUCUCUAGUUGAUCUCUUAAACCCAUACCUGCUACAGCCAAGACCUGCUCUUGUGGAGGUACAUUUCCUAAGCCGGAACACUCAAGCUUUUUUCAGGGUGUUUGGCUCUUGCAGCAAAACAAUUGAGAUGCUAACAGGGAGGAUUACAGUGUUUACAGAACAACCUUCAGCGCCGACCUGGAAUGGUAACUUUUUCCCUCCUCAGAUGACCUUACUUCCACUGCCUCCACAAAGACCUUCUUACCAUGACCUGGUUUUCCAGUGUGGUUCUGACAGCACUACUGAUAACCAAACUGGAGUCAGGUAUUUUGUACUUUGCAGUAUUUCUCUUGUAUACCAGUUUGUGAUGUUUUCUCUAAAAACUUGAAGUUCCUCAGGCCUGUAACUUCUGGAAAAGAUGAUUAUUCAAAAUAAUGUUUUGGGGUAACCAGUGGAGUUGGGUAGAAUGACCAAAUAAUUAUUUUCCAAACUGGGAUACUUUUUAGAGUGAAAGGGGCUAUUAUUAGGUGGGACAAAAGGAAUAAAUGAAGACUGCCCAGAAAAAACUGAGACUAUGGACAUUCAAAUCAUGGGAGAAAAUAAUUUUGUAGAUUAUGUUCCAUUGCUAAUGAAUUUGACUUAGAAAAGAAUUGCCUUAUUUUUAAGAGAUUGUUUCAGUGGUUCACAUAAAGGCUCGCUCACUGGUUUCUCUUGAGUUCCUUACACACUAUAUAAGUUGUUCUUUCAGUUUUAUGAUUCAACUACUGUUUUUCCUUCAGCUGACUUUAUUUUUAAACACCCUUAAAGACAGAUAUAUCUCAUGGCAAAUUUGGUAUCCUGUUACAGCCUUGGCUCUUAAACAACUCAAAAUAUUGGGAUAGGCUGUCAGUAUGUUAAGGAUAGUUGCUCCUGAGUCAAUUCUUCACUUACUCCCUCUGUUGUUCUUGGCUGGAUCCUAACGCUGAUUUCCACUCUGCUGUCACAAACAUUUUUCCCCCCG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1821.27 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1958.56
Frequency: 0.0000
Diversity: 1418.58
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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