Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_005853.6

Sequence Length

2398 nt

GC Content

0.5897

AGCAUCUUGGCAGGACCUUUGCAAAGGCAAAAGCAGAGCCCCCCGGUGCAAAGAGCGAGGGGAAAAAAGAGAAAGCAGCAAGGGAGGGGAGGGGAGGGGAAAAAAAGCCCAGCUGGGGCGAGCGAGGCGCGCAGAGGAGCGGGCGCGGCGGUCGCAGCCGGAGGCGCGCGGGAAGCCAGCGAGGAGGCGCCGCGGGCCGGAGCCCCGGAGCCGGGGCCAGAGGAGCGGCGGCCCAGGGCAGCCAGAGGCCAGGUGCCCGCCCGCUCGCCCUCGCAGGGCGCCGCCCGGCUCGUUGGCGGCCGCGGCGCGGCGCGCCCCAUGCCCGUGUGUGGCCAUGUCCUAUCCGCAGGGCUACUUGUACCAGCCGUCCGCCUCGCUGGCGCUCUACUCGUGCCCGGCGUACAGCACCAGCGUCAUUUCGGGGCCCCGCACGGAUGAGCUCGGCCGCUCUUCUUCGGGCUCCGCGUUCUCGCCCUACGCUGGCUCGACUGCCUUCACGGCGCCCUCGCCGGGCUACAACUCGCACCUCCAGUACGGCGCCGACCCCGCGGCCGCCGCCGCCGCCGCCUUCUCCUCGUACGUGGGCUCUCCCUACGACCACACACCCGGCAUGGCGGGCUCCUUGGGGUACCAUCCUUACGCGGCGCCCCUGGGAUCGUACCCUUACGGGGACCCAGCGUACCGGAAGAACGCCACAAGGGACGCCACGGCUACCCUCAAGGCCUGGCUCAACGAGCACCGCAAGAACCCCUACCCCACCAAGGGCGAGAAGAUCAUGCUGGCCAUCAUCACCAAGAUGACCCUCACCCAGGUGUCCACCUGGUUCGCCAACGCGCGCCGGCGCCUCAAGAAAGAGAAUAAAAUGACGUGGACGCCGCGGAACCGCAGCGAGGACGAGGAAGAGGAGGAGAACAUUGACCUGGAGAAGAACGACGAGGACGAGCCCCAGAAGCCCGAGGACAAGGGCGACCCCGAGGGCCCCGAAGCAGGAGGAGCUGAGCAGAAGGCGGCUUCGGGCUGCGAACGGCUUCAGGGACCACCCACCCCUGCAGGCAAGGAGACGGAGGGCAGCCUCAGCGACUCGGAUUUUAAGGAGCCGCCCUCGGAGGGCCGCCUCGACGCGCUGCAGGGCCCCCCCCGCACCGGCGGGCCCUCCCCGGCUGGGCCAGCGGCGGCGCGGCUGGCGGAGGACCCGGCCCCUCACUACCCCGCCGGAGCGCCGGCGCCCGGCCCGCAUCCAGCCGCGGGCGAGGUGCCUCCGGGUCCCGGCGGGCCCUCGGUUAUCCAUUCGCCGCCUCCGCCGCCGCCUCCUGCGGUGCUCGCCAAGCCCAAACUGUGGUCUUUGGCAGAGAUCGCCACAUCGUCGGACAAGGUCAAGGACGGGGGCGGCGGGAACGAGGGCUCUCCAUGCCCACCGUGUCCCGGGCCCAUAGCCGGGCAAGCCCUAGGAGGCAGCCGGGCGUCGCCGGCCCCGGCGCCGUCACGCUCGCCCUCGGCGCAGUGUCCUUUUCCAGGCGGGACGGUGCUGUCCCGGCCUCUCUACUACACCGCGCCCUUCUAUCCCGGCUACACGAACUAUGGCUCCUUCGGACACCUUCAUGGCCACCCGGGGCCCGGGCCAGGCCCCACAACCGGUCCGGGGUCUCAUUUCAAUGGAUUAAACCAGACCGUGUUGAACCGAGCGGACGCUUUGGCUAAAGACCCGAAAAUGUUGCGGAGCCAGUCUCAGCUAGACCUGUGCAAAGACUCUCCCUAUGAAUUGAAGAAAGGUAUGUCCGACAUUUAACGCGGGCUGCGUCGGUCCCGGACUUUUCUAAUUUAUUAAAAACAUGGCCUUGGCAGUUAUUUUUCCAUCACCGAGAGAGAGAGACAGAGAGAGAAAAUAAACUACCCCUCCUAUUCAGAAGUUUAUAGUUUAUGGAGAUGGAUGACAUAAAAAUGUAAACAUCUCCACACAAAAAAAAAAAUGUCUUAACCAACCGAAAAGAAAAAUUAAAAAAGGAUUUGUAUUAAAUCUUAUUCUGUAUAUUUAAUGUAGCAUUUUUGUAUUUAAAUUGAUAAUUCAAUAUCUUUGAAGUAAAUUAUGAAAUCAAGACACCUGUACAGGCAUUUAAUGUUUUUUUGUAAUAUAAAUAUAUACAUUUGUGUUUCCCCCAAAACUGUUUCAUAGUUAAAAAAUACAAGUUUAAUUUAAUUUUUUACACCUAUUGAUUCUGCUGGGUAUGAGCUAAAGUAUUACAGAAAGGAAACAGGUUAUACUCUUAGAUUUAAAAAGUGAAAGAAACUGCAGGCGCCUUUGUAAAAUGCAAAAUAUUUAAUUAAAAGAGAUUUUAACAUAAUGAGAGCCACUCAUUACUUUUUAGAAGCCUCAAUAAACUGUCCAUUGCCUUGGUCAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-970.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1008.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 547.24

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

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Thermodynamic Ensemble Prediction

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